Действуя с 21 по 29 октября 1916 года в районе о. Кефкен – Босфор, «Тюлень» 23 октября захватила и уничтожила шхуну «Lutfi СеШ», обстреляла из орудий каботажный пароход «Tutsak». 27 октября у о. Кефкен подводная лодка захватила парусник «Sfatos» и привела его в качестве приза в Севастополь. 22 – 25 октября 1916 года подводная лодка «Морж» производила разведку побережья в районе Сакария – о. Кефкен. «Морж» 13 декабря 1916 года в районе м. Кара – Бурну безуспешно атаковала торпедами турецкие паромы «Ihsan» и «Sutludce», 21–30 декабря 1916 года подводная лодка «Нерпа» в устье р. Агве перехватила и обстреляла артиллерийским огнем каботажные паромы «Nusret» и «Eser-і Merhamet», которые вели на буксире по одной парусной барже. Оба парусника были брошены и уничтожены подводной лодкой.
В 1917 году Боевые действия Бригады Подплава Черноморского флота на коммуникациях противника свелись к одиночным выходам подводных лодок. С 3 по 7 января «Морж» обеспечивала у Босфора минную постановку, проводившуюся эсминцами и тральщиками. 23 января 1916 года «Морж» захватила и уничтожила в районе м. Мидия три шхуны. 2 марта 1916 года у о. Кефкен подводная лодка потопила шхуну №-268, но затем была обстреляна огнем береговой батареи. 6 марта 1916 года у Босфора «Нерпа» потопила одну шхуну. С 1 по 11 апреля 1916 года у Босфора патрулировала «Морж», потопившая в две шхуны. 11 апреля 1916 года «Нерпа» в районе Окне – Шары обстреляла буксирный пароход «ВеЬек» и буксируемый им барк. Поврежденному буксиру удалось уйти, а трехмачтовый барк был потоплен.
В последний Боевой поход «Морж» ушла из Севастополя вечером 27 апреля 1917 года, направившись на смену в районе Босфора подводной лодке «Кашалот». Посланные на поиски миноносцы захватили пленных которые показали что первого мая видели бой подводной лодки «Морж» с гидроаэропланами у р. Эрегли. Вследствие этого является предположение, что подводная лодка во время боя погибла. Вместе с подводной лодкой пропали без вести 42 подводника. 6 июня 1917 года в район восточнее Босфора выходила подводная лодка «Нерпа». С 15 по 27 июля 1917 года в район Босфора впервые после затянувшегося ремонта выходила подводная лодка «Тюлень». В конце июня «Тюлень» направлялась в Севастополь, но выскочила на песчаную отмель и вынуждена была возвратиться в Николаев. 18 июня 1917 года близ устья р. Мелен-Су потопила шхуну, через два дня – две шхуны у о. Кефкен, а 23 июля – еще 2 шхуны. 24 июня потопила каботажный пароход «Intizam». 1 августа 1917 года подводная лодка «Нерпа» ушла в Николаев, в нем была разоружена и поставлена в завод для проведения капитального ремонта, который затянулся на шесть лет.
Последний Боевой выход в море совершила подводная лодка «Тюлень» с 20 по 24 сентября 1917 года. Подводная лодка потопила у входа в Босфор парусник, а в ночь на 23 сентября 1917 года захватила пароход «Kozlu» и привела его в Севастополь в сопровождении двух вызванных для этого эсминцев.
Из числа строившихся для Черного моря новых подводных лодок тип «Лебедь», в Боевых действиях успела принять участие только подводная лодка «Гагара», вступившая в строй 20 июня 1917 года. «Гагара» дважды ходила к Босфору, потопила шесть парусников и вынудила выброситься на берег пароход «Vatan».
3 декабря 1917 года в силу подписанного между русским и германо-турецким морским командованием перемирия Боевые действия на Черном море прекратились.
В результате октябрьского переворота 1917 года в Петрограде Черноморский флот разделился на белых и красных, и перемешался, невзирая на приказы командования и проведение митингов. В конце концов, моряки Русского флота завладели остатками кораблей флота и всем, что полагалось для их эксплуатации, а красные, потопив у Новороссийска то, что досталось им, сошли на берег и, пополнив ряды пехотинцев, воевали на суше. На море наступило затишье.
В начале 1918 года вступила в строй подводная лодка «Буревестник». 14 января 1918 года подводная лодка «Нерпа» вошла в состав красных Морских Сил. В этом же году была введена в строй подводная лодка АГ-21 и в Николаеве спущена на воду подводная лодка АГ-22.