Поручик лейб-гвардии Юденич закончил Николаевскую академию Генерального штаба в 1887 году более чем успешно — по первому разряду. Он получил право носить на мундире академический знак в неполные двадцать пять лет. Уже одно это стало лучшей характеристикой офицера. Теперь его начальник мог поручиться за то, что такой выпускник академии был вполне подготовлен к исполнению любого Порученного дела с усердием и настойчивостью. Иных офицеров из стен знаменитого в русской армии дома в два этажа на Английской набережной Невы не выпускали.
Окончание академии по первому разряду значило очень много. Результатом выпускных экзаменов стало причисление Юденича к офицерскому корпусу Генерального штаба, то есть к элитной по знаниям, перспективности и положению части офицеров Российской Императорской армии и флота.
Николаевская академия Генерального штаба давала не только прекрасные знания военного дела, но и отличную перспективу на будущее. Но Николай Николаевич был склонен верить словам своего будущего соратника А.И. Деникина, с которым сошёлся в годы Русско-японской войны:
— Академия Генерального штаба даёт метод к познанию военного дела, но главный учитель всё-таки жизнь...
Всё же факт остаётся фактом: в годы Первой мировой войны выпускники Академии Генерального штаба занимали подавляющее большинство высших командных должностей в Русской армии. Академистами были каждый четвёртый командир полка, более двух третей начальников пехотных и кавалерийских дивизий, 62% корпусных командиров...
Выпускник академии Юденич получает очередное звание — капитана. Он назначается старшим адъютантом штаба 14-го армейского корпуса Варшавского военного округа. Здесь гвардейский офицер приобретает хороший опыт штабной работы по организации военного управления. К тому же округ был приграничным, а не внутренним.
В военном министерстве уже взяли на заметку перспективного пехотного офицера и не давали ему, ради его же служебного роста, долго засиживаться на одном месте и в одной должности. Уже в 1889 году он назначается командиром роты родного ему лейб-гвардии Литовского полка.
Литовцы входили в состав 3-й Гвардейской пехотной дивизии и вместе с полками лейб-гвардии — Кексгольмским императора австрийского, Санкт-Петербургским короля Фридриха-Вильгельма III и Волынским вместе с дивизионной артиллерийской бригадой располагались в столице Царства Польского. В Варшавском гарнизоне квартировалась ещё и Отдельная гвардейская кавалерийская бригада — лейб-гвардии 2-й Уланский Его Величества и Гродненский гусарский полки с конно-артиллерийской батареей.
После большого города с европейской цивилизацией, каким являлась Варшава, Юденич вновь оказывается на Востоке, в хорошо знакомом Туркестане и южном Казахстане. Он получает в январе 1892 года назначение старшим адъютантом штаба Туркестанского военного округа и оказывается в крае оазисов, пустынь и гор, которому отдаст пятнадцать лет своей жизни.
Через четыре года Юденич становится штаб-офицером при управлении 1-й Туркестанской стрелковой бригады, которая в случае войны развёртывалась в стрелковую дивизию. Он успевает за это время пройти цензовое командование пехотным батальоном. Продолжительная штабная работа дала основательный опыт организации армейской службы, руководства войсками на полевых учениях и в условиях гарнизонной жизни.
Юденич успешно, то есть своевременно по выслуге положенных лет, продвигается по служебной лестнице. В1892 году он получает звание подполковника (майорского звания в русской армии в то время не было), а ещё через четыре года становится полковником — в тридцать четыре года благодаря своим несомненным командирским способностям и знаниям, полученным в Николаевской академии Генерального Штаба.
Теперь перед офицером корпуса генштабистов открывался прямой путь к генеральскому чину. Не хватало лишь боевого опыта и орденских наград за войну. Не столь важно за какую — но обязательно за войну, за доблесть, проявленную за «Веру, Царя и Отечество».
Сослуживец Юденича по Варшавскому военному округу Д.В. Филатьев, позже генерал-лейтенант, вспоминал о чертах характера тридцатилетнего Николая Николаевича:
«Прямота и даже резкость суждений, определённость решений и твёрдость в отстаивании своего мнения, полное отсутствие склонности к каким-либо компромиссам».
Хорошо известно, что мечтой едва ли не каждого офицера, поднимавшегося по служебной лестнице, было командование полком. Полк — пехотный или кавалерийский — являлся самостоятельной боевой единицей любой армии, в том числе и русской. Именно на этом оселке шло познание командирской личности.