Важнейшим опорным пунктом противника на побережье Балтийского моря была крепость Кольберг. Ее осада продолжалась, с перерывами, почти полтора года. Важнейшую роль в осаде и взятии крепости сыграл флот, поддерживающий осадный корпус генерала П.А. Румянцева. Корабли вели массированный обстрел крепостных бастионов, высаживали многочисленные десанты. Корабельная артиллерия обрушила на крепость более 1500 трех- и пятипудовых бомб, свыше 11 тыс. ядер и других снарядов. В осаде Кольберга впервые были применены универсальные орудия “единорог”, стрелявшие не только ядрами, но и бомбами, а также зажигательными снарядами (брандскугелями), что значительно повышало эффективность артиллерийского огня. Падение Кольберга решило исход борьбы за Померанию в целом и создало благоприятные предпосылки для успеха в войне с Пруссией. Летом 1757 г. русские войска, поддерживаемые со стороны моря восемью кораблями Балтийского флота, взяли Мемель (Клайпеда), в начале следующего года — Кенигсберг, а затем была занята вся Восточная Пруссия. В сентябре 1760 г. войска генерала З.Г. Чернышева вступили в Берлин.
По штату 1757 года было определено содержать в составе флота 1 — 100-пушечный корабль, 8 — 80-пушечных кораблей (1 ранг), 15 — 66-пушечных кораблей (2 ранг), 3 — 54-пушечных корабля (3 ранг), 6 — 32-пушечных фрегата и более 150 других кораблей и галер. Это была сила, которой возможно было удержать господство на Балтике и с которой приходилось считаться всем европейским флотам.
К началу царствования Екатерины II (1762 год) военный флот состоял из 31 линейного корабля, 11 других кораблей и 99 галер. Однако состояние флота не соответствовало тем грандиозным задачам, которые ему предстояло выполнять. Желая быть “второю после первого Петра”, Екатерина II прилагает усилия к тому предприятию, которое не удалось довести до конца на Азове великому реформатору. "Значительное усиление России немыслимо без действий Русского военно-морского флота” — эти слова Екатерины II блестяще подтвердила история. Императрица привлекает к управлению Морским ведомством в свои помощники по вопросам флота опытных адмиралов С.И. Мордвинова и Г.А. Спиридова. Срочно были приняты меры по восстановлению флота в виде подготовки личного состава и строительства новых кораблей. Для повышения уровня командного состава императрица, по примеру Петра Великого, посылает ряд морских офицеров за границу. Сознавая значение военно-морской силы, Екатерина II считала необходимым иметь на Балтике флот, не только равносильный каждому из соседних флотов, но чтобы по линейным кораблям “оные и превосходить мог”
Во второй половине 18 века Россия начала вести ожесточенную борьбу за выход в Черное и Средиземное моря, а также продолжала укреплять свои позиции на Балтийском море. Поэтому численный состав флота в этот период его развития в основном определялся двумя факторами: угрозой со стороны Турции на Черноморье и Швеции — на Балтике. В законодательном порядке количественный и качественный состав флота определялся Штатным положением, разрабатываемым Адмиралтейств-Коллегией и утверждавшимся главой государства.
Осенью 1768 г. Турция, подстрекаемая Францией и Австрией и воспользовавшись незначительным пограничным инцидентом с запорожскими казаками, снова объявила войну России.
Для облегчения действий сухопутных войск на Дунайско-Крымском театре войны, а также с целью оказания помощи балканским народам, восставшим против турецкого ига, Екатерина II послала пять балтийских эскадр в Средиземное море. Это была первая морская экспедиция из трех, вошедших в историю под названием «Архипелагских экспедиций» русского флота.
Общее руководство российскими морскими и сухопутными силами в этом районе осуществлял граф А.Г. Орлов. Успешные действия кораблей и высаженных с них десантов позволили овладеть несколькими турецкими крепостями и оказать существенную помощь поднявшим восстание грекам и албанцам.
24-26 июня (5–7 июля) 1770 г. произошло крупное сражение в районе Чесменской бухты между объединенными русскими эскадрами и турецким флотом.