Солдаты Боливара с успехом отражали одну за другой атаки всадников Бовеса. Казалось, победа близка. В этот момент стало известно, что Мариньо наконец-то решился идти на помощь Боливару. Со своим войском из трех с половиной тысяч солдат он разгромил Росете под Лос-Пилонесом, а теперь направлялся в Вилья-де-Кура — на соединение с армией Боливара. Бовес, узнав об этом, снял осаду с Сан-Матео и спешно повел войска наперерез Мариньо. В бою при Болачике Мариньо разбил Бовеса. Тем временем Боливар повернул назад, к Валенсии, и начал осаду города, который защищали испанцы под командованием Яньеса и Себальоса. Затем Боливар верхом на коне отправился в Ла-Викторию для встречи с Мариньо. Два себялюбца сумели прийти к соглашению, по которому роли распределились так: Мариньо остался во главе собственных войск, а Боливар отправился на помощь патриотам в Пуэрто-Кабельо.
Ситуация начала меняться к лучшему, но нетерпеливый Мариньо решил вступить в бой с армией Кахигаля под Ароа и потерпел поражение. Однако и это не стало ему уроком. Не дождавшись подкрепления от Боливара, он вновь напал на льянерос Бовеса около Ла-Пуэрты. Боливар поспешил ему на помощь, бой уже разгорелся. 15 июня 1814 года произошла вторая, более жестокая битва за Ла-Пуэрту. Всадники Бовеса стали сжимать войска Боливара и Мариньо с флангов. К наступлению ночи в схватке погибли около тысячи патриотов, еще триста были схвачены и казнены. Среди убитых были Кампо Элиас и главный советник Боливара Муньос Тебар. Генерал Фрейтас покончил с собой, чтобы избежать плена и пыток. Боливар, Мариньо и Рибас бежали в Валенсию. Они стремились организовать сопротивление в последней цитадели на пути Бовеса в Каракас. В этот момент Боливар осознал, что Вторая республика, как и Первая, обречена на поражение. Его грандиозные планы годичной давности, его триумфальный въезд в Каракас сейчас, после гибели тысяч и тысяч мирных жителей, выглядели чересчур наивными и романтичными. Поражение оказалось неизбежным, и то, что повинен в нем большей частью Мариньо, вряд ли могло утешить Боливара.
Командующий испанскими войсками Кахигаль приказал Бовесу действовать под его непосредственным руководством. Бовес нагло заявил, что он спас «оружие, боеприпасы и честь флага, которые Ваше Превосходительство оставил под Карабобо». С шестью тысячами всадников Бовес двинулся на Валенсию. Патриоты десять дней отбивали его атаки. Продовольствие и боеприпасы заканчивались. Бовес объявил условия мирного договора: патриоты должны сдаться, за это будут сохранены жизни солдатам и мирным жителям. Патриоты согласились.
Бовес въехал в город на коне и был встречен радостными приветствиями. В его честь в кафедральном соборе была отслужена месса. Во время мессы Бовес поклялся на Библии, что больше не прольет ни капли крови.
Но настала ночь, и началась смертельная вакханалия. Губернатор города был убит. Девушку, прислуживавшую в доме командующего войсками защитников города, солдаты Бовеса привязали к гамаку, в котором она обычно спала, и изнасиловали. Затем ей вырвали язык, отрезали груди и разожгли костер под гамаком.
Других женщин заставили присутствовать при чудовищной расправе. «Всех мужчин схватили и вывезли на окраину города. Их убивали, как быков, пронзая копьями. Они не могли даже помолиться перед смертью. Женщин принудили танцевать. Они глотали слезы и трепетали от страха. За их спинами били копытами лошади кавалеристов. Бовес размахивал хлыстом, понуждая их танцевать „пикирико“ и другие национальные танцы. Зверства продолжались несколько ночей».
Боливар поскакал обратно в Каракас. Он обратился к священникам города с просьбой пожертвовать церковную золотую и серебряную утварь для закупки оружия. Ему было даровано двадцать восемь тысяч унций серебра. Вскоре стало известно, что Боливар вместе с остатками своей армии собирается покинуть город. Двадцать тысяч жителей Каракаса в страхе, опасаясь за свою жизнь, оставили дома, выстроились в колонну и двинулись вслед за войском Боливара. В городе почти не осталось сторонников Боливара. Его впоследствии обвиняли в организации этого массового исхода, но, попади горожане в руки Бовеса, их участь была бы предрешена. Говорили также, что нужно было идти на запад, а не на восток, дабы объединиться с небольшой армией генерала Урданеты. Однако только на востоке, на побережье, людей ждало спасение.