Пока «Франклин» и «Белло Вуд» горели, еще 2 самоубийцы атаковали авианосцы, спикировав на «Энтерпрайз» и «Сан Хасинто». Оба были сбиты, хотя один горящий японец проскочил всего в 15 футах от забитой самолетами полетной палубы «Энтерпрайза».
Оба поврежденных авианосца в сопровождении эсминцев ушли на Улити, откуда отправились на ремонт в Соединенные Штаты.
Остатки Оперативной Группы 38.4 последовали за поврежденными кораблями на Улити, оставив у Филиппин только одну оперативную группу. Когда большая часть Оперативного Соединения 38 ушла, генерал МакАртур передал адмиралу Хэлси:
«Я шлю горячую благодарность и признательность вашим великолепным соединениям за прекрасную поддержку и помощь. Они сделали возможной операцию у Лейте. Мы так долго воевали вместе с вами, что привыкли и ожидали от вас блестящих успехов. Но вы превзошли самые смелые ожидания. Мы все ощущаем полную уверенность и спокойствие, когда вы вступаете в бой, поддерживая нас».
Последний день октября 1944 года застал 3 оперативные группы на якорной стоянке Улити. Авианосцы контр-адмирала Богана действовали возле Лейте, пока остальные отдыхали и пополняли запасы. Во время короткой стоянки на Улити Быстроходное авианосное соединение получило нового командира в лице вице-адмирала МакКейна, сменившего вице-адмирала Митчера. В свою очередь, контр-адмирал Альфред Монтгомери стал командиром Оперативной группы 38.1. Адмирал Митчер отбыл в Пирл-Харбор, а оттуда в Соединенные Штаты на короткий отдых. Он вернулся на авианосцы в начале 1945 года, когда адмирал Спрюэнс сменил адмирала Хэлси на посту командующего 3/5-м Флотом.
Для быстроходных авианосцев передышка оказалась недолгой. В последние дни октября камикадзэ брали высокую пошлину с американских кораблей за вход в залив Лейте. Японское командование продолжало перебрасывать на Филиппины все новые самолеты. Силы ВВС на Лейте были еще слишком слабы, и 2 авианосные группы были снова посланы к Филиппинам, чтобы помочь кораблям адмирала Богана. Оперативная Группа 38.4, ослабленная уходом «Франклина» и «Белло Вуда», осталась на Улити.
Адмирал Хэлси объединил 3 авианосные группы и повел их на север, чтобы атаковать Лусон. По пути соединение было атаковано японской подводной лодкой, которая попала торпедой в легкий крейсер. Поврежденный корабль был вынужден вернуться на Улити.
Авианосные самолеты атаковали Лусон 3 ноября. Из-за угрозы камикадзэ вице-адмирал МакКейн оставил большую часть истребителей в составе воздушного патруля, и бомбардировщики улетели с минимальным сопровождением. Сопротивления в воздухе почти не было. В течение 4 дней американские самолеты бомбили и обстреливали цели на Лусоне, в том числе и японские корабли в Манильской бухте. Пилоты заявили, что уничтожили 439 самолетов, в основном на земле. Были потоплены японский тяжелый крейсер, несколько мелких военных кораблей, танкер и торговое судно. Оперативное Соединение 38 потеряло 25 самолетов в боях, еще 4 разбились при авариях. Погибли 18 летчиков. Флагманский корабль Оперативного Соединения 38 авианосец «Лексингтон» стал четвертым американским авианосцем, пострадавшим от камикадзэ. 6 ноября 4 «Зеро», ускользнув от воздушного патруля, атаковали его. 3 самолета были уничтожены зенитным огнем, но четвертый врезался в правый борт «Лексингтона». Взрыв и пожары убили 50 человек и ранили еще 132, однако авианосец сохранил ход и продолжал полеты. Тушение пожаров заняло 20 минут.
Приняв последние самолеты после атак 6 ноября, Оперативное Соединение 38 вышло из радиуса действия японских самолетов с Лусона, чтобы заправиться со своей танкерной группы. Оперативная Группа 38.2 контр-адмирала Богана с поврежденным «Лексингтоном» ушла на Улити, а «Уосп» с вице-адмиралом МакКейном на борту ушел на Гуам, чтобы принять новую авиагруппу. Поэтому контр-адмирал Шерман, державший флаг на «Эссексе» принял командование Оперативным Соединением 38, состоявшим из оперативных групп 38.1, 38.2 и 38.4. Последняя группа только что вернулась с Улити. До полуночи 10 ноября все было спокойно, но тут адмирал Хэлси сообщил с Улити, что замечено соединение японских линкоров и крейсеров, идущее к заливу Лейте. Оперативное Соединение 38 повернуло к Филиппинам и пошло навстречу сильным волнам со скоростью 26 узлов, чтобы к рассвету выйти в точку взлета самолетов. 11 ноября в 6.00 взлетела разведывательная группа. Японские линкоры она не нашла, но обнаружила войсковой конвой, следующий в бухту Ормок на западном побережье Лейте. Данные немного различались, но летчики сообщали о 3 – 5 транспортах в сопровождении 6 эсминцев. Войсковые транспорты с воздуха прикрывали до 40 японских истребителей. Бой был жестоким, так как Оперативное Соединение 38 подняло в атаку 347 самолетов. Когда все закончилось, выяснилось, что все японские транспорты и 4 эсминца потоплены, а 16 самолетов сбиты. Американцы потеряли 9 самолетов, в основном от зенитного огня.