В марте 1985 г. ситуация в Афганистане усложнилась. Поэтому маршал Ахромеев, сменивший Огаркова на посту начальника Генштаба, принимает решение ввести в Афганистан дополнительные отряды спецназа ГРУ, и на их базе создать две бригады четырехбатальонного состава численностью 3000 человек каждая. Управление этих бригад было сформировано на базе бригад спецназа Среднеазиатского и Туркестанского округов, а сами отряды (батальоны) - на базе бригад других округов. Например, 370-й отдельный отряд специального назначения сформирован на базе 16-й (чучковской) отдельной бригады. 29 марта 1985 г. штаб «среднеазиатской» бригады прибыл в Лашкаргах (провинция Гильменд), а «туркестанской» - в Джелалабад, после чего части спецназа под видом мотострелков приступили к выполнению боевой задачи.
Бригада, размещенная в Лашкаргахе, получила зону ответственности в 1100 км по фронту и 250 км в глубину в сторону Пакистана. В качестве усиления ей были приданы 32 боевых вертолета Ми-24 и 32 транспортных вертолета МИ-8. К боевым действиям части бригады приступили уже в апреле 1985 г., встав на пути караванов с оружием и наркотиками, идущими из Пакистана и Ирана.
За время нахождения в Афганистане бойцы бригады как одерживали победы, так и терпели поражения. В июле 1986 г. группе из лашкаргахской бригады удалось захватить 14 тонн опиума-сырца, который моджахеды переправляли на восьми машинах из Пакистана. За это местные наркодельцы приговорили командира бригады полковника Герасимова к смерти. А 31 октября 1987 г. одна из групп бригады при перехвате каравана с оружием была взята в кольцо и понесла большие потери. Из 26 человек погибли 14, в том числе и командир. Всего же лашкаргахская бригада потеряла в Афганистане 191 человека, уничтожив более 5000 душманов.
После вывода советских войск из Афганистана в феврале 1989 г. отряды (батальоны) спецназа, входившие в состав лашкаргахской и джелалабадской бригад, были обратно включены в состав тех бригад спецназа ГРУ, из которых их направляли в район боевых действий. Так, 370-й отряд был включен в состав 16-й отдельной бригады СпН и дислоцирован в Чучково.
Спецназ ВМФ
Необходимо отдельно сказать о военно-морском спецназе. Впервые он был сформирован на основании приказа заместителя наркома ВМФ СССР адмирала И.С.Исакова 11 августа 1941 г. Это была рота особого назначения при разведотделе Краснознаменного Балтийского флота в Ленинграде. Численность роты по штатному расписанию была определена в 146 человек - водолазов, прошедших спецподготовку в Военно-морской медицинской академии и в Управлении подводных работ особого назначения (ЭПРОН). Инициаторами создания РОН были военврач 1-го ранга И.И.Савичев и начальник ЭПРОН вице-адмирал Ф.И.Крылов. Командиром роты был назначен лейтенант (впоследствии капитан 2-го ранга) Иван Васильевич Прохватилов. Во время войны на Балтике рота провела более 200 разведывательно-диверсионных операций против немцев и финнов, из них более половины с использованием легководолазного снаряжения. Курировал роту заместитель начальника разведотдела КБФ по агентурной разведке капитан 3-го ранга Л.К.Бекренев. Разведчики РОН высаживались в районе Выборга, Петергофа (там осенью 1942 г. ими был взорван один из причалов, который пытались использовать как базу немцы, и эта операция стала первой диверсией, совершенной из-под воды), Кингисеппе, на островах Финского и Рижского заливов, обследовали затопленные корабли, обнаруживали минные заграждения, взрывали немецкие коммуникации (мосты, шоссейные дороги, телеграфные и телефонные линии связи). Тем не менее в октябре 1944 г., после разгрома немецко-финских войск на Севере, по предложению начальника РУ ГМШ вице-адмирала М.А.Воронцова первое подразделение водолазов-разведчиков было расформировано.