Кэннон сумел дать палате представителей достаточно оснований, чтобы исключить авианосец из оборонного бюджета. Однако сенат, традиционно более симпатизирующий флоту, потребовал у президента не 260 миллионов долларов, а на 100 миллионов больше, чтобы обеспечить кораблю атомную машинную установку. Было принято компромиссное решение — выделить 35 миллионов долларов для начала строительства атомного авианосца. Однако президент Эйзенхауэр, противившийся широкому распространению атомных двигателей, отказался выделить флоту эти деньги.
Атомная машинная установка стала главным предметом нового спора вокруг авианосцев. Политики заявили флоту, что требуемые им 130 миллионов долларов на атомную силовую установку не окупают получаемых преимуществ. Руководитель программы создания атомного двигателя для ВМФ вице-адмирал Риковер заявил конгрессу, что это «колоссальная глупость». Пояснив, что говорит от себя лично, а не от имени флота, адмирал Риковер добавил, что выделять средства на авианосец, ходящий на нефти и устаревший еще до закладки, то же самое, что «приобрести сегодня дизельную подводную лодку». (Все американские подводные лодки, начиная с 1956 года, были атомными.)
В финансовом году, который начался в июле 1960 года, конгресс и президент наконец согласились на постройку ударного авианосца, восьмого с тех пор, как закончилась Вторая Мировая война. В это время флот имел 14 ударных авианосцев: 4 – типа «Форрестол», 3 – типа «Мидуэй», 7 – типа «Эссекс». Их поддерживали 9 противолодочных авианосцев типа «Эссекс» и 10 учебных авианосцев.
Действия ударных авианосцев ярко отражали реакцию Соединенных Штатов на международные кризисы. В августе 1960 года, в ответ на угрозы советского премьера Никиты Хрущева, вызванные отчасти вторжением войск США и ООН в Конго, американский ВМФ выделил дополнительные силы 6-му и 7-му флотам.
Ударные авианосцы «Индепенденс» и «Интрепид» прибыли в Средиземное море в конце августа. Предполагалось, что они будут находиться там 6 месяцев. В начале сентября в Средиземное море прибыл авианосец «Саратога». В это время в составе 7-го Флота числились 3 ударных авианосца: «Хэнкок», «Орискани» и «Тикондерога». Ударная мощь авианосных соединений увеличилась осенью 1960 года, когда с 2 авианосцев каждого флота на берег перелетела истребительная эскадрилья, а на ее место прибыли эскадрильи легких штурмовиков. Истребители находились в постоянной готовности на базах Рота, Испания, и Ацуги, Япония, чтобы быстро вернуться на авианосцы в случае необходимости.
Имея только 14 ударных авианосцев, флот с трудом поддерживал базирование 6 кораблей за границей. Чтобы позволить себе такое, флот должен был иметь 18 ударных авианосцев. Поэтому, в 1961 году количество ударных авианосцев ненадолго было увеличено до 16 кораблей, когда была закончена постройка нового авианосца, а перевод старого «Эссекса» в противолодочные авианосцы задержался.
Во время кризиса 1960 года, 6-й и 7-й флоты получили противолодочные авианосцы — «Вэлли Фордж» и «Хэнкок» соответственно. Когда в новом независимом Конго вспыхнула гражданская война, противолодочный авианосец «Уосп» совершил бросок в Аккру, Гана, чтобы доставить туда 225000 галлонов авиабензина, необходимого для транспортных самолетов, перебрасывающих войска ООН и припасы в раздираемую войной страну. На борту авианосца находилось 6 двухмоторных самолетов COD и 8 вертолетов морской пехоты. Они должны были помочь эвакуировать гражданское население из внутренних районов страны, если это потребуется.
Американский флот испытал еще большее напряжение, когда события в Карибском море заставили направить корабли и в этот район. В их число входили авианосцы и вертолетоносцы. В середине апреля 1961 года несколько американских кораблей крейсировали у берегов Кубы во время злосчастного вторжения в заливе Свиней. Там высадились 1700 обученных в США солдат, в основном кубинских эмигрантов. Пилотируемые эмигрантами бомбардировщики не сумели уничтожить ВВС коммунистической Кубы, и самолеты Кастро превратили высадку в западню. Американские авианосцы, стоящие у берега, не имели приказа вмешаться. Они могли легко изменить ход событий, проведя 5 – 6 налетов против аэродромов и войск коммунистов. Десантный вертолетоносец «Боксер» тоже стоял у берега, имея на борту батальон морской пехоты. Однако эти войска тоже не получили приказа.