По мнению многих исследователей, враждебность к французской армии со стороны народа на Пиренейском полуострове имела главным образом не политический, а экономический, социальный и культурный характер. И уж, во всяком случае, народное сопротивление в Португалии никак не было связано с верностью династии Браганса.
Королевская семья, бежавшая в Бразилию, воспринималась здесь как бросившая своих несчастных подданных на милость завоевателей.
И еще — французам так и не хватило времени, чтобы интегрировать Португалию в наполеоновскую империю, как они поступали с остальными своими завоеваниями.
Итак, летом 1808 года в Португалии вспыхнуло анти-французское восстание. Испанские полки из дивизий генералов Таранко, Караффа и Солано, входивших в состав армии генерала Жюно, поддержали восставших, побросали занимаемые позиции и самовольно начали уходить в Испанию. При этом профранцузски настроенный генерал Солано был убит в Кадисе разъяренной толпой испанских фанатиков.
В Опорту испанским генералом Доминго Баллестой, заменившим умершего генерала Таранко, был арестован французский дивизионный генерал Кенель с его штабом, только что по приказу Жюно прибывший в город для того, чтобы возглавить оставшихся без командира «союзников».
В этой сложной обстановке Жюно проявил решительность и принял очень рискованное на первый взгляд решение разоружить все находившиеся в Португалии испанские войска. Решение это было частично выполнено, что произвело на не отличавшихся особой храбростью португальцев сильное впечатление, но оно уже ничего не могло изменить в целом. Курьеров Жюно перехватывали, все сообщения с Францией были прерваны.
Все чаще и чаще между отдельными французами и местными жителями происходили ссоры, при которых озлобление, разгораясь в яркую вспышку гнева, заканчивалось смертельными ударами португальского кинжала.
И на самого Жюно в Лиссабоне во время традиционного праздника Иисуса Христа готовилось покушение, которое, однако, было предотвращено.
В северной провинции Траз-уш-Монтиш в то время еще полковник Франсишку да Силвейра 6 июня возглавил восстание в долине реки Доуру, генерал Мануэл Жозе Гомиш де Сепулведа 9 июня поднял восстание в городе Браганса, полковник Лопиш де Соуза — на юге страны в Ольяне. При этом генерал де Сепулведа провозгласил реставрацию в Португалии власти бежавшего в Бразилию принца-регента.
11 июня 1808 года генерал Жюно обратился к португальцам с обращением:
«Португальцы!
После шести месяцев спокойствия вы рискуете увидеть мир в королевстве нарушенным из-за все возрастающего возмущения в испанских войсках, которые вошли в вашу страну для того, чтобы ее разделить. После того как 1 февраля я от имени Императора объявил, что начинаю правление во всей Португалии в целом, испанцы начали вступать в разногласия со мной. События в Испании, восстания в нескольких провинциях способствовали тому, что различные части испанских войск начали дезертировать. Начались провокации и насилия в отношении моих солдат. <…> Спокойствие было нарушено, а я вынужден был защищаться от войск, входивших в состав моей армии; я разоружил их. <…> Португальцы, я удовлетворен вашим положительным настроем, продолжайте доверять мне. Я даю вам слово, что буду защищать вашу страну от любого нашествия, от любой попытки разделения. Если придут англичане, мы вас защитим. Некоторые батальоны вашей милиции, а также полки, которые остались в Португалии, войдут в состав моей армии, чтобы защищать ваши границы; они научатся воевать, а я буду счастлив на практике передать несколько уроков, полученных от Наполеона, я научу вас побеждать».
Генерал Жюно с оставшейся в его распоряжении малочисленной французской армией принялся активно подавлять антифранцузские выступления. Прежде всего Жюно сформировал два отряда примерно по 4 тысячи человек под командованием генералов Луазона и Авриля. Первый был направлен на север страны в район Альмейды, второй — на юго-восток в сторону Кадиса. Это было все, чем он располагал; остальных ему едва хватало для несения гарнизонной службы.
Совершив решительный марш-бросок, генерал Луазон вступил в Альмейду. Пробыв там несколько дней и существенно усилив гарнизон крепости, 17 июня 1808 года с двухтысячным отрядом он вышел из Альмейды, а 19 июня подошел к городу Ламегу, пересек реку Доуру и атаковал восставших на ее правом берегу у деревни Пезу-да-Регуа.