В июне «Рейнджер» стал шестым американским авианосцем, подвергшимся облету. 6 реактивных бомбардировщиков пролетели рядом с кораблем, когда он шел в 330 милях к востоку от Японии. В 1963 году советские самолеты совершили 14 облетов американских авианосцев. В 1964 году количество облетов упало до 4. Советы вернулись к более реалистичной практике посылки нашпигованных электроникой траулеров и эсминцев для преследования американских авианосцев во время учений флота. Однако в последние годы советские самолеты регулярно пролетают над американскими авианосцами. В 1968 году, когда турбореактивный Ту-16 «Бэджер» пролетал рядом с «Эссексом», крыло самолета коснулось воды, он разбился и сгорел. В это время противолодочный авианосец действовал у норвежского побережья. Корабль повреждений не получил.
Более серьезному испытанию авианосцы подверг МакНамара. На 1964 финансовый год не была утверждена постройка ни одного ударного авианосца. Представляя конгрессу оборонный бюджет 30 января 1963 года, МакНамара заявил: «В порядке эксперимента каждые 2 года будет закладываться 1 ударный авианосец с обычной машинной установкой. Последний такой авианосец был включен в бюджет 1963 финансового года (CVA-67), поэтому следующий будет заложен в 1965 году, а очередной — в 1967 году».
Затем 22 февраля 1963 года МакНамара потребовал, чтобы флот представил обоснования содержанию в строю 15 ударных авианосцев и строительству новых. Он подверг аргументы анализу, сравнивая корабли с базовой авиацией на основе критерия «стоимость-эффективность». Ударные авианосцы не имели первостепенной важности в американских стратегических наступательных программах, так как резко увеличилось количество баллистических ракет. К середине 1963 года уже имелось более 400 баллистических ракет с ядерными боеголовками, в том числе 144 ракеты «Полариса» на 9 атомных подводных лодках. К концу года предполагалось иметь почти 600 ракет.
Вице-адмирал Шойх был назначен начальником секции изучения эффективности авианосцев, а контр-адмирал Тэрнер Ф. Колдуэлл стал начальником секции изучения эффективности морской ударной авиации. Они должны были оправдать содержание 15 (или более!) ударных авианосцев. Контр-адмирал Джон Б. Колвилл возглавил секцию изучения эффективности корабельных атомных машинных установок, в том числе и авианосных.
В начале 1962 года военно-морской министр и начальник штаба ВМФ запросили средства на постройку в 1963 финансовом году авианосца с обычной машинной установкой, так как выяснилось, что атомный авианосец будет на 1/3 – ½ дороже. Кроме того, они чувствовали, что требуется время, чтобы полностью оценить характеристики первых атомных кораблей (авианосец «Энтерпрайз» и крейсер УРО «Лонг Бич», вошедшие в строй в 1961 году). Основываясь на опыте действий этих кораблей, в 1963 году флот выдвинул предложение, чтобы CVA-67 и вообще все военные корабли водоизмещением более 8000 тонн получили атомную машинную установку.
Отчет об изучении вопроса об атомной машинной установке для авианосца был представлен МакНамаре 20 апреля 1963 года. Министр сразу отверг его. Он охарактеризовал выводы как «интуитивные», а не «вычисленные». МакНамара объяснил командованию флота, что отчет не смог показать значение увеличения эффективности, которое может быть достигнуто атомными кораблями. Отказ МакНамары заставил флот собрать детальные данные об операциях обычных и атомных кораблей в различных районах мира, при различной интенсивности операций, в различных возможных ситуациях. Флот хотел продемонстрировать значимость увеличения боевой эффективности, чтобы оправдать увеличение стоимости машинной установки.
Вторая попытка ВМФ была предпринята 12 августа. МакНамара получил новый отчет. Он тоже был отослан назад для доработки. Пока ожидалось прибытие пересмотренного отчета, 9 октября министр обороны сообщил командованию ВМФ, что он против установки атомного реактора на CVA-67, и заказал постройку корабля с обычной машинной установкой. МакНамара объяснял свое решение желанием избежать дальнейших задержек с постройкой. Он также сообщил, что это не предрешает судьбы атомных машинных установок на будущих кораблях.