Советское руководство, желая обезопасить свои тылы перед вероятным столкновением с Германией, и обезглавить антисоветскую оппозицию, произвело депортацию населения из прибалтийских советских республик. 16 мая 1941 года наркомом госбезопасности СССР В. Н. Меркуловым и наркомом внутренних дел Л. П. Берия была подготовлена докладная записка в ЦК ВКП(б), к которой прилагалась копия проекта постановления о мероприятиях по очистке Литовской ССР от антисоветского, уголовного и социально опасного элемента. В Кремле было принято решение провести депортацию не только в Литве, но и в остальных двух прибалтийских советских республиках.
В Прибалтику для организации проведения депортации был направлен нарком госбезопасности В.Н. Меркулов и его заместители И. А. Серов и В. С. Абакумов. Помимо частей оперативных войск НКВД, дислоцированных в Прибалтике, для участия в операции были направлены 208 курсантов Высшей школы НКГБ СССР — литовцы, латыши и эстонцы по национальности. На все мероприятия отводилось три дня.
Аресты были начаты одновременно по всей Прибалтики. Для этого специальные эшелоны были рассредоточены по всем основным железнодорожным станциям. От доставленных на станции арестованых отделялись главы семей и помещались в отдельные вагоны. В Эстонии было девять эшелонов № 286–294. Три эшелона (148 вагонов) были отправлены через Нарву, а остальные семь (342 вагона) через Изборск. Причем состав № 286 вышел двумя отдельными частьями. Только один эшелон вышел 14 июня из Таллина. Все остальные эшелоны начали движение 17 июня 1941 года[54].
Итоги депортации были отражены в спецсообщении В. Н. Меркулова И. В. Сталину об итогах операции по аресту и выселению «антисоветских» элементов из прибалтийских республик[55]: всего было арестовано — 14 467 чел. и выслано — 25 711 чел. Арестованные делились на следующие группы:
— активных членов контрреволюционных националистических организаций — 5420 чел.,
— бывших охранников, жандармов, полицейских, тюремщиков — 1603 чел.,
— бывших крупных помещиков, фабрикантов и чиновников бывшего госаппарата Литвы, Латвии и Эстонии — 3236 чел.,
— бывших офицеров польской, латвийской, литовской, эстонской и белой армий, не служивших в территориальных корпусах и на которых имелись компрометирующие материалы — 643 чел.,
— членов семей участников к.-р. организаций, осужденных к ВМН — 27 чел.,
— лиц, прибывших из Германии в порядке репатриации, а также немцев, записавшихся на репатриацию и по различным причинам не уехавших в Германию, в отношении которых имеется компрометирующий материал — 56 чел.,
— беженцев из бывшей Польши, отказавшихся принять советское гражданство — 337 чел.,
— уголовного элемента — 2162 чел.,
— проституток, зарегистрированных в бывших полицейских органах Литвы, Латвии и Эстонии, ныне продолжающих заниматься проституцией — 760 чел.,
— бывших офицеров литовской, латвийской и эстонской армий, служивших в территориальных корпусах Красной армии, на которых имелся компрометирующий материал — 933 чел.
Всего по Эстонии было арестовано и выслано — 9156 чел. Эти репрессии без суда и следствия с использованием заложников из родных и близких (в том числе детей) вызвали значительный резонанс в прибалтийском обществе. Часть его из рядов пассивной оппозиции перешла в ряды активной. Некоторые лица, подлежащие аресту, сумели бежать в леса и скрыться. Так как арестовывали без суда и следствия то попасть в списки репрессируемых могли многие граждане. Поэтому часть их, даже находясь вне подозрений, предпочитала временно укрыться. В этих условиях антисоветски настроенная часть общества свои надежды на освобождение стала связывать с немецким вторжением.
Рассмотрим военно-географическую характеристику Таллина. Город находится в Восточной Европе, на южном берегу Финского залива, в 80 километрах от Хельсинки. Самое большое озеро Таллина — Юлемисте (площадь 9,6 км²). Это главный источник питьевой воды города. Озеро Харку — второе по величине (площадь — 1,6 км²). В отличие от многих больших городов, единственная значительная река в Таллине — Пирита — расположена далеко от центра города (сейчас — городской район Пирита). Бассейн реки находится под охраной из-за его живописности. Длина береговой линии — 46 км. В пределах города она образует три больших полуострова: Копли, Пальяссааре и Какумяэ, четыре залива: Таллинский, Пальяссааре, Коплинский и Какумяэ.
Порт Таллин (Ревель) являлся важнейшим из портов Эстонии. Через него проходила подавляющая часть его морского грузооборота[56]. Из общего числа населения Эстонии на 1934 год — 1 126 413 чел., на город Таллин приходилось 136 тыс. жителей (в 1939 г. 145 тыс. жителей), или 12 % от всего населения страны. В городе была сосредоточена значительная часть промышленных предприятий страны.
В 1940 году порт Таллин состоял из:
1. Таллинского рейда — обширного водного пространства, расположенного между полуостровом Виимси с востока и полуостровом Пальяссаар (б. островами Карлос) — с запада.
2. Гаваней Таллина, расположенных в южной части рейда.
3. Гаваней бухты Копли-лахт (бассейнов двух заброшенных судостроительных заводов), расположенных на западном берегу полуострова Копли.
Кроме того, к Таллину прилежал остров Аэгна (Вульф) с пристанью. С 1919 года остров Найссаар административно являлся самостоятельной волостью уезда Харьюмаа.
Гавани Таллина сосредоточены в трех группах:
1. Старая гавань, носящая на себе отпечаток исторического развития торгового порта Ревель. Эта наиболее восточная гавань являлась наиболее оборудованной, глубокой и часто используемой.
2. Группа новых гаваней, появившихся после предпринятого в 1912–1917 годах строительства главной базы русского императорского Балтийского флота. Это строительство было прервано эвакуацией в 1918 году, и гавани остались недостроенными.