Некоторое время старый и новый Ладожские каналы функционировали одновременно, обеспечивая пропуск судов в обе стороны: по новому каналу суда и плоты шли в сторону Петербурга, по старому - из Петербурга. В настоящее время Новоладожский канал используется для местных сообщений и перевозки леса в плотах. Берега Новоладожского канала сильно разрушаются, так как не соблюдаются правила судоходства, запрещающие судам превышать скорость 8 километров в час. Ежегодно со дна канала вычерпывается 600 - 800 тысяч кубических метров грунта.
Вышневолоцкая и Тихвинская системы не могли справиться с растущим потоком грузов в Петербург. В 1799 - 1810 годах был построен более глубокий, не имевший опасных порогов водный путь - Мариинская система. В нее вошли: река Шексна, Белозерский канал, река Ковжа, Мариинский канал и низовье реки Вытегры. Шлюзы Мариинской системы - их было от Рыбинска до Вытегры 39 - первоначально были приспособлены для пропуска судов длиной 12 - 13 саженей, шириной 4 сажени и грузоподъемностью 10 тысяч пудов. Движение по Мариинской системе было очень медленным, в шлюз и из шлюза суда затаскивались бурлаками. Путь от Рыбинска до Петербурга занимал более 100 дней. Деревянные сооружения Мари-инки выдерживали лишь 30 - 40 лет, за это время они изнашивались и сгнивали. В XIX веке Мариинская судоходная система трижды перестраивалась. В конце 80-х годов перед очередной реконструкцией Мариинка пропускала за всю навигацию около 5 тысяч судов (33 судна в сутки через шлюз).
В 1870 году в министерство путей сообщения поступило прошение от петербургского и рыбинского купечества о предоставлении им прав на реконструкцию Мариинского водного пути. Просьба не была удовлетворена. Коренное переустройство Мариинской системы началось лишь в 90-х годах прошлого века. Нужно было спрямить, углубить и расширить реки и каналы, перестроить все шлюзы и приспособить их для пропуска судов длиной 30 саженей, шириной 4,5 сажени и грузоподъемностью 40 тысяч пудов. Переустройство пути производилось без перерыва судоходства. На Всемирной выставке в Париже в 1913 году реконструированная Мариинская система была отмечена Большой золотой медалью как выдающееся инженерное достижение. Благодаря Мариинской системе Ладога стала важнейшей артерией, по которой шли грузы для Петербурга и на экспорт. Это был главный «хлебный путь» в столицу. Кроме хлеба перевозилось большое количество леса, пиломатериалов, соли и других грузов.
С развитием водных путей совершенствовались и системы судов.
Наиболее древний тип ладожского судна - сойма. Издавна ладожские соймы строились на реке Паше и продавались в селе Сясьские Рядки. Существовали также верфи в Олонце и на Волхове. Сойма строилась из соснового леса, все крепления у нее были деревянные. На соймах по Ладожскому озеру плавали еще древние новгородцы. На соймах ходили и по озеру, и по рекам - до порогов. На реках плавали также тихвинки, унжаки, соминки. Они имели меньшую осадку, но даже их приходилось частично разгружать, чтобы преодолеть пороги на реках.
До постройки обводных каналов на Ладожском озере было развито парусное судоходство. Петр I основал в Лодейном Поле верфь для постройки больших парусных судов но голландскому образцу. С тех пор галиоты - так назывались новые суда - стали наиболее распространенным типом судов на Ладоге. Галиот - двухмачтовое парусное судно длиной 25 - 30 метров, шириной 8 метров и осадкой 3,5 метра.
Там же, в Лодейном Поле, строились более мелкие суда для плавания по озеру - гуккары, бриги, доншкоты. К Лодейнопольской, или как ее еще называли Олонецкой, верфи для постройки судов были приписаны вековые сосновые леса в бассейнах рек Паши и Сяси. После «ого как при Петре I Россия получила выход к Черному морю, «судовые умельцы» Олонецкой верфи принимали участие в создании Черноморского флота.
На Ладожских каналах ходили трешкоты - палубные суда с высокими бортами и надстройкой для кают. Двигался трешкот с помощью лошадиной тяги, и скорость его не превышала 4 верст в час. Тяга су-доз лошадьми была весьма распространенным промыслом, особенно среди жителей Новой Ладоги, где был перекресток водных путей, идущих с Волхова и ладожских каналов.
Большим и весьма частым бедствием этих мест была сибирская язва. В очень засушливом 1880 году от язвы погибли тысячи лошадей; грузы, шедшие в столицу, задерживались из-за недостатка тягловой силы. В связи с этим было разрешено на ладожских каналах для тяги судов привлекать бурлаков.