Когда в 1718 году Боннет вновь обрел самостоятельность, он переименовал свой корабль в "Роял Джеймс", а себя стал называть капитаном Томасом. Боннет направился в Северную Каролину и получил там королевскую амнистию. Он выпросил у губернатора каперское свидетельство для борьбы с испанскими судами. Однако Боннет не ограничивал свои действия рамками каперской грамоты, а вскоре вновь стал захватывать все суда без разбора, в том числе и английские. Только вел он себя при этом чрезвычайно своеобразно. Например, с одного корабля он забирал весь провиант, оставляя нетронутые остальной груз; в качестве компенсации он отдавал капитану судна рис и старый такелаж. На других судах он брал то ром, то перец, то мясо или табак.
"Роял Джеймс" после длительного плавания стал давать течь, и, кроме того, возникла необходимость очистить дно корабля от ракушек; Боннет приказал посадить судно на грунт в устье реки. Когда о присутствии пиратов стало известно в Чарлстоне, губернатор направил против Боннета два восьмипушечных шлюпа под командованием полковника Рета. 26 сентября 1718 года Боннет после короткого сражения выбросил белый флаг и был взят в плен вместе со всей командой и доставлен в Чарлстон. Незадолго до начала судебного процесса, он, подкупив "с помощью большого количества серебра" одного из стражников, сумел бежать из дома тюремщика, где его содержали отдельно. Однако вскоре Боннет были вновь пойман полковником Ретом.
Адмиральский суд в Чарлстоне приговорил Боннета и 26 из 30 его сообщников к смертной казни. Так как на процессе Боннет держался так же двойственно, как и в своих пиратских делах, председатель суда Тротт представил подробное обоснование приговора. Он, в частности, заявил: "Майор Стеде Боннет, суд присяжных нашел вас виновным в занятии пиратством. Вас достаточно обвинить только в двух преступлениях. Вы ведь знаете сами, что с тех пор, как вы появились в Северной Каролине, вы захватили и частично разграбили по меньшей мере 13 кораблей. Поэтому уличить вас можно в 11 и более преступлениях, которые вы совершили после принятия королевской амнистии, когда вы дали обещание покончить со своей позорной жизнью". И далее: "Сколько невинной крови пролито людьми, которые оказали сопротивление вашему беззаконному насилию? Мы этого не знаем, но мы знаем, что вы лично убили 18 человек и многих ранили, когда вас хотели захватить из-за ваших разбойничьих действий". После многочисленных ссылок на библию (Тротт, по всей видимости, хорошо знал ее), рассчитанных на то, чтобы вызвать у Боннета чувство вины и раскаяния, судья в заключение произнес: "Исполнив таким образом свой долг христианина, я выполняю теперь свой долг судьи. Приговор, предусмотренный законом для вас и для ваших преступлений и выносимый настоящим судом, таков: вы, Стеде Боннет, должны отправиться в то место, откуда вы прибыли, и там вас отведут на эшафот, чтобы повесить, пока не наступит смерть. Да благословит бог в своем вечном сострадании вашу душу". 10 декабря Боннет был повешен. Немного раньше та же судьба постигла и 26 членов его команды. Оставленное каждым из них богатство не превышало нескольких фунтов. Действительно, быть пиратом под началом майора Боннета не имело большого смысла...
Высокообразованный француз Миссон, став пиратом почти за столетие до Французской революции, руководствовался примитивными представлениями о свободе, равенстве и братстве. Миссон был в свое время офицером французского военно-морского флота и плавал на борту корабля "Виктуар" ("Победа") под командованием своего родственника графа Клода де Фурбена, самого удачливого корсара в Средиземном море. Во время стоянки в Неаполе молодой Миссон получил разрешение побывать в Риме. Там он познакомился с монахом-доминиканцем Караччиоли, который, став атеистом, отвергал частную собственность и провозглашал права человека. Миссон и Караччиоли подружились. Караччиоли ушел из монастыря и поступил на французский корабль. Во время длительного плавания в водах Вест-Индии друзья подробно обсудили свои вольные идеи и даже заразили этими взглядами часть команды. В одном из кровопролитных сражений с английским военным кораблем "Винчелси" погиб командир французского судна. Тогда-то оба друга и решили, что наступил подходящий момент для осуществления их давно задуманного плана.