Выступления против Моголов не прекращались, хотя хронисты и не отметили в то время крупных народных движений. В Пенджабе продолжали укрепляться сикхи, несмотря на три карательные экспедиции, направленные против них Шах Джаханом (1629, 1630, 1631 гг.). В Бенгалии непрерывно продолжалась вооруженная борьба с «разбойниками». В Доабе имели место крестьянские волнения, и против крестьян в 1629 г. были посланы войска, а в 1650 г. там же восстало племя мевати, которое бежало в джунгли; 10-тысячная армия Моголов, прорубив дорогу в джунглях, сожгла деревни мевати, а их самих увела в плен.
Народные выступления вели к сокращению поступлений налогов в казну. Голконда не платила Моголам той дани которую обязалась выплачивать в 1636 г. Между тем оскудевшая могольская казна рассчитывала на эту дань, поскольку Голконда была богатым государством. Характерной особенностью экономической жизни Голконды была сдача почти всего поземельного налога и всяческих сборов на откуп. Эта система была разорительна как для крестьянского, так и для городского населения. Однако она давала богатому человеку больше возможностей купить себе важную должность и стать сановником-феодалом. Так, разбогатевший персидский купец Мухаммад Сайд Ардистани содержал в Голконде крупный военный отряд, отвоевал часть Карнатика у княжества Виджаянагар, начал разрабатывать алмазные копи и стал главой финансового ведомства (мир джумла) Голконды. Он вошел в историю под этим должностным наименованием, которое и стало впоследствии его именем. Постепенно сосредоточив в своих руках все высшие должности, Мир Джумла превратился фактически в правителя государства. Между шахом Голконды и его могущественным сановником начались трения. В результате Мир Джумла тайно перешел на службу к Моголам.
Тогда шах Голконды заключил в темницу сына Мир Джумлы (1656 г.), что стало предлогом для вторжения Аурангзеба. Могольские войска ворвались в столицу Голконды — Бхагнагар (ныне Хайдарабад); шах заперся в крепости. Моголы осаждали ее два месяца, пока не был подписан мир, по которому часть территории Голконды отошла к Моголам, а население вынуждено было платить большую контрибуцию. Разграбление столицы и тяжелая дань привели к резкому повышению налогов; с этого времени начался экономический упадок Голконды.
После подчинения Голконды Аурангзеб с помощью войск Мир Джумлы вторгся в Биджапур. Однако в то время (1656 г.) тяжело заболел Шах Джахан. Поскольку в Индии не существовало права первородства и каждый сын падишаха имел равные права на престол, между сыновьями Шах Джахана началась борьба за трон. Любимцем Шах Джахана был его старший сын Дара Шукох, очень образованный человек, склонный к мистицизму. Он был связан с индусскими «святыми людьми» и писал суфийские сочинения, мечтая о слиянии ислама и индуизма. Однако он не имел боевого опыта, так как Шах Джахан продержал его всю жизнь при дворе. Его опорой были индусы-раджпуты, ожидавшие с его воцарением возврата к Акбаровой политике веротерпимости.
Другой сын Шах Джахана — Шах Шуджа был много лет наместником Бенгалии. Получив ложное сообщение о смерти Шах Джахана, он сразу же короновался и направился со своей армией в Агру. Дара Шукох разбил его войска. Однако, пока армия Дары была занята в Бенгалии, против него выступили другие сыновья Шах Джахана — Мурад, наместник Гуджарата, и Аурангзеб, наместник Декана. Борьба между четырьмя сыновьями Шах Джахана продолжалась больше двух лет и закончилась победой Аурангзеба, нетерпимого мусульманина, который действовал не столько силой, сколько хитростью и жестокостью.
Правление Аурангзеба
Большую помощь Аурангзебу в борьбе за престолонаследие оказал Мир Джумла. Вступив на престол, коварный Аурангзеб поспешил удалить Мир Джумлу, назначив его наместником Бенгалии. Здесь Мир Джумла повел себя довольно активно. Он завоевал соседнее государство Ахом (в Ассаме). После смерти Мир Джумлы ассамцы восстали и изгнали из своей страны могольcкие гарнизоны.