И вот явился Путин. Человек, который не только держал свечку, но и привычно крестился правой рукой справа налево. А вскоре просочилась информация о том, что у него даже есть духовник! Наместник московского Сретенского монастыря архимандрит Тихон (Шевкунов), к тому же ещё православный писатель и кинематографист. С Владимиром Владимировичем его познакомил генерал-лейтенант КГБ в отставке Николай Сергеевич Леонов. Когда пройдут выборы 26 марта 2000 года, архимандрит Тихон признается, что голосовал за Путина:
— Да, впервые в жизни. Я никогда не голосовал ни за Брежнева, ни за Ельцина. Я проголосовал за Владимира Путина, потому что знаю его лично. Путин — человек верующий, православный. А для пастыря отдать голос — всё равно что поручиться... Скажу одно: Путин — человек искренне верующий и знающий Бога. Он сам разобрался в очень глубоких вопросах бытия...
Впрочем, новый президент России в том же 2000 году на вопрос ведущего телеканала CNN Ларри Кинга: «Верите ли вы в высшие силы?» — ответит уклончиво:
— Я верю в людей. Верю в добрые намерения. Верю в то, что все мы явились в этот мир делать добро.
С тех пор его недоброжелатели не перестают воспринимать данное высказывание как отречение от Господа.
С Предстоятелем у него быстро сложились добрые отношения. Он сразу определил для себя важность союзничества с высшим церковным иерархом, а в чём-то даже не только союзничества, но и покровительства. И Патриарх это почувствовал. До выборов президента было не так много времени, и он сразу стал подчёркивать свою симпатию именно к этому кандидату.
Вторая чеченская война стала для Путина путёвкой в президентство. В августе 1999 года чеченские боевики, которых возглавлял Шамиль Басаев, предприняли попытку присоединить к Чечне Дагестан для создания единого сильного антироссийского фронта. Руководство по ведению военных действий со стороны России полностью легло на Путина как на секретаря Совета безопасности России. Он фактически отменил Хасавюртовские соглашения. 23 сентября начались бомбардировки Чечни и её окрестностей, а на следующий день Владимир Владимирович произнёс свою знаменитую фразу:
— Мы будем преследовать террористов везде. В аэропорту — в аэропорту. Значит, вы уж меня извините, в туалете поймаем, мы в сортире их замочим, в конце концов. Всё, вопрос закрыт окончательно.
Выбитые из Дагестана боевики отступили в Чечню, и в октябре федеральные войска начали наземную операцию уже на чеченской территории, взяли Гудермес, в декабре — Аргун, Урус-Мартан, Ханкалу и начали осаду Грозного. В январе 2000 года бандитов выбили из ещё одного важного стратегического пункта — райцентра Ведено.
Церковь во главе с Патриархом Алексием II полностью поддержала действия российского руководства в Чечне. Бойцам отсылалась большая гуманитарная помощь. В отличие от Первой чеченской войны солдаты и офицеры охотно надевали нательные кресты, образки, читали духовную литературу. Многие, прежде чем идти в бой, принимали таинство крещения.
В конце января 2000 года в Гудермесе под лозунгом «55 лет Победы. Современная армия — народный дух» состоялся выездной пленум Союза писателей России, поставивший целью восстановление писательской организации Чечни, упразднённой в начале девяностых. Святейший Патриарх благословил председателя Союза писателей России Валерия Ганичева на это благое дело и выступил с обращением к участникам пленума:
— Вы собрались на Кавказе, где гремят выстрелы, где горят сёла и города, где гибнут люди. Вы собрались там, где наша армия, исполняя свой долг, борется с бандитами, взрывающими дома и убивающими мирных жителей, пытающимися расчленить Отечество, отторгая от него земли, входящие в наше государство десятки и сотни лет. Эти бандиты похищают женщин, детей и стариков, граждан нашей страны и иностранцев. Они пытают и убивают ни в чём не повинных людей. Они превратили землю Чечни в средоточие средневекового вандализма, в темницу, куда пытаются заключить весь чеченский народ, всех людей, попадающихся им на пути. На территории нашей страны нет противостояния Православия и ислама. Однако новоявленные варвары решили прикрыть свою разбойничью деятельность религиозными лозунгами. Очаг бандитизма, безусловно, должен быть потушен... Русские писатели, как и русские воины, считали жертвенность служения стране и народу естественным условием жизни... Будем помнить, что армия сегодня сражается не с чеченским народом, а с бандитами, и это должен понять каждый солдат, каждый офицер и каждый житель Северного Кавказа... Верю, что писатели достойно продолжат традиции уважения и взаимопонимания между народами, принесут слово мира и надежды на Северный Кавказ и многострадальная чеченская земля снова будет цвести и плодоносить на благо всех людей, её населяющих.