С малых лет Миша любил нитки и веревки, мог часами внимательно наблюдать за журчащей водой в ручье, огнем и высокими деревьями. Эти «детские страсти» (как он сам их называл) сыграли большую роль в его развитии.
В возрасте шести лет впервые попавшееся мальчику в руки Евангелие дало ему первый духовный опыт, оставивший глубокий след. За два года до своей смерти отец взял Мишу с собой, когда они вместе с жителями их села отправились рубить лес. Друг родителя дал ему Евангелие от святого Иоанна. Прочитав с интересом историю Иисуса, маленький Микаэль залился слезами: он понял, что в сравнении с Иисусом он — великий грешник. Ребенок дал себе клятву вести благородную и праведную жизнь, которая была бы угодна Богу.
Впоследствии мыслитель вспоминал, что больше всего в детстве он любил четыре вещи: нити, высокие деревья, воду (особенно родники) и огонь. Однажды он перерезал все нити на ткацком станке своей двоюродной сестры. Его матери потребовалась целая ночь, чтобы все поправить! Для него и на духовной плоскости все люди были связаны и опутаны невидимыми «нитями», как они скованы своими собственными наклонностями, бременем и страданиями. Айванхов говорил, что был рожден с мыслью — освободить людей от этих пут и помочь им восстановить и укрепить одну нить — золотую связь с божественностью, миром света и блаженства. Он хотел, чтобы люди нашли свое потерянное счастье и поняли, что его можно обнаружить только наверху и в чистоте.
Тем не менее, он еще не был достаточно подготовлен и обучен для такого высокого и трудного пути. Момент озарения и раскаяния вскоре затмила его мальчишеская игривость и шаловливость, со всеми ее глупостями и шалостями. Но такие мгновения всегда оставляют глубокий след в душе и никогда не проходят бесследно. Миша был резвым ребенком: столкновение с реалиями жизни в школе на какое-то время размыли его духовные устремления. «Я был отчаянным сорванцом», — признавался позднее Айванхов.
В 1907 г. родная деревня мальчика была сожжена и разрушена греческими националистами: мать Миши уехала с ним в болгарский город Варна, где его отец в это время искал себе работу.
В 1908 г. отец ребенка (в возрасте около 40 лет) умер от воспаления легких, и семья Ивановых осталась без средств к существованию. Позднее мать Миши вновь вышла замуж, чтобы прокормить и воспитать двух своих детей. В новом браке у нее появилось еще трое детей.
С ранних лет мальчик познал много профессий. Работал в кузнице, где любил смотреть на огонь и работу кузнеца, который придавал куску раскаленного железа новую форму. Но искры часто падали на его босые ноги и обжигали. Был портным, но недолго, ибо засыпал, настолько его приводила в оцепенение монотонная работа иглой. Устроившись на конфетную фабрику, он был счастлив, что хозяин разрешал ему на работе есть конфеты, и он не лишил себя этого удовольствия, но так заболел в первые дни, что все его детские мечты о сладостях, сбывшиеся только в этот момент, были забыты навсегда.
Как впоследствии отметил Айванхов, «возможно, трудности, которые приходилось преодолевать школьнику, пробуждали в его характере такие черты, которые потом помогли выстоять в сложных ситуациях и найти свое место в жизни. Чересчур комфортная жизнь усыпляет и расслабляет».
В 11 лет в Варне он во главе ватаги своих маленьких товарищей хотел поднять национальное знамя вместо знамени древних завоевателей над зданием турецкой дипломатической миссии. Никто не осмелился его наказывать. Люди были горды смелостью и патриотизмом этого ребенка.
Уже в это время юный Миша узнал силу своей мысли, своего подсознания: он начал заниматься медитацией. Другим открытием этого периода для мальчика оказалась Йога питания. В возрасте 14 лет, по его воспоминаниям, произошел один случай, который открыл ему наличие скрытых сил, заключенных в пище. Однажды утром его мать обнаружила, что ей нечего дать Мише на завтрак: мальчик уходил из дому на целый день. Она испекла небольшой колобок хлеба. Долия месила тесто со всей своей силой и молилась. Когда Миша вечером пришел домой, он спросил у матери, что она положила в хлеб: съев этот маленький кусочек, мальчик был сыт весь день. Мать ответила, что возносила молитвы.