После того как было закреплено политическое и военное превосходство Вавилона, пришла пора утвердить и расширить религиозное верховенство. В городе, красота которого воспевается в Библии, а сады в древности считались одним из чудес света, располагалась священная территория с храмом-зиккуратом Эсагиль в центре, собственными стенами и охраняемыми воротами. Внутри были проложены аллеи для церемониальных процессий и построены святилища других богов (Мардук предполагал, что они будут его вынужденными гостями). Когда археологи вели раскопки Вавилона, они обнаружили не только руины города, но и «архитектурные таблички» с описаниями и картами. Приведённая ниже реконструкция священной территории (рис. 52) даёт наглядное представление о грандиозной штаб-квартире Мардука (несмотря на то что многие руины имеют более позднее происхождение).
Аналог современного Ватикана, священная территория была населена внушительным количеством жрецов, и их функции — религиозные, церемониальные, административные, политические и обслуживания — можно определить по названиям различных групп.
Нижнюю ступень в жреческой иерархии занимали абалу — «носильщики», которые убирали храм и прилегающие здания, обеспечивали принадлежностями и утварью других жрецов, а также обслуживали склады продовольствия и других товаров — за исключением шерстяной пряжи, которая была доверена лишь жрецам шууру. Жрецы мушипу и мулилу проводили обряды очищения, но для лечения укусов змей требовались жрецы мушлах-ху. Уманну, или мастера, работали в мастерских, изготавливая искусные предметы религиозного культа; группа жриц, исполнявших обязанности поваров и кухарок, называлась заббу. Другие жрицы выступали в качестве профессиональных плакальщиц на похоронах, а бекате умели выражать скорбь. Шангу — просто жрецы — следили за работой храма и правильным исполнением обрядов, принимали приношения, отвечали за одеяния богов и т. д., и т. д.
Функции личной прислуги богов в святилищах исполняла небольшая, специально отобранная группа жрецов, относящаяся к элите жреческой касты. Среди них были рамаку, исполнявшие обряд очищения водой (они удостаивались чести купаться с богами), и писаку, выливавшие использованную воду. Умащением богов «священным маслом» — изысканной смесью из ароматических масел — занимались специальные жрецы, от абараку, смешивавших масла, до пашишу, натиравших тело бога (в случае богини все они были евнухами). В этой группе были и другие жрецы и жрицы, в том числе «священный хор» — пару пели, лаллару пели и играли на музыкальных инструментах, а специальностью мунабу считались плачи. Во главе каждой группы стоял руководитель — рабу.
Мардук считал, что, поскольку вершина храма Эсагиль достигает небес, его главной функцией должно быть непрерывное наблюдение неба. И действительно, высшие ступени в иерархии занимали те жрецы, которые наблюдали за небом, регистрировали движение звёзд и планет, записывали необычные явления (такие как парад планет или затмение), решали, что считать небесным знамением, и истолковывали его.
Астрономы-жрецы, носившие общее название машма-шу, делились на несколько групп. Так, например, в обязанности жреца каллу входило наблюдение за созвездием Тельца. Лагару должен был ежедневно вести подробные записи небесных явлений и передавать их жрецам-толкователям. В эту группу — занимавшую высшую ступень в иерархии — входили ашиппу, интерпретирующие знамения, махху, «которые могли понимать знаки», и бару, или «открывающие истину», которые «понимали тайны и божественные знаки». Специальные жрецы закику передавали божественные послания царю. Во главе всех астрономов-жрецов стоял уригаллу, или верховный жрец, который был святым человеком, магом и врачевателем; подол его белых одежд украшался сложным разноцветным узором.
Около семидесяти таблиц с записями серии наблюдений за небом и их толкований, обнаруженные археологами и названные по первым словам, «Энума Ану Энлиль», выявили заимствования из шумерской астрономии, а также существование формул, указывающих смысл того или иного явления. Со временем эту иерархию жрецов дополнили многочисленные прорицатели, толкователи снов, предсказатели судеб и т. п., но они служили скорее царю, чем богу. Постепенно наблюдения за небом вырождались в поиск астрологических знамений царю и стране — предсказаний войны и мира, переворотов, долгой жизни или смерти, благоденствия или бедствий, божественной милости или божественного гнева. Однако изначально эти наблюдения носили чисто астрономический характер и были интересны в первую очередь богу — Мардуку — и лишь опосредованно царю и народу.