В геноме SARS-CoV-2 есть специфическая вставка из 12 нуклеотидов на стыке субъединиц S1 и S2 шиповидного белка. Эта вставка имеет последовательность T-CCT-CGG-CGG-GC. Последовательность CCT кодирует пролин (P), две последовательности CGG — два аргинина (R), а GC — кодон GCA, который кодирует аланин (A).
Необычный сайт рестрикции BsaXI обрамляет характерный сайт расщепления фурином (PRRA). В 2017 году Барик подробно описал этот сайт рестрикции типа IIS. Из-за требований к последовательности BsaXI этот сайт рестрикции определял вставку пролина (P) и двойную последовательность кодонов CGG-CGG.26
В феврале 2019 года Барик получил разрешение от Международного комитета по биоэтике на отправку геномов в лабораторию Роки-Маунтин.27 Ранее Барик и Мюнстер использовали египетских летучих мышей (Rousettus aegyptiacus) в качестве подопытных, и в конце 2018 года они пришли к выводу, что «было бы интересно провести экспериментальное исследование с использованием китайских подковоносов… чтобы выяснить, можно ли добиться более эффективной репликации и выделения вируса».14
В феврале 2020 года на презентации в Капитолии США Барик предсказал: «В США могут быть виды-резервуары, у которых есть рецепторы ACE2. Так что, если вирус попадет сюда, у нас может появиться животный резервуар, которого нет у китайцев. И тогда он будет циркулировать здесь долгое время». Он предполагал, что этот вирус из Старого Света найдет свой дом в Новом.28
В нескольких рецензируемых научных статьях приводятся доказательства того, что SARS-CoV-2 появился либо в результате утечки из лаборатории в Ухане, либо в результате экспериментов в лаборатории в США. Эти доказательства можно разделить на две категории: геномные (in vitro) и передающие (in vivo). При изучении происхождения нового вируса его геном сам по себе не раскрывает всю его историю. Однако, изучая, как вирус передается и эволюционирует у разных видов, исследователи могут получить представление о его естественном происхождении или истории лабораторных экспериментов.
Европейский центр профилактики и контроля заболеваний (European Centre for Disease Prevention and Control, ECDC) зафиксировал: «Передача SARS-CoV-2 была успешно продемонстрирована на [американских] оленьих хомячках, египетских летучих мышах и [североамериканских] белохвостых оленях… Передача вируса на других видах животных не изучалась».29
Если геном был создан в одной лаборатории, а выпущен в другой, вирус, естественно, будет искать наиболее подходящего для себя носителя. Во время пандемии SARS-CoV-2 вирус «исследовал» каждый встреченный им вид, проверяя совместимость с его рецепторами ACE2. Это позволило выявить его способность передаваться ограниченному числу носителей. Иными словами, COVID-19 заражал многие виды, но эффективно распространялся лишь среди некоторых из них.
ECDC продолжил: “Критерием, используемым для классификации видов животных, вызывающих озабоченность в связи с эпидемиологией SARS-CoV-2, была способность выделять инфекционный вирус и передавать SARS-CoV-2 другим особям. Оценивались следующие виды: американская норка (Neogale vison), енотовидная собака (Nyctereutes procyonoides), кошка (Felis catus), сирийский хомяк (Mesocricetus auratus), хорек (Mustela furo), домовая мышь (Mus musculus, только для некоторых вариантов вируса), египетская плодовая летучая мышь (Rousettus aegyptiacus), виды оленьих мышей (Peromyscusspp., в Европе отсутствует) и белохвостый олень (Odocoileus virginianus)”.
Если бы SARS-CoV-2 появился на рынке морепродуктов в Ухане, его распространению способствовали бы млекопитающие, обитающие в Старом Свете. Однако, по данным Европейского центра профилактики и контроля заболеваний, в геномные базы данных не было загружено ни одной последовательности SARS-CoV-2, полученной от енотовидных собак. На основании геномного анализа ученые пришли к выводу, что зараженные люди, скорее всего, передавали вирус кошкам, хорькам и нескольким видам хомяков с минимальным риском обратного заражения людей и практически без передачи вируса от животного к животному. Лабораторные и домашние мыши были заражены только более поздними вариантами вируса.
Ранние варианты SARS-CoV-2 были протестированы в нескольких международных лабораториях, что стало примером разделения труда и знаний, напоминающим принципы сотрудничества, заложенные в SAGO. Каждая лаборатория, действуя в своих интересах, внесла вклад в коллективное изучение вируса. Эгоистичный ген мотивирует и человека, и его искусственно созданный геном.