После Гражданской войны И.Н. Дубовой продолжал (до 1924 г.) командовать 44-й стрелковой дивизией. С июня 1924 г. – командир 14-го стрелкового корпуса. В 1929 г. окончил Курсы усовершенствования высшего начальствующего состава (КУВНАС) при Военной академии имени М.В. Фрунзе. С октября 1929 г. – помощник, а с декабря 1934 г. – заместитель командующего войсками Украинского военного округа. С мая 1935 г. – командующий войсками Харьковского военного округа. На киевских маневрах 1935 г. командовал одной из сторон, получив высокую оценку от наркома обороны СССР.
Член ЦИК СССР. Член ВУЦИК. Член Военного совета при наркоме обороны СССР. Награжден орденом Красного Знамени (1920). Знак ордена № 2259.
Как уже известно, в том числе со слов В.М. Примакова, большая личная дружба, еще со времен Гражданской войны, связывала И.Н. Дубового и И.Э. Якира. Это Иван Дубовой в 1919 г. со своей 44-й дивизией стремился облегчить выход из окружения Южной группы войск 12-й армии во главе с Ионой Якиром; это И.Н. Дубовой в течение пяти с половиной лет был помощником и заместителем И.Э. Якира в Украинском военном округе, исполняя его обязанности во время длительного отсутствия последнего. Они дружили не только лично, но и семьями. Поэтому для И.Н. Дубового было большим ударом известие об аресте И.Э. Якира. Еще большее потрясение он испытал, прибыв на заседание Военного совета при наркоме обороны и прочитав его показания, а также показания других арестованных. Первое впечатление было – этого не может быть! Высшие руководители Красной армии – шпионы, вредители, диверсанты! Уму непостижимо! Но как не верить органам НКВД, этому преемнику и продолжателю дел ВЧК – ОГПУ – бдительному и надежному оку партии, карающему органу революции. К тому же все признания написаны рукой подследственных! Голова идет кругом! Верилось и не верилось!..
Иван Наумович долго не мог оправиться от этого удара, понимая, что дружба с Якиром скажется и на его судьбе. Откреститься от этой дружбы он не мог – она была известна не только в среде командиров округа, но и в Москве, среди руководства Наркомата обороны. А вот как обезопасить себя от наветов, от облыжных обвинений, от того, что на самом деле не было? Об этом надо было думать, думать…
Приведем выступление И.Н. Дубового (выдержку из стенограммы) на утреннем заседании Военного совета при наркоме обороны 2 июня 1937 г. (обсуждалось раскрытие органами НКВД «военно-фашистского заговора» в Красной армии).
«ДУБОВОЙ. Товарищи, многие из выступавших здесь говорили о том, что стыдно нам, что мы так позорно просмотрели врагов. Здесь я должен сказать о себе. Я работаю на Украине давно, с 1919 г., после Царицына. Я пять лет командовал корпусом, когда Якир командовал округом, и пять лет был у него заместителем. Замечал ли я что-нибудь? Я должен откровенно сказать, ничего абсолютно не замечал. Мы все считали его, и в том числе я, лучшим представителем партии, партийным командующим. Все же мы его называли нашим лучшим партийным командующим.
ГОЛОС С МЕСТА. Это Украина называла.
ДУБОВОЙ. Не знаю, может быть, Украина. Но я от многих это слышал.
СТАЛИН. Он умел здорово в кишки залезть.
ДУБОВОЙ. Ведь факт, что на целом ряде совещаний, на любых разборах мы в рот Якиру смотрели, когда он говорил. (Шум в зале). Ну хорошо, я смотрел. Виноват, но смотрел.
СТАЛИН. Он считался одним из лучших командующих.
ДУБОВОЙ. Да, товарищ Сталин, он считался одним из лучших командующих. Для меня сейчас многое становится ясным. Помните, Климент Ефремович, что вы сказали ему в 1933 г. на маневрах под Антонинами? Помните, на банкете Демичев произнес тост за Якира, и в вагоне, где ехали я, Хаханьян, Якир и Буденный, вы его прорабатывали? Ведь тогда Якир плакал и просил у вас прощения.
СТАЛИН. Почему он плакал?
ДУБОВОЙ. В 1933 г., после маневров, на банкете Демичев произнес тост: “Предлагаю выпить за хозяина нашего украинского округа товарища Якира!”