Еще в сороковом году при подготовке партизанских баз его кандидатуру выдвинули на должность командира одного из партизанских отрядов. С началом войны Петр занимался организацией комсомольского подполья и развертыванием партизанского движения в Россонском районе, отряд Машерова вырос с тридцати человек до пятисот за первые три недели войны за счет отступающих частей. Несколько месяцев подпольщики вербовали сторонников и собирали оружие и боеприпасы. Одна из явочных квартир подпольщиков находилась в кабинете зубного врача Полины Галановой — его будущей жены. В первом же бою Машеров был ранен, некоторое время скрывался в Россонах, в квартире бывшей ученицы, вопреки возражениям других партизан.
В декабре сорок первого Советские войска нанесли удар по остаткам Группы армии Север и Группы Армии Центр, отбросив их к новой границе. Петра Машерова за успехи его партизанской бригады, состав которой составил около двух с половиной тысяч бойцов, неожиданно вызвали в Москву для награждения орденом Ленина. После награждения его пригласили в СМЕРШ к начальнику Главного Управления Шелепину, который и как руководитель Управления и как руководитель комсомола вплотную занимался организацией партизанского движения.
— Здравствуйте, товарищ Машеров! С орденом вас, вы свою награду честно заслужили. Садитесь, мы с вами ровесники, предлагаю перейти на ты, не против, Петр?
— Я только за, Александр. Я слышал тебя кандидатом в Политбюро ввели, поздравляю!
— Спасибо. Как ты смотришь на то, чтобы твою кандидатуру ЦК ВЛКСМ выдвинул на избрание вторым секретарем ЦК ЛКСМ Белорусской советской социалистической республики? Нам нужно, чтобы кто-то из руководства комсомола БССР отправился в штаб Партизанского движения в Беловежской пуще для сплочения молодежи, которая в большинстве своем является частью партизанского движения. Прием новых кандидатов в комсомол, подготовка их к сознательной подачи заявлений о приеме в Партию.
Машеров замялся и улыбнулся — Спасибо конечно за доверие, а что случилось с прежним вторым секретарем?
— Погиб при бомбежке, видно не все самолеты противника удалось уничтожить, хотя наш командующий авиации шлет победные реляции.
Петр вмиг стал серьезным — Я готов отдать свою жизнь там, куда направит меня Партия.
— Ну и отлично. Тогда предлагаю ознакомиться с оперативной обстановкой — я достал карту — Вот здесь находится штаб Партизанского движения.
14 января советские войска начали наступление, за 4 дня прорвали оборону противника на фронте 270 километров и продвинулись к западу на 100–130 километров.
16 января Варшавская группировка противника с севера была охвачена войсками 47-й армии (в составе Закавказского военного округа она прикрывала государственную границу СССР с Ираном. В начале войны армия заняла весь Иранский Азербайджан, в том числе города Ардебиль и Тебриз. Развивая наступление, армия овладела городом Дильман в 100 км к западу от Тебриза, а затем городом Урми. Армия была перегруппирована в район города Россошь). С юга на Варшаву нанесла удар 61-й армия, а с запада — 2-я гвардейская танковая армия. 19 января советские войска полностью освободили разрушенную, разграбленную и опустевшую Варшаву, взяв в кольцо три немецких дивизии.
Война закончилась 27 апреля сорок второго года капитуляцией остатков немецких войск Гитлер не успел провести полную мобилизацию своего населения за то короткое время, которое понадобилось СССР для продвижения к Берлину. Все это удалось благодаря полному контролю неба и своевременному изготовлению новой техники. Над Берлином и западной частью Германии небо контролировали истребители Москалева, своим фантастически выглядевшим треугольным крылом и немыслимыми скоростями нагонявших ужас на пилотов союзников. Англичане спокойно без всякого сопротивления высадились в Греции и во Франции. Вот только Сталин предупредил, что появление чужих самолетов над Германией будет расценено как агрессия и нарушители будут уничтожены. Англичане сделали вид, что не услышали, направив свои бомбардировщики бомбить доставшиеся СССР в целости и сохранности немецкие заводы.