В тот самый день, когда Журдан извещал о грозящей опасности, Веллингтон выступил в поход (12 июня). Мармон, вынужденный отступить к Дуэро, получил здесь кое-какие подкрепления и обратно перешел реку. Веллингтон отступил к Саламанке, преследуемый Мармоном. Обе армии двигались параллельно на расстоянии половины пушечного выстрела. Мармону следовало бы атаковать Веллингтона на ходу; но он дал ему вернуться в его лагерь у Альдеа-Нуэва и, не дожидаясь подкреплений, которые вел к нему Жозеф, дал битву на Арапильской равнине (22 июля). Он был ранен в бою, потерял 6000 человек и 9 орудий и отступил до Бургоса. Жозеф, поставленный в опасное положение отступлением Мармона, 10 августа покинул Мадрид и бежал в Валенсию, где призвал к себе андалузский корпус.
Пока Сульт, скрепя сердце, готовился эвакуировать Севилью, генерал Клозель, сменивший Мармона в португальской армии, вел блестящую кампанию против Веллингтона. Присоединив к себе гарнизоны Торо и Заморы, он медленно поднимался по направлению к Эбро; в цитадели Бургоса он оставил генерала Дюбретона, которого не было возможности выбить отсюда. В середине октября Сугам, преемник Клозеля, имел в своем распоряжении 40 000 человек; он взял Бургос и заставил Веллингтона перейти обратно Дуэро (25 октября).
Сульт снял осаду Кадикса 25 августа и на Гренаду и Гуэскар двинулся к Альмансе, где 2 октября соединился с центральной армией. 2 ноября Жозеф вернулся в Мадрид. 10-го все три французских корпуса – южный, центральный и португальский – были соединены в виду союзной англо-испано-португальской армии. У Сульта, Жозефа и Сугама было 70 000 человек пехоты, 10 000 конницы и 120 пушек. Жозеф хотел атаковать врага, но сражение не состоялось из-за нежелания Сульта. Веллингтон ушел назад в Португалию, но Андалузия была потеряна для французов.
Кампания 1813 года; отступление; битва при Витории. Нужны были подкрепления, а Наполеон не только не прислал их, но еще отозвал часть войск. Сюше сумел удержаться в завоеванном им краю и даже заставил Джона Меррея снять осаду Таррагоны, причем последнему пришлось бросить свою осадную артиллерию под стенами города (12 июня 1813 г.); но Жозефу удалось собрать только 66 000 человек пехоты, 10 700 конницы и 100 орудий для состязания с Веллингтоном, который имел под своим непосредственным начальством 120 000 человек. Едва англичане выдвинулись, как генерал Леваль поспешил очистить Мадрид и присоединиться к Жозефу, который с с 23 марта стоял в Вальядолиде.
Пользуясь своим численным превосходством, Веллингтон сделал попытку отрезать французам путь к Пиренеям. 2 июня французские армии соединились у Медина дель Рио-Секо, но обоз составлял бесконечный хвост, и спасаясь от мести соотечественников, за армией следовало более 10 000 преданных Жозефу (afrancesados) испанцев. 16 июня армия заняла позицию у Миранды. Некоторые генералы желали продолжать отступление к Туделе и Сарагоссе, но нужно было как можно скорее переправить во Францию багаж и эмигрантов; обоз начал тянуться к северу 20-го под прикрытием конвоя в 4000 человек. 21-го, когда еще отправка не была окончена, появились союзники, и пришлось, не дожидаясь подкреплений, которые вели Фуа и Клозель, дать при Витории сражение с 39 000 человек против 60 000. Бой был очень кровопролитный, враг потерял 5000 человек, французы оставили на поле битвы 7000 человек, 150 орудий и почти весь обоз; они снова успели собраться только в Сальватиерре. Жозеф отступил к Пампелуне, затем к Сен-Жан де-Люз. 2 июля армия обратно перешла Бидассоа. Клозель, вечером 21 июня стоявший уже в полумиле от Витории, отступил к Сарагоссе и Хаке. Сюше медленно очистил Валенсию. 12 июля Сульт прибыл в Сен-Жан-де-Люз, и Жозеф передал ему командование.