K20me | Hs, Dm | Pr-SET7/Set8-me1 | Транскрипционный сайленсинг, митотическая конденсация | Fang et al., 2002; Nishioka et al., 2002b; Rice et al., 2002
K20me | Dm | Ash1-me2 | Trithorax-активация в сочетании с метилированием H3K4 и H3K9 | Beisei et al., 2002
K59me | Sc | Формирование «молчащего» хроматина | Zhang et al., 2003
K59me | Su Hs | SUMO-1 SUMO-3 | Репрессия транскрипции | Shiio and Eisenman, 2003
Дополнительные модификации Н4:
K12me, S47ph, K31ubl, К59me, К77ас, К79ас, К79me, K91ub1, R92me (Hyland et al., 2005).
Сайт | Модель | Энзим | Функция | Ссылка
E2ar1 | Rn | PARP-1 | Участие в нейротрофной активности | Ogata et al., 1980; Visochek et al., 2005
T10ph | Hs | — | Митоз-специфичная транскрипционная активация Н1b | Chadee et al., 1995; Garcia et al., 2004; Sarg et al., 2006
E14ar1 | Rn | PARP-1 | Участие в нейротрофной активности Ogata et al., 1980; Visochek et al., 2005
S17ph | Hs | — | Интерфаза-специфичная транскрипционная активация Н1b Garcia et al., 2004; Chadee et al., 1995; Sarg et al., 2006
K26me | Hs | EZH2-me2 | Опосредует связывание НР1 Kuzmichev et al., 2004; Daujat et al., 2005
S27ph | Hs | — | Блокирует связывание НР1 | Garcia et al., 2004; Daujat et al., 2005
T137ph | Hs | — | Митоз-специфичная транскрипционная активация H1b | Chadee et al., 1995; Garcia et al., 2004; Sarg et al., 2006
T154ph | Hs | — | Митоз-специфичная транскрипционная активация H1b | Chadee et al., 1995; Garcia et al., 2004; Sarg et al., 2006
S172ph | Hs | — | Интерфаза-специфичная транскрипционная активация H1b | Chadee et al., 1995; Garcia et al., 2004; Sarg et al., 2006
S188ph | Hs | — | Интерфаза-специфичная транскрипционная активация H1b | Chadee et al., 1995; Garcia et al., 2004; Sarg et al., 2006
K213arl | Rn | PARP-1 | Участие в нейротрофной активности | Ogata et al., 1980; Visochek et al, 2005
Дополнительные модификации Н1:
К26ас, E114arn, убиквитинирование Н1, карбонилирование HI (Pham and Sauer, 2000: Rouleau et al., 2004).
Сайт | Модель | Энзим | Функция | Ссылка
S139ph | Hs, Sc, Dm. XI | ATM DNA-PK | Репарация ДНК. Связана с М-фазой. Известна также как ?Н2АХ | Rogakou et al., 1998,1999; Burma et al., 2001 ; Stiff et al., 2004; Ichijima et al., 2005; Mukheijee et al., 2006
Дополнительные модификации H2AX: T136ph.
Сайт | Модель | Энзим | Функция | Ссылка
K17me | Hs | — | — | Chu et al., 2006
K115ub1 | Hs | — | — | Ogawa et al., 2005; Chu et al., 2006
K122me | Hs | — | — | Chu et al., 2006
T128ph | Hs | — | — | Chu et al., 2006
K238me | Hs | — | — | Chu et al., 2006
Сайт | Модель | Энзим | Функция | Ссылка
K4me | Dm | me1, me2, me3 | Активация транскрипции | McKittrick et al., 2004
K9me | Dm | me1, me2 | Репрессия транскрипции | McKittnck et al., 2004
K9ac | Dm, Hs | — | Активация транскрипции | McKittrick et al., 2004; Hake and Allis, 2006
K14me | Dm | me1, me2 | McKittrick et al., 2004
K14ac | Dm, Hs | — | Активация транскрипции | McKittrick et al., 2004; Hake and Allis, 2006
K18aс | Hs | — | Активация транскрипции | Hake and Allis, 2006
K23ac | Hs | — | Активация транскрипции | Hake and Allis, 2006
K27me | Dm | me1, me2, me3 | Репрессия транскрипции | McKittrick et al., 2004
K36me | Dm, Hs | me1, me2, me3 | Активация транскрипции | McKittrick et al., 2004; Hake and Allis, 2006
K37me | Dm | me1, me2 | — | McKittrick et al., 2004
K79me | Dm, Hs | me1, me2 | Активация транскрипции | McKittrick et al., 2004; Hake and Allis, 2006
S31ph | Млекопитающие | — | Митоз-специфичное фосфорилирование | Hake et al., 2005
Сайт | Модель | Энзим | Функция | Ссылка
S7ph | Hs | — | Митоз | Zeitlin et al., 2001
Дополнительные модификации CENP-A: S17ph.
(An) Aspergillus nidulans, (At) Arabidopsis thaliana, (Ce) Caenorhabditis elegans, (Dm) Drosophila melanogaster, (Hs) Homo sapiens, (Mm) Mus musculus, (Nc) Neurospora crassa, (Rn) Rattus norvegicus, (Sc) Saccharomyces cerevisiae, (Sp) Schizosaccharomyces pombe, (Tt) Tetrahymena thermophila, (Xl) Xenopus laevis.
Модификации гистонов — по номенклатуре, предложенной Тернером (Turner, 2005).
В таблицах перечисляются все известные модификации гистонов и известные энзимы с первичными ссылками (до мая, 2006 г.). Дополнительные модификации с пока еще неизвестными функциями перечислены под таблицами. Эти модификации взяты из разных источников: обзорных статей, информации от Abeam Cambridge, UK и Upstate Charlottesville, USA, а также из неопубликованных данных лаборатории Рейнберга (Reinberg).
Эта таблица была составлена на основе оригинального варианта, взятого из (Lachner et al., 2003) и значительно расширенного Roopsha Sengupta и Mario Richter (Лаборатория Jenuwein, IMP Vienna). Д-р Patrick Trojer (Лаборатория Reinberg, HHMI, New Jersey) проверил содержимое таблиц.
Эта таблица была проверена и дополнена информацией, предоставленной д-ром Steven Gray (Dept, of Clinical Medicine, Institute of Molecular Medicine, St. James Hospital, Dublin).
Adhvaryu K.K., Morris S.A., Strahl B.D., and Selker E.U., 2005. Methylation of histone H3 lysine 36 is required for normal development in Neurospora crassa. Eukaryot. Cell 4: 1455-1464.