На протяжении 1938 года выпуск «Шторьхов» составлял примерно три машины в неделю. До Нового Года 1939 года успели выпустить 120 самолетов всех серий и модификаций. В 1939 году производительность возросла до двадцати самолетов в неделю. Такой темн сохранялся до сентября. В октябре и ноябре 1939 года было выпущено только по пятнадцать самолетов. В декабре выпуск свернули, всего было выпущено 340 машин.
Самолет Fi-156 пользовался мировой популярностью, поэтому его охотно демонстрировали публично. Большое впечатление на публику оказала посадка Fi-156V3 на Унтен-ден-Линден в центре Берлина в ходе празднования дня вермахта в марте 1939 года. Кадры посадки самолета вошли в кинохронику почти по всему миру. Праздник отмечался как настоящий триумф, и тому были свои причины.
Праздник прошел уже после вступления немецких войск в Судеты. Западные державы пошли на позорный Мюнхенский сговор, пытаясь сохранить мир для себя за счет скармливания Гитлеру других народов. Операция по вводу немецких войск началась 1 октября 1938 года в 14:00. Люфтваффе в ходе операции совершал разведывательные полеты, а затем приступил к транспортировке войск. На протяжении всей операции немецкие самолеты не встречали сопротивления. «Шторьхи» активно использовались в качестве курьерских самолетов. Fi-156 оказался первым немецким самолетом, приземлившимся на аэродроме в Карлсбаде, то есть в Карловых Варах.
Ппозади «Шторьха» заправляются и пополняют боекомплект перед очередным вылетом истребители Bf 109. Теоретически, каждой группе (Gruppe) Люфтваффе полагался по штату один «Шторьх». Но, после начала войны, из-за чрезмерных запросов Вермахта, это положение, как правило, не соблюдалось.
После боев на Восточном фронте уцелело немного зданий, таких как эти ангары, которыми воспользовалось это разведывательное подразделение. Из ворот одной из этих построек выглядывает носовая часть «Шторьха». Наличие крыши над головой при техническом обслуживании было тогда редким явлением, так как «Шторьхи» действовали очень близко к линии фронта.
8 июля 1939 года на острове Фёр у западного побережья Шлезвиг-Голштейна провели седьмой Традиционный авиадень – одну из последних довоенных публичных демонстраций немецких военных самолетов. Подобного рода праздники служили поводом для встречи элиты люфтваффе. Среди ста тридцати трех самолетов на праздник прибыли два «Шторьха»: уже упоминавшийся D-IFMR и С-1 D-IUGR. Один из «Шторьхов» пилотировал сам Герхард Физелер, надевший по случаю униформу штандартенфюрера НСФК (National- sozialistisches Fliegerkorps – Национал-социалистический авиакорпус), организации, пропагандирующей авиацию среди молодежи. За штурвалом другого Fi-156 сидел старший авиаинженер Лухт, который пятью днями раньше выдвигался на должность главного инженера RLM.
9 августа 1939 года OKL (Oberkommando der Luftwaffe – Главное командование люфтваффе) выдало указание для Generalluftzeugmeister (Управление по вопросам снабжения люфтваффе), определяющее приоритеты выпуска самолетов определенных типов. В разделе, касающемся самолетов связи, упоминались машины трех типов: Focke-Wulf Fw-189 (в тот момент еще не существовало боевой модификации этого самолета), Messerschmitt Bf-108 «Taifun» и Fieseler Fi-156 «Storch». Последний самолет в документе определялся как «курьерский, связной и транспортный».
Последняя демонстрация «Шторьха» перед войной прошла в литовском Ковно. Германия представила здесь в основном планеры и аэростаты, и только четыре самолета, в том числе два «Шторьха», предоставленные Aero Club von Deutschland. Из Восточной Пруссии машины перегнали гражданские пилоты Фидлер и Крогмапн, причем второй был председателем Германского авиаклуба.
Fi 156С-2 практически не отличался от Fi 156C-1, за исключением 7,9-мм пулемета MG 15 в «линзовой» стрелковой установке для защиты задней полусферы, которая была скорее психологическим, нежели реальным фактором – по настоящему от атак с воздуха «Шторьх» защищала его невысокая скорость. В хвостовой части кабины вместо съёмного места для третьего члена экипажа могла устанавливаться фотокамера. Позднее предусмотрели возможность установки носилок для раненых.