В 1939 году была предпринята попытка переоборудовать самолет в высотный бомбардировщик. С этой целью были установлены новые высотные дизели «Jumo-207» и гермокабина, увеличена площадь крыла, сняты стрелковые установки. Самолет выпускался в двух вариантах: высотного бомбардировщика Ju.86P-1, несущего бомбовую нагрузку до 1000 кг (4 × 250 кг или 16 × 50 кг) и высотного разведчика Ju.86P-2 с тремя аэрофотоаппаратами на борту. Самолет имел потолок 12 000 метров, что в течение длительного времени позволяло совершать полеты над Британскими островами и территорией СССР. Однако начиная с мая 1942 года несколько разведчиков Ju.86P-2 было сбито облегченными высотными истребителями «Спитфайр» MkV, а к середине 1943 года их применение фактически прекратилось.
Одним из самых известных самолетов «Юнкерс», ставшим одним из символов «Блицкрига» гитлеровской Германии в Европе, оказался пикирующий бомбардировщик «Junkers» Ju.87 Stuka (от Sturzkampfflugzeug – «Пикирующий боевой самолет»).
Своим появлением самолет был в значительной степени обязан Э. Удету, являвшемуся горячим поклонником этого класса боевых машин.
Специфика пикирующего бомбардировщика требовала от его создателей соблюдения ряда особых критериев, таких как наличие совершенной механизации крыла, влючающей в себя «воздушные тормоза», и достаточный запас прочности с учетом перегрузок при выходе из пикирования. У одномоторного самолета существовала также опасность угодить сбрасываемой в пикировании бомбой в собственный винт, для предотвращения чего предусматривалось специальное устройство для выноса бомбы за пределы площади ометания винта. Кроме того, на «штуке» был установлен автомат пикирования, служащий для вывода самолета из пике без превышения допустимых нагрузок.
Созданный в 1936 году под руководством Германа Польмана самолет не поражал своими летными данными – скорость равнялась всего 320 км/ч (причем даже впоследствии у последних модификаций она не возросла более 380–400 км/ч), вооружение состояло преимущественно из двух (у машин первых серий – одного) крыльевых 7,9-мм пулеметов и одного того же калибра для защиты задней полусферы. Сравнительно небольшой была и бомбовая нагрузка – самолет мог нести одну 250– или 500-кг, или четыре 50-кг бомбы, однако это компенсировалась высокой точностью – отклонение от точки прицеливания не превышало 30 метров (а более опытные пилоты, как утверждается, способны были попасть в круг диаметром до 15 метров).
Самолет имел специальное устройство для выноса бомбы за пределы площади, ометаемой винтом, для предотвращения ее попадания в винт при сбросе. Для облегчения вывода самолета из пике был установлен автомат пикирования.
Ju.87В применялись во всех кампаниях вермахта, нанося удары как по конкретным обьектам – по аэродромам, транспортным узлам, мостам, оборонительным укреплениям, – так и скоплениям войск. Характерный вид бомбардировщика – крылья по типу «обратная чайка» и напоминающее птичьи лапы неубирающееся шасси, заключенное в обтекатели, придавал ему сходство с хищной птицей. Для усиления психологического воздействия на противника на бомбардировщиках устанавливались «Иерихонские трубы» («Jerycho Trompeten») – особые сирены, приводимые в действие напором воздуха при пикировании. Специальными приспособлениями, издававшими характерный свист в полете, оснащались также авиабомбы. В сочетании с высокой точностью при действиях в условиях господства люфтваффе в воздухе удары «штук» оказывали не только поражающее, но и деморализующее действие на противника.
Ju.87, кроме прочего, стал и первым самолетом, одержавшим победу в воздухе во Второй мировой войне, – утром 1 сентября 1939 года фельдфебель Ф. Нойбер сбил польский истребитель PZL P.11. В целом в Польской кампании потери Ju.87 составили около 10 % общего количества машин – 31 (по другим данным – 28) самолет, из которых только 11 – в бою с истребителями. А по итогам боевых действий при вторжении в Данию и Норвегию люфтваффе потеряли 14 «юнкерсов». После капитуляции Франции английский историк Дж. Фуллер писал: «Войну для немцев выиграли “штуки” вместе с танковыми дивизиями».
Однако в условиях противодействия противника эффективность «штук» была далеко не настолько впечатляющей, что проявилось уже во время «Битвы за Британию». Тем не менее Ju.87 продолжали использоваться на различных театрах, в частности на Средиземноморье, где в течение 1941 года в результате их действий были нанесены повреждения ряду британских боевых кораблей – авианосцу «Илластриус» («Illustrious») и легкому крейсеру «Саутгемптон» («Southampton») (причем последний пришлось затопить), а легкий крейсер «Глостер» («Gloucester») и эсминец «Грейхаунд» («Greyhound») были пущены ко дну.