В документах комиссии отмечается, что распашка под пшеницу примерно 40 млн. гектаров целинных земель, существенно отличающихся по своим свойствам и требуемым методам обработки от сельхозугодий других районов СССР, приведет к постепенной и практической не поддающейся предотвращению деградации этих земель, к негативным изменениям экологической ситуации в обширном регионе страны и, соответственно, к резкому увеличению затрат по поддержанию плодородия целинных почв. Подчеркивалось, что временный эффект, который выразится в больших урожаях на целине, не превысит 2-3 года. Затем с помощью химических средств и увеличения объемов искусственного орошения можно будет добиваться лишь поддерживания уровня урожайности (т.е. уровня предыдущих 2-3 лет), но никак не дальнейшего ее роста.
Ввиду особенностей почвы и климата в целинных районах урожайность там, как отмечалось комиссией Лысенко-Немчинова, будет в 2-3 раза ниже урожайности в традиционных сельхозрайонах СССР (Украина, Молдавия, Северный Кавказ, Центрально-Черноземный регион, ряд районов Поволжья). Искусственное же наращивание ее за счет химикатов и орошения приведет к неустранимому загрязнению и засолению почв, а значит - к быстрому распространению эрозии, в том числе на естественные водоемы в "целинном" регионе. Такая тенденция предопределит, в частности, ликвидацию животноводства как сельхозотрасли в регионе от Волги до Алтая. В первые 5-6 лет запасы плодородного слоя почвы, гумуса, на целинных землях сократятся на 10-15 %, а в дальнейшем этот показатель составит 25 - 35 % в сравнении с "доцелинным" уровнем.
Для искусственного орошения могут потребоваться многокилометровые отводы от Волги, Урала, Иртыша, Оби и, возможно, Арала и Каспия (с предварительным обессоливанием воды этих артерий). Это может привести к негативным изменениям в водохозяйственном балансе многих регионов страны и резко ухудшит водообеспечение сельского хозяйства этих регионов. А снижение уровня Волги, Урала и других водных артерий и водоемов отрицательно скажется на всех отраслях экономики регионов, примыкающих к целинным землям, особенно на рыбном хозяйстве, судоходстве и электроэнергетике.
Если же стремиться к увеличению урожайности зерна на целинных землях в условиях деградации целинных почв и роста дефицита воды, то, наряду с постоянным наращиванием объемов химизации почвы, придется целиком переориентировать нижнее и, частично, среднее течение рек Иртыш, Волга, Урал, Амударья, Сырдарья и Обь на северный Казахстан и примыкающие к нему районы. Следовательно, придется со временем изменить русла и течение вышеназванных рек. Практически же северная часть Каспия и Арал будут обречены на высыхание, а последствия "преобразования" природы в Сибири, на Урале, в Казахстане и других целинных районах непредсказуемы и неустранимы.
В документах комиссии Лысенко-Немчинова отмечалось также, что совокупность вышеупомянутых последствий приведет через 7-10 лет к "наступлению" эрозии и деградированных земель в соседние с целиной регионы, в первую очередь - в Поволжье, на Северный Кавказ и Центрально-Черноземные области. Затраты же на предотвращение данной тенденции будут соответствовать примерно троекратному увеличению объемов капиталовложений, направляемых в сельское хозяйство в течение 4-ой пятилетки (1946 -1950 гг.).
Что ж, прогнозы комиссии Немчинова-Лысенко сбылись благодаря "целинному рвению" Хрущева и его сподручных.
Однако доводы и рекомендации комиссии в начале 1950-х годов были приняты во внимание, и "революционное" освоение целины при жизни Сталина не состоялось. Но комиссия не отвергла в принципе идею освоения новых земель, в том числе целинных. Для чего, по мнению ее участников, требовались принципиально новые агротехнические методы, в том числе развитие селекционной работы, учитывающей как специфику природно-климатических условий конкретных регионов, так и особенности воздействия химических удобрений на те или иные виды сельхозрастений (подробнее см. Т.Д. Лысенко. "Агробиология", М., 1949; В.И. Куликов. Коммунистическая партия в борьбе за дальнейшее развитие сельского хозяйства СССР, М., 1951 г.).
Освоение новых земель, как подчеркивалось в 1947 -1952 гг. в решениях ЦК партии и Совета Министров, а также ВАСХНИЛ, должно осуществляться на принципиально иной технологической и научной основе с учетом прогрессивных методов повышения урожайности злаков, продуктивности животноводства и плодородия почв без нанесения им генетического и экологического ущерба. По всей стране создавались станции и другие научные лаборатории, главная задача которых состояла в поиске и апробации агротехнологических методов, учитывающих специфику конкретных сельхозземель и природно-климатических условий (см. например, Т.Д. Лысенко. "Агробиология"; С. Беликов. Послевоенное развитие сельского хозяйства СССР; Е.С. Осликовская. Передовой опыт мастеров социалистического земледелия, М., 1949).
ЦК партии и правительство в своих постановлениях подчеркивали, что недопустимо подменять хозяйственное (отраслевое) руководство экономикой партийным, что эта тенденция способствует распространению некомпетентности и сокрытию "руководящими кадрами" собственных просчетов и проблем отраслей, в том числе сельскохозяйственных. В 1946 -1952 годах во всех отраслях экономики были созданы межведомственные комиссии по проверке профессионального уровня и компетентности партийных и хозяйственных кадров - курировали такую работу Мехлис (тогдашний председатель Госконтроля СССР). Андреев и Сабуров (председатель Госплана Союза в 1949 - 1953 гг.).
Тем не менее, инициаторами "преобразования" целины, как и последующего распространения посевов кукурузы, вплоть до Карелии и побережья Белого моря (!) были Хрущев и подчинявшийся ему партийный аппарат в центре и на местах.
В 1946 г. были введены жесткие санкции за разбазаривание и запущение сельскохозяйственных земель, за некомпетентное руководство сельскохозяйственными предприятиями и нарушения Устава сельхозартели. Уже к середине 1947 г. колхозам и совхозам было передано или возвращено почти 5 млн. гектаров земель, 150 тыс., голов скота и много другого имущества, в том числе 28 тыс. тракторов и комбайнов.
Пленум ЦК КПСС в марте 1947 г. и соответствующие его решениям постановления Совмина провозгласили в качестве приоритетной задачи в сельском хозяйстве - развитие агрономической науки в сельскохозяйственных регионах и быстрое внедрение ее достижений в опытное и серийное (постоянное) сельхозпроизводство. На эти цели было выделено свыше 50 % общего объема сельскохозяйственных капиталовложений в 1947 - 49 годах.
В 1947 г. были начаты реконструкция мелиоративных систем, орошение значительных сельскохозяйственных массивов в Средней Азии, на юге Казахстана и Украины, на Северном Кавказе и в Азербайджане. Начались также работы по осушению болот на юге Молдавии и в Полесье (Белоруссия). Подчеркивалось, что результаты агробиологических исследований и проводимых работ могут пригодиться для освоения обширных территорий, пока недостаточно используемых в сельском хозяйстве из-за экологических причин и отсутствия соответствующих технологий.
В развитие решений и мероприятий 1947 года, в октябре 1948-го Совмином был утвержден рассчитанный на 10-15 лет "план создания системы государственных защитных полос, развития защитных лесонасаждений, по закреплению и облесению песков, развитию орошения, строительству прудов и водоемов". За первые 2 года реализации этого плана была проведена посадка полезащитных лесных полос площади в 1,4 млн. гектаров, а количество оросительных водохранилищ и каналов возросло почти в 2,5 раза в сравнении с 1947 годом.