1 октября 1998 года В.В. Путин был введён в состав постоянных членов Совета безопасности РФ.
6 октября 1998 года Борис Ельцин своим указом внёс изменения в утверждённое им в прошлом году Положение о Федеральной службе безопасности. В частности, президент установил структуру руководства Федеральной службы. Оно состоит из председателя, двух первых заместителей председателя, шести заместителей — руководителей департаментов ФСБ, а также двух заместителей — начальников Управления ФСБ по Москве и Московской области и по Санкт-Петербургу и Ленинградской области. Образована коллегия в количестве 17 чел., в которую входят, помимо председателя и его заместителей, также и ряд руководящих работников ФСБ. Новое положение значительно поднимает статус руководителей Управления ФСБ по Санкт-Петербургу и Ленинградской области и по Москве и Московской области.
8 октября 1998 года Министр юстиции П. Крашенинников обратился в Генпрокуратуру с предложением возбудить уголовное дело по факту антиконституционных и антисемитских высказываний Макашова, прозвучавших на митингах 4.10 в Москве и 7.10 в Самаре.
12 октября 1998 года Специальная комиссия Госдумы по оценке соблюдения процедурных правил и фактический обоснованности обвинений, выдвинутых против президента РФ, в целом согласовала проект заключения о степени виновности Б.Ельцина в чеченских событиях 1994 — 1996 гг. Депутаты большинством голосов пришли к выводу о том, что есть основания считать обвинения обоснованными. Ранее аналогичные решения были приняты в связи с подписанием Беловежских соглашений и октябрьских событий 1993 г. (расстрел Белого дома).
19 октября 1998 года, завершив рассмотрение трех пунктов обвинения, выдвинутых против Бориса Ельцина (Беловежские соглашения, положившие конец существованию СССР, силовые действия против Верховного Совета в октябре 1993 г. и чеченская война), думская комиссия по импичменту отложила слушания. Тайм-аут попросили сами инициаторы импичмента. Председателю комиссии Вадиму Филимонову было передано заявление, подписанное Татьяной Астраханкиной, Анатолием Лукьяновым и Виктором Илюхиным, с просьбой об отсрочке рассмотрения оставшихся пунктов обвинения в связи с необходимостью сбора дополнительных материалов.
20 октября 1998 года по инициативе главы думского комитета по безопасности В. Илюхина на Совет Госдумы был внесён законопроект «О медицинском заключении о состоянии здоровья президента РФ — Верховного главнокомандующего Вооружёнными силами РФ Б.Н. Ельцина».
20 октября 1998 года Б. Ельцин прошёл «плановый медосмотр» в Центральной клинической больнице. Ему был сделан рентген. Было проведено обследование, позволявшее якобы сделать выводы о том, как глава государства выходит из простудного заболевания. Прохождение подобного рода обследования было запланировано заранее. Врачи считали, что простуда у президента завершилась и его состояние «нормальное». Пресс-секретарь сообщил, что после осмотра Борис Ельцин вернулся в резиденцию «Горки-9». Президент провёл несколько рабочих встреч, среди которых беседа с председателем Совета Федерации Егором Строевым.
26 октября 1998 года Кремль официально объявил, что консилиум врачей предложил президенту Ельцину воздержаться от поездки в Австрию. Вместо него рабочий визит в эту страну и переговоры с руководством Европейского союза должен был провести Е. Примаков. Трансформация визита весьма показательна в плане здоровья президента. Вначале визит был объявлен государственным (он может осуществляться лишь президентом и проходит 3 — 4 дня). Затем он был сокращён и назван рабочим. Под вопросом была следующие встречи Б. Ельцина с зарубежными лидерами в Москве, а также поездки за рубеж.
4 ноября 1998 года Госдума отклонила проект заявления «О недопустимости действий и высказываний, осложняющих межнациональные отношения в РФ». За одобрение заявления высказалось 107 депутатов, против — 121 (для пинятия решения в Думе необходимо минимум 226 голосов). Как заявил И.Кобзон, решение о принятии заявления было вызвано «конкретными антисемитскими выступлениями депутата Макашова». Отклонив подготовленный проект, депутаты решили поручить комитетам по делам национальностей и по безопасности подготовить другой вариант заявления на данную тему.
5 ноября 1998 года Конституционный суд России прекратил производство по делу о толковании тех статей Конституции, из которых следует, что президент РФ может занимать свою должность лишь два срока подряд. Что касается конкретно Бориса Ельцина, то его, как сказано в определении, в 1996 году рассматривали «как кандидата на должность именно на второй срок». Полномочный представитель президента в КС Михаил Митюков был удовлетворён решением суда прекратить дело, а представитель Госдумы депутат Алексей Захаров — указанием, что президент РФ» до выборов в июне-июле 1996 г. осуществлял свой первый срок и был в 1996 г. избран на второй срок подряд».
10 ноября 1998 года бывший первый вице-премьер России Борис Немцов заявил, что считает «не самым лучшим сценарием» вариант досрочных президентских выборов.
18 ноября 1998 года В.В. Путин вновь введён в новый состав постоянных членов Совета безопасности РФ.
19 ноября 1998 года состоялось первое заседание оргкомитета общественно-политической организации «Отечество».
19 ноября 1998 года в Санкт-Петербурге в подъезде своего дома убита депутат Госдумы РФ, сопредседатель федеральной партии «Демократическая Россия» Галина Старовойтова.
1 декабря 1998 года В.В. Путин вошёл с состав Межведомственной комиссии по оптимизации государственного оборонного заказа.
2 декабря 1998 года Госдума проголосовала за возвращение памятника Феликсу Дзержинскому на Лубянскую площадь.
2 декабря 1998 года Государственная дума приняла постановление «О медицинском заключении о состоянии здоровья президента РФ», подготовленное депутатами — членами Комитета по охране здоровья. За этот документ высказались 247 парламентариев, против — 33. Постановление предлагает генеральному директору Медицинского центра Управления делами президента в десятидневный срок дать медицинское заключение о состоянии здоровья Бориса Ельцина «на основании его медицинской карты».
7 декабря 1998 года Комиссия по импичменту президента Бориса Ельцина вынесла окончательное решение по 4-му пункту обвинений, выдвинутых против главы государства 257 депутатами Государственной Думы. Комиссия признала необоснованными предъявленные президенту обвинения в государственной измене в связи с развалом армии и снижением обороноспособности страны. Вместе с тем комиссия считает, что в действиях президента присутствовало злоупотребление должностным положением, что подпадает под ответственность 285-й статьи Уголовного кодекса. Через неделю комиссия будет рассматривать последний 5-й пункт обвинений, выдвинутых против президента и касающихся геноцида российского народа.
9 декабря 1998 года власти Ставропольского края и Дагестана без предварительного предупреждения силами правоохранительных органов полностью закрыли границы с Чечнёй. «Ингушетия также перекрыла все дороги, выставив посты республиканского МВД. Чеченская республика полностью блокирована со всех сторон».
13 декабря 1998 года А. Солженицын отказался принять орден Андрея Первозванного, которым его наградил Б. Ельцин. Он мотивировал свой поступок тем, что не может принять этот орден от власти, которая довела Россию до бедственного положения.