Почвы подзолистые и дерново-подзолистые, преимущественно суглинистые. Значительно распространены дерново-среднеподзолистые почвы, отличающиеся сравнительно небольшой мощностью гумусового горизонта (15–20 см). На юге и юго-востоке развиты серые и темносерые лесные почвы, а также деградированные черноземы. К выходам пермских известняков и доломитов приурочены перегнонно-карбонатные почвы, а к долинам рек — аллювиальные. Встречаются торфяно-подзолистые и торфяно-болотные почвы.
Растительность представлена темнохвойными и хвойно-широколиственными лесами, состоящими из ели, пихты и липы. Песчаные почвы покрыты сосняком. На месте вырубленных хвойных и хвойно-широколиственных лесов располагаются вторичные березовые и березово-осиновые. На Уфимском плато значительные пространства заняты степной и луговой растительностью.
В пределах провинции карстуются сульфатные и карбонатные породы артинского и кунгурского ярусов нижней перми. Особенно интенсивно карст развит на участках распространения сульфатных пород.
Наиболее широко распространены воронки, достигающие 100–120 м в диаметре и 25–30 м глубины. Плотность их местами составляет 300–500 на 1 км2. При слиянии отдельных воронок нередко образуются крупные карстовые котловины до 400 м в поперечнике и 30 м глубины. Особое положение занимают обширные (до 4 км длины и 100 м глубины) котловины типа польев — Дикоозерская, Мазуевская, Бурцевская и др., расположенные на восточном склоне Уфимского плато. Формирование их связано с интенсивным выщелачиванием гипсов кунгура вдоль контакта с карбонатными породами подземными водами, стекающими с центральных частей плато. Среди карстовых суходолов выделяется суходол на р. Яманьелге, которая на протяжении 60 км течет под землей. Здесь же расположен крупнейший в Советском Союзе карстовый источник Красный Ключ, имеющий среднегодовой расход 12,46 м3/сек.
Подземные карстовые формы представлены пещерами, полостями и кавернами. Каверны и полости, развитые в гипсах и известняках, достигают иногда 5–10 м в поперечнике. Они полностью или частично заполнены глинистым материалом или кальцитом. Особенно широко подземные полости распространены в долинах рек. В долине р. Сылвы, например, на глубине 20–27 м в гипсах кунгура бурением вскрыты полости до 6 м в поперечнике, а в долинах рек Кишерти и Мазуевки полости такого же размера, по которым в виде разобщенных потоков циркулируют напорные воды, были выявлены на глубине 50–90 м. Интересны древние погребенные карстовые воронки и котловины, выполненные мезозойскими и палеогеновыми отложениями. На интенсивное развитие древних карстовых процессов указывают также карстовые брекчии на восточном и западном склонах Уфимского плато.
Глубинный карст выражен несколькими ярусами палеозойского палеокарста. Наиболее глубокие карстовые образования отмечаются скважинами в девонских карбонатных породах близ селений Ярино, Полазны, Кунгура и Орды на глубине 1800–2200 м.
Уфимско-Камская карстовая провинция подразделяется на два карстовых округа: Бельско-Чусовской и Уфимский, которые в свою очередь делятся на семь карстовых районов.
Бельско-Чусовской карстовый округ охватывает равнинную территорию, протянувшуюся вдоль Уфимского плато. В округе четыре карстовых района: Бирский, Иренский, Сергинский и Полазнинский.
Бирский карстовый район расположен между рекамп Белая, Уфа и Тюй. Карст отмечен на Тегерменевском, Благовещенском, Уфимском и других участках, где карстуются сульфатные и карбонатные породы нижней перми. Лучше всего карст изучен на Уфимском участке в междуречье Белой и Уфы. Здесь особенно интенсивно закарстованы правые крутые склоны долин рек, где гипсово-ангидритовая толща кунгура выходит на поверхность. Наиболее известен Уфимский Косогор, характеризующийся активным развитием карстовых процессов. Детальное описание его было проведено еще в 1897, 1899 гг. Д. Л. Ивановым, выявившим вдоль железной дороги на протяжении 38 км 20 провалов диаметром до 7 м и глубиной до 8 м, образовавшихся с 1890 по 1894 г. Среди поверхностных форм многочисленны воронки, достигающие 100 и даже 200 м в диаметре и 20 м глубины. Плотность их составляет 15–20 на 1 км2. Ежегодно отмечаются провалы. На Уфимском Косогоре выделяется провал глубиной 14 м и объемом 8000 м3, возникший в 1927 г. Встречаются колодцы глубиной до 17 м (с. Ново-Турбаслы). Наиболее крупная котловина расположена в г. Уфе. Диаметр ее около 400 м, а глубина 60 м. На дне котловины находится понор. В обрывах рек обнаружены небольшие (до 10 м длины) пещеры. Буровыми скважинами выявлены подземные карстовые полости, приуроченные к зоне вертикальной и горизонтальной циркуляции подземных вод. Полости обычно сложены суглинками, глиной и мелкозернистым песком. У Софроновской пристани при строительстве моста через р. Белую на глубине 14 м была вскрыта полость поперечником в 6,5 м. Широко развиты древние карстовые воронки и котловины, выполненные неогеновыми и четвертичными отложениями. Некоторые из них достигают 400 м в диаметре и 60 м глубины.
На Благовещенском карстовом участке большой интерес представляют пещеры, развитые в гипсах кунгура. Наиболее крупная из них (длина 300 м) расположена на правом берегу р. Белой, в 2 км выше г. Благовещенска.
Иренский карстовый район охватывает бассейн р. Ирени. Карстуются гипсы, ангидриты, известняки и доломиты кунгурского яруса нижней перми.
Карстовые формы представлены каррами, воронками, понорами, котловинами, слепыми логами, суходолами, рвами и пещерами. Особенно широко распространены воронки, достигающие иногда 120 м в диаметре и 25 м глубины. Они распределены, однако, крайне неравномерно. В некоторых местах плотность воронок составляет 200–250 на 1 км2. Много свежих провалов, нередко имеющих вид глубоких (до 16 м и более) колодцев. Иногда они вскрывают крупные подземные полости. Так в пос. Бабинская Гора, расположенном на правом берегу р. Бабки, в 1957 г. образовался карстовый провал диаметром 2 м и глубиной 10 м, который вел в полость длиной 220 м, выработанную в сульфатных породах кунгура. Карстовые котловины отмечены у селений Шляпники, Медянка и Суда, и самая крупная из них на левом берегу р. Ирени, у д. Пихтари. Длина ее около 1000 м, ширина 700 м и глубина 10 м. Дно котловины усеяно блюдцеобразными воронками, заполненными водой или заболоченными. Другая крупная котловина расположена в нижнем течении Ирени, в 2,5 км южнее Новой Деревни. Она имеет овальную форму (длина 350 м, ширина 200 м и глубина 15 м).
К исчезающим рекам относятся Тураевка, Малый Телес, Аспа, Судинка и др. Суходол на р. Судинке имеет протяженность около 650 м. Длина суходола на р. Тураевке — 1200 м. Широко распространены слепые лога, закапчивающиеся обычно крупной карстовой воронкой с понором на дне. Примером может служить лог, находящийся южнее д. Верхний Кунгур. Длина его около 400 м, ширина до 50 м. Он расположен перпендикулярно долине р. Кунгур и закапчивается двумя слившимися крупными коническими воронками с понорами на дне. Сток в логу идет по к долине р. Кунгур, а в обратном направлении — к воронкам. Такие же лога отмечены у Красного Ясыла и Орды. На склонах долин Ирени и Бабки, близ селений Неволино, Мериново, Саркаево, Казаево и Ергач, развиты карстовые рвы, приуроченные к трещинам разгрузки. В низовьях р. Ирени, на правом склоне Патрина лога, в обнажении гипса обнаружены небольшие карры. Среди карстовых пещер выделяются Нижнемихайловская 2 (длина 721 м), Уипская ледяная (длина 400 м), Пономаревская (длина 185 м). Нижнемихайловская 1 (длина 140 м) и Дмитриевская (95 м).