6 октября, на следующий день после победного парада среди руин Варшавы, Гитлер произнес в рейхстаге небезызвестную речь, в которой нападал на Польшу и бросал вызов ее союзникам. «Польше Версальского договора больше не подняться!» — заявил он. Прогнозировалось массовое движение населения с целью соединить всех немцев и отделить от оскверняющих их евреев, которых очень много проживало в Польше. 7 октября, вдень сорокалетия Гиммлера, Гитлер назначил его главой новой организации, Комиссариата рейха по консолидации немецкой государственности (РКФДВ), важнейшей задачей которой было создать колонии немцев на территориях, с которых изгнаны евреи и другие чуждые Германии народы. Друзья Гиммлера отметили день его рождения, надписав красивый том, изданный в его честь — «Памятный адрес рейхсфюреру СС по случаю его сорокалетия», в котором он был назван главным инициатором построения в Европе нового порядка, отвечающего потребностям расширения Германии.
Гиммлер сам описывал то, что произошло, меньше чем через год после падения Польши. Сохранились заметки, которые Гиммлер делал для лекции перед верховным командованием армии 13 марта 1940 года. В своей речи он абсолютно ясно излагает свою политику насчет Польши: немцы будут управлять славянами, которым будет отведено такое место проживания, чтобы они не могли напасть на Германию в момент ослабления ее бдительности и чтобы не произошло смешения рас. «Казнь всех потенциальных лидеров сопротивления, — набросал своей худой, костлявой рукой Гиммлер. — Очень трудно, но необходимо. Позаботился об этом лично… Никаких тайных жестокостей… Суровые наказания, если необходимо… Грязное белье надо стирать дома… Мы должны быть тверды, наша ответственность перед Богом… Миллион рабов и как ими управлять».
Страшной зимой 1939/1940 гг. людей целыми поселениями изгоняли из их родных мест для исполнения плана принудительной эмиграции, для которого не было создано никаких условий. Службами Гиммлера и Гейдриха был отдан целый ряд бессердечных приказов местным айнзацкомандам, которые учили исполнять приказы, не задумываясь об их последствиях для выселенных людей. Согласно договору, свыше 250 000 человек германского происхождения, живших в Польше, оккупированной Россией, и в государствах Балтии, переместились в занятую немцами часть Польши. В то же время в результате приказа, отданного Гиммлером 9 октября, вдвое большее число евреев и признанных «негодными» славян переселились на восток. Позже, к 1943 г., число переехавших из восточных и юго-восточных областей людей немецкой расы выросло до 566 000, а число изгнанных поляков и евреев составило 1 500 000 человек. В ноябре Гиммлер поручил Дарре, министру сельского хозяйства рейха, по его собственной просьбе, задачу расселения немецких эмигрантов на конфискованных польских фермах. Дарре хотел сыграть свою роль в великих расовых миграциях, явившихся результатом теорий, которым он сам учил Гиммлера 10 лет назад. Неудача, которую он потерпел в выполнении этого задания, была предрешена, принимая во внимание масштабные, сложные и противоречивые указания, навязанные растерзанной Польше жестоким правлением Ганса Фрика и противодействующими друг другу силами армии и полиции Гиммлера и Гейдриха. Командирами СС были Фридрих Крюгер, бывший специалист по уличным боям и незаконному ввозу оружия, и алкоголик и садист, вступивший в СС в Австрии, Одило Глобочник, которого Гиммлеру в конце концов пришлось уволить из-за постоянного воровства.
Историки стараются узнать, когда в умах нацистского руководства созрела концепция геноцида. Незапланированное уничтожение евреев эсэсовцами и айнзацкомандами началось вместе с войной, но к январю массовая эвакуация евреев из западных провинций достигла таких размеров, которые привели к высокой смертности, неизбежной в хаосе переполненных и неотапливаемых вагонов, стоявших на запасных путях до тех пор, пока замерзшие тела детей и взрослых не начинали падать на землю, когда наконец открывались двери. В декабре Гейдрих приказал Эйхману постараться внести некоторый порядок в управление депортацией. Практически началась миграция евреев из самой Германии, когда вмешался Геринг как президент Совета обороны рейха, чтобы остановить переселение из-за ходивших в дипломатическом корпусе в Берлине слухов о смерти и страданиях людей. Тем временем Гитлер принял план, представленный Гиммлером, о порабощении поляков, которых нельзя эвакуировать, о лишении их имущества, а их детей — образования, пока они не станут расово пригодными для перемещения и интеграции с Германией через организацию «Лебенсборн», которая сначала проверяла детей, а потом устраивала к приемным родителям.