Узнав о решении Сандайме Хокаге устроить отборочные этапы, Сакура, как и все участники, удивляется этому решению. Девушка пытается убедить Саске не участвовать из-за его Джуина, но он игнорирует её, настаивая на том, что это его дело, а не её. Она с волнением наблюдает за его боем. После того, как Какаши блокирует печать Саске, Сакура спрашивает Какаши о состоянии товарища. Убедившись, что с ним всё в порядке, она радуется, пока не узнаёт о начале своего поединка. Противницей Сакуры становится Ино. В ходе боя, обе куноичи доказывают своё равенство в отношении друг друга. Также Ино следует раннему примеру Сакуры, отрезая свои волосы. Это оказывается уловкой, которая позволяет ей иммобилизовать Сакуру и взять над ней контроль при помощи Шинтеншин но Дзюцу. Таким образом, Ино собирается сдаться от её имени, но призывы Наруто приводят к пробуждению Учи Нару Сакуры, прогоняющей Ино из своего тела. Матч заканчивается обоюдным нокаутом.
Двойной нокаут
После боя, девочек, находящихся в бессознательном состоянии, уносят их учителя. После их пробуждения, Ино признаётся Сакуре, что та стала сильнее; она по-настоящему расцвела и возвращает ей её протектор. Сакура приятно удивлена похвале. Однако Яманака отмечает, что и далее не собирается уступать, в частности, в борьбе за Саске, после чего девушки злятся друг на друга. После этого, Сакура наблюдает за оставшимися матчами. Она подбадривает Наруто в поединке с Кибой; отмечает схожесть характеров Хинаты и Наруто, отмечая, что та наблюдала за ним. После поединка Ли с Гаарой, девушка пытается подбодрить проигравшего Генина, но её останавливает Какаши.
Несколько дней спустя Сакура приходит в цветочный магазин семьи Ино.[29] Они обе решают нанести визит Саске и Року Ли, получившему серьёзную травму. Узнав, что Учиха исчез, поскольку того уже забрал Какаши, они видят упорные тренировки Ли. Сакура узнаёт от подруги, что он больше не сможет стать ниндзя. Видя тяжесть его положения, Сакура оставляет ему цветок. В день финального этапа экзамена, Сакура беспокоится о Саске поскольку тот ещё не явился на поединок, особенно, когда он отсутствует в финальном этапе, где должен сражаться с Гаарой. Ино подбадривает девушку, и позже она поддерживает Наруто в поединке с Хьюга Неджи и радуется его победе. Печаль окончательно покидает её, когда Саске наконец прибывает на арену.
Крушение Конохи
Сакура защищает Саске
Матч Саске прерывается вторжением в Коноху и весь стадион покрывает Гендзюцу, в результате чего большая часть зрителей засыпает. Сакуре удаётся противостоять Гендзюцу и она становится свидетельницей нападения ниндзя Отогакуре. Она была спасена Какаши, который инструктирует её разбудить Наруто и Нара Шикамару. Какаши посылает их и Паккуна отправиться на помощь Саске, преследующего Гаару. Ниндзя Ото следуют за ними, поэтому Шикамару остаётся задержать их. Наруто и Сакура догоняют Саске вовремя, чтобы спасти его от нападения Гаары. Когда Сакура встаёт на пути Гаары, тот прибивает её песком к дереву, в связи с чем она теряет сознание. Она была освобождена после победы над Гаарой.
Несколько дней спустя, Сакура присутствует на похоронах Сандайме Хокаге.
Поиски Тсунаде
Сакура обнимает Саске
Сакура благодарит Саске за своё спасение, но тот исправляет её, говоря, что своей жизнью она обязана Наруто. В знак благодарности, она решает купить Наруто сладости. Когда Саске попадает в больницу после встречи со своим старшим братом Итачи, Сакура посещает его каждый день. Некоторое время спустя, в Коноху прибывает Годайме Хокаге, Тсунаде. Она исцеляет Саске и как только он приходит в себя, Сакура обнимает его со слезами на глазах. Спустя несколько дней, среди прочих жителей деревни, она присутствует на инаугурации Тсунаде на должность Годайме Хокаге.[30]
Описанные в этом разделе факты, персонажи, места и прочее встречаются исключительно в аниме.
Эскортная миссия в Ча но Куни
Команда 7 отправляется в Ча но Куни, чтобы защитить Морино Идате во время его гонки. Когда команда Оборо, а позже и Рокушо Аой пытаются остановить Идате, Наруто и Саске сражаются с ними, пока Сакура доставляет Идате в безопасное место. Саске в конце концов, проигрывает Аою, но Наруто удаётся победить его. После того, как Идате выигрывает гонку, команда 7 возвращается в Коноху.