Раскопки незастроенных участков пантикапейского городища на горе Митридат и ее вершине велись время от времени на протяжении XIX в., но не столько в целях раскрытия остатков древнего города, его улиц и площадей, хозяйственнопроизводственных построек и частных домов, храмов и дворцов, сколько ради отыскания отдельных ценных находок — надписей, статуй, ваз и т. п.6 Лишь в 90-х годах прошлого столетия археологом К. Е. Думбергом была сделана попытка организовать планомерные раскопки остатков города Пантикапея. В течение трех летних сезонов успешно велись археологические исследования на северном склоне горы Митридат, где удалось вскрыть довольно значительный участок античного города. Под насыпью в 5—6 м толщиною были открыты различные постройки и найдено много разнообразных вещей, характеризующих культуру и быт жителей боспорской столицы в различные периоды ее существования. Но раскопки эти вскоре были прерваны; в последующие десятилетия производились временами небольшие эпизодические раскопки, и только в самое последнее время, начиная с 1945 г., стали вестись под руководством В. Д. Блаватского систематические археологические исследования пантикапейского городища. Указанные выше обстоятельства являются причиной того, что о Пантикапее как о городе известно еще сравнительно мало.
Пантикапей был окружен двойной линией крепостных стен. Одна стена охватывала на большом протяжении весь город, другая окружала верхнюю часть горы и служила защитой акрополя. Следы этих стен были заметны в начале XIX в., и тогда же их нанес на план Дюбрюкс — первый археолог, начавший в Керчи с 1816 г. исследования боспорских древностей, в частности городищ; но этот подробный план руин Пантикапея впоследствии затерялся.7 Сохранились другие планы (Дюбуа, Ашика), составленные менее точно, но все же, повидимому, передающие в основных чертах действительную конфигурацию оборонительных стен Пантикапея (рис. 26).8
В первые десятилетия XIX в. были еще видны следы ворот, имевшихся в оборонительных стенах, а также башен; различимы были даже линии некоторых древних улиц. По мере роста нового города Керчи все эти выступавшие на поверхности остатки древнего города скоро совсем исчезли.
В начале нынешнего столетия во время раскопок, ведшихся на северном склоне горы Митридат с целью отыскания древних могил, обнаружились следы оборонительной стены Пантикапея, ограждавшей город с юга. Стена шла от скалистого выступа, носящего название 2-го кресла Митридата, по склону в сторону Госпитальной улицы. В стене толщиною 3 м оказались использованными в качестве строительного материала надгробные плиты с надписями IV в.9 Следовательно, стена эта построена или в поздне-эллинистическое или в римское время, когда город достиг наибольших размеров. Остатки стены, оборонявшей акрополь, были частично обнаружены раскопками 1930 г. на восточной стороне горы Митридат, несколько ниже плато акрополя. Выявленные здесь фундаменты стены имели в ширину почти 4 м. Стена, вероятно, служила одновременно и для целей обороны и для укрепления верхней террасы горы, где находился акрополь.
На акрополе были расположены храмы наиболее почитаемых богов; там же или на одной из боковых верхних террас находился дворец боспорских царей. При раскопках на акрополе были открыты водостоки и цистерны для хранения запасок дождевой воды. На вершине горы Митридат и ее склонах, особенно восточном, находили много архитектурных деталей (капители, барабаны колонн и пр.), плиты мрамора различных форм и цветов (белого, красного, зеленого, черного, серого, пестрого), куски расписной стенной штукатурки, что указывает на некогда существовавшие здесь монументальные роскошно отделанные здания. Немало архитектурных частей (обломки карнизов, колонн) классического и эллинистического, периодов обнаружено в остатках стен построек, возникших в более позднее время, при возведении которых старые сооружения использовались как строительный материал.
По всей вероятности, на пантикапейском акрополе, или у его подножия с северной стороны, стоял храм Деметры — богини, особенно почитавшейся на Боспоре как покровительницы хлебного урожая, от которого зависело благосостояние жителей. На акрополе найдена мраморная база алтаря конца V в. до н. э., украшенная скульптурным рельефом с изображением процессии, происходящей, повидимому, в честь богини Деметры.10 На акрополе же обнаружена и посвятительная надпись Деметре времен Левкона I (IPE, II, 7), а на северном склоне горы Митридат найден большой мраморный бюст Деметры (он хранится в Керченском музее), являющийся хорошей копией римского времени с оригинала IV в. до н. э.