С президентом Путиным Святейший связывал большие надежды, ему хотелось видеть в нём тоже христианина и оптимиста. И такого же деятельного, как он сам. В конце октября он встречался с ним в Кремле и видел, что президент России относится к Предстоятелю Церкви не так, как предыдущий — с благодушной барской иронией, а с настоящим уважением, почтением, ищет поддержки и благословения. В обстановке президентского кабинета бросалась в глаза одна деталь — средняя полоса государственного флага, которая на заре ельцинской эпохи отличалась светло-голубым либеральным цветом, а затем слегка потемнела, теперь была тёмно-синей, почти чёрной. Флаг утратил легкомысленность и обрёл благородство.
На встрече с Путиным Святейший, помимо других вопросов, затронул тему взаимоотношений с зарубежниками, и вскоре Владимир Владимирович в ходе своего визита в Америку передаст митрополиту Лавру приглашение посетить Россию.
20 ноября 2001 года исполнилось пятьдесят пять лет митрополиту Смоленскому и Калининградскому Кириллу. Поздравляя его после литургии в храме Троицы Живоначальной в Хорошеве, Патриарх сказал о тех годах, которые они шли рука об руку:
— Все эти годы Вы с честью и достоинством осуществляете своё служение, являясь ближайшим и надёжным помощником Предстоятеля Русской Православной Церкви.
Всемирный Русский Народный Собор — общественный форум, на который съезжаются все люди, неравнодушные к судьбе России, ведут споры, выражают свои главные мысли, предлагают идеи, вырабатывают направления деятельности государства и общества на ближайшее время. С самого дня его основания в 1993 году Святейший Патриарх Алексий II являлся его бессменным главой, а заместителем — председатель Союза писателей России Ганичев.
В 2001 году VI Всемирный Русский Народный Собор проходил в зале Церковных Соборов храма Христа Спасителя на тему «Россия: вера и цивилизация. Диалог эпох». До этого глава государства ни разу не удостоил своим посещением форум, носящий столь громкое наименование. Он ограничивался лишь приветствиями, которые кто-то писал вместо него. Путин приятно удивил, явившись на первый Собор, проходивший при его президентстве. Он показал: я — с русским народом! Предстоятель обратил на это внимание присутствующих, открывая 13 декабря VI Всемирный Русский Народный Собор.
Сразу по окончании Собора, 15 декабря, в том же зале Церковных Соборов храма Христа Спасителя состоялось очередное ежегодное заседание Епархиального собрания Москвы. В своём обращении к пастве Предстоятель говорил о главных радостных событиях уходящего года, о расширении епархий и умножении церковной жизни, о пастырских визитах и светлых встречах с людьми России, о Москве, в которой уже действовало пятьсот храмов и восемь монастырей, о том, насколько ближе стала власть к Церкви с приходом Путина, об увеличении армии православной молодёжи. Предстоятель высказал очень важную мысль относительно современного состояния мира:
— Мы живём в трудную эпоху, когда борьба добра и зла, борьба за православную веру в Истинного Бога, за христианские духовные ценности достигла чрезвычайной остроты. Христианская жизнь есть брань с духами злобы поднебесной, но кажется, что в наше время зло вышло из подполья и бесстыдно заявляет о своей победе над добром. Западный мир без покаяния и скорби сам именует себя постхристианским. Отречение от Христа и Его учения стало фактом для многих народов, а те, кто ещё именует себя христианами, в действительности часто носят это имя формально и недостойны его... В результате изменения общественного строя и экономических отношений в последнее десятилетие произошло резкое расслоение общества на сверхбогатое меньшинство и бедное большинство. Возросла социальная несправедливость. Более того, изменилась сама духовная атмосфера, менталитет населения. Главным мерилом и критерием всё больше становятся деньги. Происходит коммерциализация всех сторон жизни. Люди становятся прагматичнее, жёстче, циничнее. Явление это не новое в истории, но масштаб его сейчас огромен. Истоки этого, по учению православных подвижников, в неправильном отношении к богатству и вообще ко всему материальному. Завистливый и жадный человек всегда видит то, что есть у других и чего нет у него. Отсюда неудовлетворённость и погоня за достижением материальных благ. При этом человек нередко пренебрегает голосом своей совести и моральными запретами. Духовный человек поступает наоборот. Он не сосредотачивается на том, чего у него нет, не ропщет, не завидует, а бывает доволен и благословляет Бога за то, что у него есть. Вспомним притчу о мытаре и фарисее...