Hauptbuchstaben dienen als Code für Basiskonstruktionen und für ganze Flugzeugfamilien; sie sind keine sogenannten Gattungsbuchstaben, die eine bestimmte Flugzeugart charakterisieren, sondern Projektschlüssel, die zum Teil willkürlich ausgesucht werden, um in der Entwicklungsphase eine größtmögliche Geheimhaltung zu sichern. Verschiedentlich deuten sie auch auf besondere technische Merkmale hin, ohne etwas über die Gesamtkonzeption auszusagen.
Folgende Projektbuchstaben des OKB Mikojan für Flugzeugfamilien und Einzelkonstruktionen sind bisher bekanntgeworden:
A — für aus der MiG-3 hervorgegangene Gruppe von Höhenjägern;
D — für technologisch verbesserte Ausführungen der MiG-3;
F — für den ersten Strahlturbinen-Jäger;
Je — für Modifikation der MiG-3 als Frontjäger mit Sternmotor; für mehrere Flugzeugfamilien des Geschwindigkeitsbereichs von Mach 2 und Mach 3;
M — für ersten Entwurf eines zweistrahligen Überschalljägers;
N — für Jäger mit Mischantrieb (Übergangskonstruktion zwischen Kolbenmotor- und Strahlturbinen-Flugzeug);
R — für zweisitzigen, zweistrahligen, Allwetter-Abfangjäger auf MiG-15-Basis;
S — für ersten strahlgetriebenen Pfeilflügel-Jäger;
SD — für leistungsstärkere Ausführung des ersten Pfeilflügel-Jägers;
Sh — für Abfangjäger mit Raketenantrieb;
SI — für Weiterentwicklung des ersten Pfeilflügel-Jägers zu einem völlig neuen Basismuster;
SM — für die mit Projekt M begonnene erste Pfeilflügel-Überschalljägerfamilie.
Auch andere sowjetische Flugzeugbauer hatten einige dieser Schriftzeichen als Entwurfscode benutzt. Florow und Borowkow benannten 1941 mit D einen Experimentaljäger kombinierten Antriebes (ein Kolbenmotor mit Druckschraube und zwei Strahltriebwerke). Berijew zeichnete 1947/49 drei Flugboot-Entwürfe mit R aus. Suchoj signierte 1947 mit Je die Pläne für den vierstrahligen Bomber Su-10 und 1949 mit R die Pläne für den Überschalljäger Su-17.
Auf den Buchstaben S, schon häufig als Abkürzung der russischen Wörter samoljot (Flugzeug), skorostnyj (Schnell-), sanitarnyj (Sanitäts-) und swjasnoj (Verbindungs-) für Projekte der Sowjetluftfahrt gebraucht, stieß Mikojan erst als der Pfeilflügel aufkam, denn er eignete sich als Symbol für Pfeilung (strelowidnostj).
Über die Wahl mancher Projektzeichen des OKB Mikojan gibt es verschiedene Ausdeutungen. Hier seien einige Interpretationsbeispiele erwähnt:
F — für Flugzeug mit forciertem Antrieb (forsirowannyj dwigatelj);
D — für Weiterentwicklung (daljnejscheje raswitije);
SD — für Weiterentwicklung von S;
SI — für Pfeilflügel-Jäger;
SM — für modernisierten Pfeilflügel-Jäger;
Sh — für Flugzeug mit Flüssigkeitsraketenmotor (shidkostnyj raketnyj motor);
R — für Flugzeug und Radargerät (radiolokator).
Die bisher größten Entwicklungsreihen des OKB Mikojan, die der Mach-2- und Mach-3-Flugzeuge, erhielten den «nichtaussagekräftigen» neutralen Code Je, der schon einmal bei einer Modifikation der MiG-3 zur Anwendung gekommen war. Es ist durchaus möglich, daß dieses Je von den Wörtern Stück, Musteranfertigung, Einzelexemplar und Prototyp stammt (jediniza; jedinitschnyj exemplar).
Die OKB-Bezeichnungen für Versionen und Sonderausführungen einer Basiskonstruktion, für die einzelnen Versuchsmaschinen und für die weiterentwickelten Prototypen des Grundmodells werden durch große kyrillische Zusatzbuchstaben oder arabische Ziffern oder Zusatzbuchstaben und Ziffern vervollständigt, die man — in unterschiedlicher Anordnung je nach Flugzeugfamilie — dem Projekt-Hauptbuchstaben beifügt.
In der A- und in der D-Gruppe der Kolbenmotor-Jäger wurden die Modifikationen in Folge numeriert, wobei man die Ziffer ab zweiter Konstruktion dem Projekt-Hauptbuchstaben voranstellte und beim Ausgangsmodell auf die erste Nummer verzichtete (z. B. D, 2D).
Die Zusatzbuchstaben für die internen Bezeichnungen der Modifikationen des ersten Strahlturbinen-Jägers, die auf das Triebwerk (F, L, N), auf das Druckkabinensystem (R) und auf die zweisitzige Trainervariante (T) verwiesen, schlossen sich dem Entwurfscode F an, der auch die Grundkonstruktion signierte. Die Erprobungsmaschinen erhielten entsprechend ihres Baubeginns und ihrer bis auf drei Exemplare begrenzten Stückzahl die Nummern 1 bis 3, die den Buchstaben nach einem Bindestrich folgten (z. B. F-1, F-2, F-3; FR-1, FR-2; FT-1, FT-2).
In den OKB-Bezeichnungen der Konstruktionen der S-Flugzeugfamilie, deren Ursprungsmodell man ebenfalls nur nach dem Entwurfsindex benannte, wurden die Zusatzbuchstaben wie für die F-Reihe mit dem Projekt-Hauptzeichen gekoppelt und ihnen ab zweitem Versuchsmuster eine Typennummer angeschlossen und für deren Testmaschinen Baunummern bestimmt (z. B. SP, SP-1; ST, ST-7). Eine Besonderheit in diesen Bezeichnungen kann festgestellt werden: aus der SD- und SI-Gruppe abgeleitete Abfang- und Aufklärungsjäger trugen bei zusammengesetzten Buchstaben nur das S anstatt des SD oder SI, so daß die Kennzeichen aus zwei Buchstaben bestanden; die Zugehörigkeit zur SD- oder zur SI-Gruppe gaben deshalb andere, nicht für die engere S-Gruppe benutzte Ziffern an (z. B. SP-2, SP-5; SR-2).
Die Zusatzbuchstaben bezogen sich auf die Einsatzaufgaben und auf Ausrüstungs-, Bewaffnungs-, Zellen- und Triebwerkänderungen der modifizierten Versuchsflugzeuge. Sie wurden auch für die militärischen Typennamen der entsprechenden Serienmodelle übernommen.
Zusatzbuchstaben der S-Flugzeugfamilie besaßen folgende Bedeutung:
P — Abfangjäger (perechwatschik);
R — Aufklärungsjäger (raswedtschik);
T — Schulflugzeug (trenirowotschnyj samoljot);
U — Waffen-Schwenkvorrichtung (ustanowka);
W — Waffenverstärkung (woorushenije).
Die OKB-Bezeichnungen für die SM-Reihe differenzierten die einzelnen Prototypen hauptsächlich nach Musternummern, die den Hauptbuchstaben angefügt wurden (SM-1, SM-2, SM-3 usw.). Zusatzbuchstaben dienten nur teilweise als Kennzeichen von Experimentalmaschinen mit einem von der entsprechenden Ausgangskonstruktion Bewaffnungs-, Ausrüstungs- und Antriebssystem. Sie wurden nicht wie bei den F- und S-Modifikationen mit dem Generalcode verbunden, sondern an die Musternummer angehängt (z. B. SM-12, SM-12PM, SM-12PMU).
In den Je-Flugzeuggenerationen wurden und werden Prototypen und aus ihnen abgeleitete Versionen unabhängig vom vorgesehenen Einsatzspektrum späterer Serienausführungen durch Nummern unterschieden, denen lediglich bei Teiländerungen oder beim Bau mehrerer Versuchsmaschinen Buchstaben den OKB-Code ergänzten (z. B. Je-2, Je-2A, Je-4, Je-5; Je-150, Je-152, Je-152A).
Da die bisher für offizielle Rekordflüge eingesetzten Mikojan-Maschinen aus diesen Konstruktions-Reihen hervorgingen, gab man ihnen gleichfalls Je-Bezeichnungen, deren Nummern mit denen der Prototypen korrespondierten, unabhängig davon, ob diese Flugzeuge sich noch im Erprobungsstadium befanden oder bereits in Serie gebaut wurden und schon Truppenbezeichnungen besaßen.
Die Projektcode, Prototypen- und Rekordmaschinen-Marken mußten zeitlich limitiert werden, auf den Zeitraum 1942–1975 von der ersten OKB-Bezeichnung Je bis zur zuletzt annoncierten «firmeneigenen» Typenbezeichnung der MiG-25U-Rekordversion Je-133.