Благодаря дождям, регулярно выпадавшим в Сахаре вплоть до 5000 г. до н. э., здесь установилась своя экосистема, представленная травами, кустарниками и деревьями. Вся флора концентрировалась главным образом в районе источников, озер и прочих водоемов. Эти же места выбирали для обитания люди и животные. Позднее, с отходом пояса дождей дальше на юг, климат в южном Египте и северном Судане обрел характер полузасушливого. При этом одни места пересыхали гораздо быстрее других. Озера, питавшиеся грунтовой водой, существовали дольше, чем плайи, которые напрямую зависели от количества доящей. Однако в целом климат становился все суше и суше, что привело к сокращению растительной жизни. Анализ пыльцы позволил установить, что уже с 6-го тысячелетия до н. э. эта местность начала испытывать серьезную нехватку воды. Пояс дождей сместился на 250 километров к югу, передвигаясь со скоростью около тридцати шести километров в столетие — что составляет примерно градус широты каждые триста лет. В результате растительный и животный мир региона оказался наполовину уничтожен. Оставшаяся часть его вынуждена была тесниться на крохотных островках обитаемой земли{41}.
Плайи, находившиеся в оазисах северного Египта, полностью пересохли уже около 5000 лет до н. э., а бассейны их были засыпаны песками пустыни. Плайя Хатиет Ум Эль-Хийус из оазиса Сива существовала еще в 5900 году до н. э., однако на протяжении 6-го тысячелетия уровень воды в ней постепенно понижался. И в конце концов это озерко пересохло совсем.
В 4600 году до н. э. Нил поднимался до одной из максимальных отметок, однако после этого уровень воды в нем стал неуклонно сокращаться. И только в пору наводнений ему удавалось разлиться с прежним размахом. В результате подобного чередования высоких и низких уровней воды конус Нила (область Средиземного моря возле устья реки) оказался покрыт всевозможными отложениями — в том числе и известковой «грязью».
Начиная с 4500 года до н. э. стал понижаться уровень воды в озерах Файюма. Затем, около 3800–3700 лет до н. э., последовало временное повышение. Ну а с 3700 по 1700 год до н. э. озера вновь стали пересыхать. Многие из притоков Нила перестали действовать уже в 5-м тысячелетии до н. э. Вади Мелик пересохло около 4000 г. Значительно уменьшились поступления воды из вади Ховар. В период с 5000–4500 г. до н. э. засуха охватила регион Файюма и область, расположенную к западу от долины Нила. Все это привело к исчезновению пышной зелени и преобладанию элементов Сахары. К 4000 году до н. э. в большинстве областей южного Египта распространилась флора, характерная для регионов пустыни. Исключение составляли некоторые оазисы, вади и область Гильф Кебир. К 3000 году до н. э. здесь еще наблюдались сезонные поступления воды, что содействовало пышному росту растений, сопоставимых с современными лесами Тибести и Хоггара{42}.
В 4-м тысячелетии до н. э. засуха немного уменьшилась, так что в год выпадало около шести дюймов дождя. Однако в целом климат продолжал ухудшаться. Так, анализ ископаемых растений позволил установить, что в начале 3-го тысячелетия до н. э. в год выпадало менее четырех дюймов дождя.
Уже около 4000 г. до н. э. многие районы на юге Египта полностью опустели. В регионе Гильф Кебир, где климат отличался большей влажностью, люди селились главным образом в период с 4-го по 3-е тысячелетие до н. э. Такие плайи, как вади Бахт и Ард Эль-Ахдар, продолжали наполняться водой до 3000 г. до н. э., а затем внезапно прекратили свое существование. Однако песчаные дюны, заполнившие эти впадины, в скором времени были разметены — скорее всего, частыми и необычайно сильными ураганами.
Схожие изменения наблюдались и в северном Судане, хотя в целом климат здесь был более влажным, чем в южном Египте. Некоторые озера и плайи северного Судана высохли уже к началу 6-го тысячелетия до н. э. В районах Лакия и Тагеру большинство озер исчезло в период до 4500 г. до н. э. Часть водоемов в регионе Мерги оставались действующими до 4900 г. То же самое можно сказать и о плайях из Лакия Умран. Еще около 4100 г. до н. э. они продолжали наполняться водой. А некоторые поселения из вади Сал, что находится поблизости от Лакия Арбаин, датируются 2700 г. до н. э. Плайи и прочие резервуары со стоячей водой, расположенные вдоль вади Ховар и вади Мансураб, начали истощаться уже в 6-м тысячелетии до н. э. и к 2800 г. исчезли совсем{43}.
Исследования в Селиме позволяют сделать вывод, что местное озеро подверглось активному испарению в период между 5000 и 4000 г. до н. э. В результате около 4400 года некогда пресные воды его превратились в соленые. Типичная для этого региона растительная жизнь сохранялась вплоть до 4000 г. На основании изотопных измерений ученые сделали вывод, что уже в 3600 г. климатические условия здесь отличались значительной сухостью. С последующим ослаблением дождей озеро в Селиме существенно сократилось в размерах и полностью исчезло к 2000 г. до н. э. Схожие изменения протекали и в Ойо, в четырехстах километрах к югу. Глубокое озеро сохранялось здесь вплоть до начала 6-го тысячелетия, однако позднее значительно обмелело и тоже стало соленым. К 4600 году до н. э. начали исчезать лиственные леса. А между 4000 и 2500 г. суданская и сахелийская саванны уступили место кустарникам и безлесным пастбищам. После 2900 г. ветры полностью засыпали впадину Ойо песками{44}.