Большую активность в центре фашистского рейха развила нелегальная организация компартии берлинского района Адлерсхоф, во главе которой встал уполномоченный ЦК КПГ Вилли Галь. Организация насчитывала 150 активных антифашистов и сосредоточила свою деятельность на крупных предприятиях, производивших оружие, боеприпасы и снаряжение, — «Адреас машиненбау ГмбХ», АЭГ, самолетостроительных заводах концерна Хеншель в Шенефельде, «Шеринг АГ» и др. Особое внимание организация уделяла борьбе с нацистской пропагандой, политическому просвещению населения Берлина. В нелегальной типографии в ноябре 1939 года удалось отпечатать 200 экземпляров первого номера газеты «Берлинер фольксцейтунг». Всего было опубликовано 35 листовок и брошюр тиражом от 30 до 250 экземпляров. В начале 1940 года гестапо напало на след организации. 94 антифашиста были арестованы, Вилли Галь и его помощник Отто Нельше казнены.
Однако связь ЦК КПГ с антифашистским подпольем в Берлине не оборвалась. Ее осуществляли уполномоченные ЦК КПГ Эммерих, Хальмайер и Шмеер. Они действовали на промышленных предприятиях берлинского округа Моабит — заводах концерна Сименса, нефтеперерабатывающем заводе фирмы «Олекс», «Хольцман АГ» и др. Через учителя Курта Штеффельбауэра группа была связана с широким кругом интеллигенции. Организация была разгромлена гестапо накануне нападения гитлеровцев на Советский Союз — в мае 1941 года.
В берлинском индустриальном районе Нейкельн с 1938 года успешно действовала молодежная коммунистическая группа во главе с печатником Гейцем Капелле. Издаваемые группой нелегальные листовки широко распространялись среди молодежи района. Попав в руки гестапо, антифашисты показали несгибаемое мужество перед палачами. Последними словами Капелле были: «Да здравствует коммунистическая партия!»
В Дрездене ЦК КПГ осуществлял руководство борьбой с нацистами через антифашистскую группу, которую возглавляли строительный рабочий Альберт Хензель, художник Фриц Шульце и служащий Карл Штейн, в Лейпциге — через нелегальную организацию во главе с Артуром Харманом. Эта организация поддерживала регулярную связь с антигитлеровской радиостанцией за границей. В феврале 1940 года под руководством коммунистов Отто Хейслейна и Адама Лейса началось объединение в одну боевую организацию сопротивления антифашистов Франкфурта-на-Майне. Летом 1941 года 33 члена этой организации были арестованы гестапо.
Вплоть до нападения на Советский Союз гитлеровцам так и не удалось парализовать деятельность наиболее активных и опасных для нацистского режима антифашистских организаций, руководимых КПГ. Одна из них с 1936 года действовала под руководством рабочего-металлиста Роберта Урига в Берлине. Группа имела прочные постоянные связи с рядом крупнейших военных предприятий города. К весне 1941 года деятельность группы еще более расширилась и распространилась на 22 предприятия.
В активе организации насчитывалось 200 антифашистов. Руководство организации регулярно получало информацию от своих представителей на предприятиях и, в свою очередь, давало им необходимые инструкции, снабжало пропагандистскими и другими материалами. Осенью 1939 года сложился руководящий центр организации, его деятельность вплоть до ареста в августе 1940 года направлял из подполья уполномоченный ЦК КПГ Рудольф Хаймайер. Весной 1940 года группа Урига установила контакт с группой антифашистского сопротивления в вермахте, которой в Мюнхене руководил капитан Ремер, и вместе с последней стала выпускать информационный бюллетень. Он ориентировал антифашистское подполье, разъясняя стратегическую линию и тактические задачи КПГ в сложившейся обстановке. Несколько позднее группа Урига установила тесные связи с антифашистской группой, которой руководили коммунисты Грабовски, Грассе и Ион Зиг, а через нее с мощной антифашистской глубоко законспирированной организацией, возглавляемой офицером министерства авиации Шульце-Бойзеном и Харнаком.
В 1940 году вокруг Урига сложился единый центр всей партийной организации Берлина, который постепенно стал превращаться в общегерманский штаб антифашистского движения. Были установлены тесные связи и координированы действия с антифашистским подпольем в Дортмунде, Эссене, Гамбурге, Ганновере, Гильдесхейме, Лейпциге, Мюнхене и других городах Германии, налажены контакты с движением Сопротивления в Дании, Нидерландах, Австрии и Чехословакии.