Скульптурные украшения и лепной декор по проекту Кленце отличались измельченностью, излишней детализацией и пестротой. «Мемориал» поступил на рассмотрение комиссии по строительству Исаакиевского собора, и Монферран дал о нем резко отрицательный отзыв. Он указал на недопустимость ломки частей готового здания, а также на то, что проект не обладает главным качеством, состоящим в том, что внутреннее убранство должно быть «великолепно, благородно и богато». Он предложил свой проект, который понравился комиссии. Чтобы обезопасить себя от подозрений в пристрастном отношении к конкуренту, архитектор просил назначить особую комиссию для рассмотрения обоих проектов и дать их сравнительную характеристику. Такая комиссия была создана. В нее вошли известные архитекторы В. П. Стасов, К. Тон, А. П. Брюллов, К. И. Росси.
Проект Монферрана получил окончательное одобрение, причем комиссией было указано, что в проекте К ленце есть много неприемлемых подробностей, не увязывавшихся с общей массивностью здания (мелкая орнаментика в виде крестов, кружков и т. д), и нарушается монументальность здания.
Для того чтобы получить больше сведений об архитектурных сооружениях Запада, Монферран испрашивает командировку за границу, куда отправляется вместе с архитектором К. Тоном. Как указывалось в отчете Академии художеств, «им поручено было вновь осмотреть знаменитейшие или известные уже храмы в Европе, дабы воспользоваться великими и изящными изделиями для достойного довершения и украшения возводимых ими храмов».
Полученные в поездке впечатления Монферран успешно использует в дальнейшей работе над проектом внутреннего убранства.
К середине XIX века стал отчетливо проявляться упадок классицизма. В архитектуре усиливаются тенденции к объединению и использованию элементов различных стилей, которые ярко проявились в оформлении интерьера Исаакиевского собора: облицовка стен и пилонов выполнена в соответствии с традициями классицизма, убранство сводов пронизано духом итальянского барокко XVII века, а оформление дверей создано под влиянием произведений ренессанса.
Главный иконостас.
Но несмотря на отсутствие стилевого единства, монументально-декоративное убранство собора обладает большой художественной ценностью, а его детали поражают совершенством исполнения. Внутреннее оформление отличается исключительной красочностью и богатством материалов: великолепием узорчатого пола, нарядных, одетых цветным мрамором стен, изяществом золоченых скульптур и многообразием тончайших цветовых нюансов мозаик и живописных картин, украшающих своды, стены, иконостасы.
Для внутреннего убранства собора характерно широкое применение цветного декоративного камня; богатейшую красочную палитру составляют полудрагоценные камни и различные облицовочные мраморы. Его расположение лишь отчасти соответствует монферрановскому проекту внутреннего оформления, так как в ряде случаев по личному распоряжению архитектора уже в процессе работы вносились изменения. Облицовка стен натуральными мраморами доходит до большого карниза. Аттик имеет облицовку из искусственного белого мрамора. Это было вызвано экономическими соображениями. Монферран настаивал на более дорогой отделке, но ввиду того, что аттик находился на большой высоте и практически доступ к нему исключался, остановились на более дешевой облицовке из искусственного мрамора.
Большая часть стен покрыта светлым итальянским мрамором. Изысканностью отличаются беломраморные рамки икон в нишах, оформленные сложнейшей резьбой. Филенки, медальоны и меандры сделаны из итальянских мраморов - желтого из Сиены, зеленого из Генуи и красного с темными прожилками мрамора «гриотто» из Южной Франции. При отделке интерьера был широко применен отечественный декоративный камень. Из серого мрамора, добывавшегося близ Выборга, выложен пол.
Фриз вокруг всех пилонов и стен на полу, так же как и фриз большого карниза, идущего по всему периметру собора над пилястрами, исполнен из редкого по красоте камня - шокшинского порфира, добывавшегося на берегах Онежского озера. Из-за необыкновенной твердости этот камень трудно поддается обработке, но после полировки он дает прекрасный, долго сохраняющийся блеск. Этим же камнем в виде огромных плит выложен пол всего пространства между иконостасом и балюстрадой, которое называется солеёй.