Путешествие по Сибири произвело огромное впечатление на Нансена. Вернувшись на родину, он выпустил книгу «По Сибири» (1914 г.), в которой предсказывал этому району огромное будущее. «Наступит время,— писал Нансен, — она проснется, проявятся скрытые силы, и мы услышим слово о Сибири. У нее есть свое будущее. В этом не может быть никакого сомнения». И такое будущее наступило, оно строится руками советских людей.
После разрыва унии и ухода с поста норвежского посланника в Лондоне Нансен не занимался политической деятельностью. Правда, в январе 1909 г. он был среди тех, кто подписал воззвание партии «Свободомыслящие венстре». Однако он не принимал непосредственного участия в политической борьбе, хотя и не упускал возможности высказать в печати свое мнение по вопросам, волновавшим норвежскую общественность. В поддержке Нансеном партии «Свободомыслящие венстре», выступавшей против прогрессивных социально-экономических реформ, проявилась консервативность его взглядов на внутриполитические вопросы. В последующие годы позиция Нансена в области внутриполитической жизни еще более сдвинулась вправо.
Начало первой мировой войны для Нансена не было неожиданным. Он видел обострение противоречий и нарастание напряженности в отношениях между великими державами. В феврале 1914 г., в то самое время, когда премьер-министр Норвегии заявил, что «небо безоблачно», Нансен уподоблял международное положение вулкану, который может в любой момент взорваться.
В первые годы войны Нансен уделяет большое внимание вопросу укрепления обороноспособности Норвегии, исходя из того, что маленькая страна, только будучи хорошо вооруженной, сможет сохранить свою независимость и нейтралитет. В 1915 г. он избирается президентом Союза обороны Норвегии и активизирует свою деятельность, стремясь задачу усиления норвежских вооруженных сил сделать общенациональной.
Вступление Соединенных Штатов Америки в войну и политика эмбарго, проводившаяся ими в отношении нейтральных стран, заставили Норвегию послать в июле 1917 г. в Вашингтон специальную комиссию для переговоров об урегулировании вопросов о поставках в Норвегию продовольствия и сырья. Возглавлял ее Нансен. Назначение это не было случайным. В правительственных кругах существовало мнение, что только Нансен сможет добиться наиболее благоприятных для Норвегии условий торговли с США, которые поставляли Норвегии основную долю зерна. Нансен блестяще справился с порученным ему делом. После длительных переговоров, проходивших в сложной политической обстановке, ему удалось подписать с США весьма выгодное для Норвегии торговое соглашение.
Зародившаяся к концу войны на основе широкого распространения пацифизма идея создания Лиги наций нашла горячий отклик и в Норвегии; в октябре 1918 г. там была создана «Организация содействия Лиге наций». Председателем этой организации был избран Нансен, который принял активное участие в разработке норвежских предложений по программе работы Лиги наций, выступив как последовательный борец за мир и предотвращение новой войны. «Первой и наиболее важной задачей Лиги наций,— указывал Нансен,— является создание таких условий, которые обеспечивали бы мир на Земле и навсегда исключили бы возможность новой войны и повторение пережитых ужасов». По мнению Нансена, Лига наций должна была создать в международных отношениях новый порядок, опирающийся на международное право и закон, а не на силу. Нансен предупреждал об опасности новой мировой войны, указывая, что она будет еще более разрушительной и еще более опасной для человечества. Для предотвращения новой войны Нансен считал необходимым провести разоружение, причем главную роль в осуществлении этого мероприятия должна была сыграть Лига наций.
Весной 1919 г. Нансен едет сначала в Лондон, а затем в Париж пропагандировать норвежские принципы работы Лиги наций. Хотя основные принципы работы Лиги наций были заблаговременно оговорены державами-победительницами, тем не менее именно благодаря усилиям Нансена на обсуждение планов работы Лиги наций были приглашены нейтральные страны.
Занимаясь вопросами Лиги наций, Нансен одновременно с большим интересом следил за событиями в России. Он убедительно призывал западные державы прекратить блокаду Советской республики и положить конец вмешательству в ее внутренние дела. В апреле 1919 г. Нансен направил идентичные письма Вильсону, Клемансо, Ллойд-Джорджу и Орландо с предложением создать комиссию из представителей нейтральных государств с целью обеспечения Советской России продовольствием и медикаментами. Нансен информировал об этом Советское правительство. Условия, выдвинутые Антантой в ответ на предложение Нансена, были неприемлемы для Советской республики, так как означали для нее капитуляцию перед силами контрреволюции и интервенции. Отмечая неприемлемость условий Антанты, подменившей гуманные цели Нансена своими политическими происками, Советское правительство выразило глубокую благодарность Нансену за проявленное им горячее участие в судьбе русского народа.