Борис Евгеньевич является главным редактором журналов «Автоматическая сварка», «Специальная электрометаллургия», «Техническая диагностика и неразрушающий контроль», которые переводятся на английский язык. Это позволяет донести до мировой научно-технической общественности информацию о новых разработках и опыте применения созданных в Институте электросварки технологий, оборудования, материалов.
Одним из основных принципов, заложенных при создании института и развитых Борисом Патоном, является проведение целенаправленных фундаментальных исследований и тесная связь науки с производством. Этот принцип настойчиво воплощался в жизнь на протяжении всей почти 75-летней истории института.
Многолетняя деятельность коллектива Научно-технического комплекса «Институт электросварки им. Е. О. Патона» во главе с Б. Е. Патоном принесла институту мировую известность. Он награжден орденами Ленина, Октябрьской Революции, Трудового Красного Знамени, многие сотрудники награждены орденами и медалями СССР и Украины. Девять работ, в выполнении которых принимали участие сотрудники института, удостоены Ленинских премий СССР в области науки и техники, 24 работы – Государственных премий СССР, 34 – Государственных премий УССР и Украины.
В 1962 году Б. Е. Патон был избран действительным членом Академии наук СССР по специальности «Металлургия и технология металлов». В том же году ученые Академии наук УССР избрали его президентом Академии наук УССР (ныне Национальная академия наук Украины).
Глубокое понимание роли науки в обществе, ее целей и задач, высокий международный авторитет ученого, преданность науке, неиссякаемая энергия и высокие моральные качества, общественно-политическая деятельность, опыт руководства большим научным коллективом стали решающими аргументами при избрании Бориса Евгеньевича на пост президента Академии наук Украины. С тех пор он возглавляет эту ведущую научную организацию страны.
На этом ответственном посту еще шире раскрылся талант Бориса Патона как организатора науки. Это был непростой период в истории советской науки, когда правительство страны намеревалось передать институты АН СССР, занимающиеся развитием технических наук, в ведение отраслевых министерств. К счастью, Борис Евгеньевич сумел противостоять этому. Под его руководством была разработана новая структура Академии наук УССР, ее новый устав, направленный на наиболее рациональное использование научных сил и средств для решения фундаментальных проблем науки. По инициативе Бориса Патона и при его активной поддержке в системе Академии наук УССР были созданы десятки новых институтов и организаций, расширяющих и углубляющих исследования по наиболее важным научным направлениям.
Борис Евгеньевич стремится к тому, чтобы академические учреждения были организованы не только в Киеве, но и в других регионах страны. В 1965 году по его инициативе в Донецке был создан академический научный центр и открыт университет. Позднее были созданы научные центры АН УССР и Министерства образования и науки Украины, которые успешно действуют и до сегодняшнего дня: Западный (Львов), Южный (Одесса), Северо-Восточный (Харьков), Приднепровский (Днепропетровск) и Крымский (Симферополь). Эти центры выполняют функции региональных межотраслевых органов координации научной деятельности.
В 1963 году Б. Е. Патон был избран членом Президиума АН СССР, что дало ему возможность ознакомиться с деятельностью институтов АН СССР, изучить опыт работы Президиума академии и ее отделений. Между Борисом Евгеньевичем и президентом АН СССР академиком Мстиславом Всеволодовичем Келдышем установились доверительные деловые отношения, творческие связи, переросшие в дружбу и взаимное уважение.
На протяжении многих лет работы Бориса Евгеньевича в Президиуме АН СССР у него сложились добрые деловые отношения с Председателем Государственного комитета СССР по науке и технике В. А. Кириллиным, президентами АН СССР А. П. Александровым, Г. И. Марчуком, Ю. С. Осиповым, с создателем и первым председателем Сибирского отделения АН СССР М. А. Лаврентьевым и многими другими учеными. Это позволило организовать сотрудничество ученых Украины с учеными Москвы, Ленинграда, Новосибирска и других регионов РСФСР, а также союзных республик и, несомненно, способствовало развитию науки в Украине.
Вот что писал о стиле руководства президента АН Украины к его 60-летию академик В. М. Глушков: «День «нашего президента», как с уважением говорят о нем сотрудники академии, расписан по минутам. С утра – в Институте электросварки, директором которого он является. После обеда – в главном штабе украинских ученых, Президиуме Академии наук УССР, в системе которой 76 научно-исследовательских учреждений и свыше 66 тысяч человек…