В сочинении Игнатия "De Virtute obedientiae" ("Добродетель послушания") сказано, что тот, кто хочет всецело отдаться Богу, должен, кроме своей воли, пожертвовать и своим разумом. Это есть третья и высшая степень послушания: он должен быть не только волей, но и разумом, единым со своим старшим, и так подчинить свое суждение ему, чтобы дух смирения вполне подчинил разум. Новичок проводит два года в доме послушников ("новициата"), где расписаны каждые четверть часа. Затем в течение 5-6 лет он посвящает себя как "схоластика" курсу наук, и только после этого допускается к изучению богословия. Новичка учат владеть собой так, чтобы он мог следить за каждым движением мускулов и за каждым словом, им произнесенным, отучаться от всякого порыва. У иезуита нет ни родства, ни родины, ни личной дружбы. После схоластики и богословия иезуит проходит еще год послушания, потом его рукополагают во священники и он становится "коадьютором". Следующая ступень, доступная иезуиту, это — "профес", но ее удостаивается не каждый. Професы произносят торжественную клятву абсолютного подчинения папе. Професы делятся на две категории: произнесших три обета и четыре обета. Из этой высшей категории избираются "генералы ордена"
Для духовного усовершенствования и развития внутренней дисциплины старшие тренируют младших путем размышлений (медитаций) над "Духовными упражнениями", сочиненными Игнатием. В них требуется, например, мысленно представить себе страдания Христа, мучения грешников в аду и т.д. Иезуиты снабжаются для своего служения солидным обучением: они должны быть в курсе современной науки, политики, литературы, языков и т.д. Находясь на передовых позициях Римской церкви, будучи ее разведчиками и защитниками одновременно, иезуиты должны знать, что их задача — это побеждать врагов Рима, а враги — это все, отрицающие папский авторитет. Кроме того, врагами считаются и те, кто в прежние века оспаривали папский принцип. Поэтому ученые ордена прилагали все усилия, чтобы "исправить церковную историю" путем сокращений и просто уничтожения документов, бросающих тень на папство и его непогрешимость. Даже постановления соборов, затрагивающие авторитет папы, как, например, Констанцского, подверглись их усердным, хотя и запоздалым, поправкам. В настоящем очерке не поместился бы даже кратчайший перечень инициатив, предпринятых иезуитами в этой области, дабы затушевать некоторые наиболее скандальные страницы папской истории, как, например, царствование Александра Борджиа
В Богемии, желая искоренить окончательно память о древних православных традициях чехов, иезуиты предприняли уничтожение всех старинных памятников письменности
Такого рода апологетика требовала, прежде всего, чрезвычайной осторожности и гибкости. Ввиду этого иезуиты получили право изменять во всякое время статуты общества, чего не может делать никакой другой орден. Для защиты ложных учений, привившихся в Римской церкви, иезуиты принуждены, вопреки своему божественному наименованию, оперировать ложью. Согласно этой необходимости, их богословы выработали особую систему диалектики, искусно перемешивающую ложь с истиной. Это — так называемая "казуистика". Система эта, справедливо названная православными писателями языческой, может оправдать всякое злодеяние, поскольку оно служит на благо Римской церкви. Орденский девиз: "Ad majorem Dei gloriam!" ("К наибольшей славе Бога!") противоестественно совмещается с принципом: "Цель оправдывает средства". Этот аморальный принцип, отрицаемый некоторыми авторами-иезуитами, совершенно ясно выражен неоднократно в их сочинениях. Прежде всего, сам Игнатий писал: "Если начальник прикажет, то иезуит, во имя Христа, или как послушание , может совершать даже смертный грех". Иезуитский богослов о. Бусенхаук не менее ясно формулировал это: "Если цель дозволена, то и средства дозволены" ("Medulla Theologiae Moralis", т. IV)
Кроме того, парламент короля Франции Людовика XV, выгнавший орден, привел в обвинительном акте сотни примеров этого чудовищного принципа на практике. Кроме преступлений, перечисленных французским парламентом, отметим скандальное дело иезуита Жирара и его духовной дочери Кадиэр, возмутившее все королевство
Весь орден разделен на "провинции", повинующиеся "отцу провинциалу", каковые в свою очередь подчинены "генералу" ордена, одно время романтически называемому "черным папой"
Добившись звания духовников почти всех католических государей и важнейших сановников, иезуиты стали неуклонно проводить в жизнь методы, казавшиеся им наиполезнейшими для церкви. В низших же слоях общества они проповедовали фанатизм и даже убийство, чтобы избавиться от мешавших им лиц. Считается, что Ревальяк, воспитанник иезуитов, убил короля Генриха IV в 1620 г. за то, что он, несмотря на свой переход в латинскую веру, продолжал покровительствовать французским протестантам. Благодаря влиянию иезуитов Людовик XIV отменил "Нантскийддикт", чем причинил протестантам непоправимый урон