На обратном пути на правом берегу Дуная в двух милях ниже Галаца с бронекатеров был высажен десант из состава 369-го отдельного Керченского батальона морской пехоты, который, прочесав местность и не обнаружив там противника, был принят снова на катера и доставлен в Рени.
После занятия Галаца частями Красной Армии 27 августа туда была перебазирована часть кораблей Дунайской флотилии, которые двигались вверх по реке, выполняя задачи по охране переправ армейских частей и обороне сооружений и плавсредств в различных портах. Кроме того, бронекатера отыскивали военные румынские корабли и плавсредства и конвоировали их в Измаил.
Утром 26 августа 384-й отдельный Новороссийский батальон морской пехоты переправился на бронекатерах через Килийское гирло, легко овладел пунктом Периправа и развил успешное наступление в сторону Сулины, при слабом и неорганизованном сопротивлении противника. К 18 часам того же дня 384-й батальон овладел с суши портом и северной частью города Сулина.
Для совместных действий с батальоном морской пехоты из Вилково через канал и Сулинское гирло в 10 ч. 30 мин. 27 августа было выслано семь бронекатеров, которые через 7 часов пришли в порт Сулина. К 19 часам того же дня город Сулина был занят. Гарнизон города, состоявший из 1400 солдат и офицеров, сдался.
В 16 часов 26 августа в порт Измаил на борт малого охотника МО-26 прибыли командир 3-го румынского стрелкового корпуса и командир румынской Дунайской дивизии контр-адмирал Стоянович, которые начали переговоры с Военным советом Дунайской флотилии. Командующий Дунайской флотилией отклонил предложение румын прекратить военные действия до прибытия комиссии румынского правительства, которая была назначена для переговоров с советским командованием о совместных действиях против германских войск на территории Румынии. Командующий Дунайской флотилией предъявил командующему румынской Дунайской дивизий ультиматум — к 12 часам 27 августа сдать в плен все корабли. Румынские представители приняли это требование и просили разрешения выехать в Меджидие для переговоров. В 21 час бронекатера №№ 121, 313, 322 и катера с румынским командованием прибыли в Тульчу.
Весь день 27 августа Дунайская флотилия перевозила войска 46-й армии 3-го Украинского фронта через Дунай в район Измаил — Тульча и Картал — Исакча. До 18 часов было перевезено 19 тысяч человек, 92 орудия, 270 автомашин, 6 тракторов, 1750 лошадей, 690 повозок, 35 полевых кухонь, а на левый берег Дуная вывезено 12 300 пленных.
Теперь основной задачей Дунайской флотилии стала поддержка речных флангов 57-й и 46-й армий, наступавших вдоль Дуная. Поэтому по приказу Сталина Дунайская флотилия с 12 часов 30 августа была оперативно подчинена командующему 3-м Украинским фронтом маршалу Ф.И. Толбухину.
30 августа в 12 часов в Измаил прибыли: подвижная батарея № 492 — две 122-мм пушки А-19, батарея № 524 — четыре 152-мм гаубицы-пушки МЛ-20 и зенитная батарея № 986 — четыре 85-мм пушки, а также из Вилково прибыли монитор «Железняков», плавучая батарея №4, бронекатера № 6, 12, 33, 331, три речных тральщика и полуглиссер.
К этому времени в составе флотилии находились:
— Керченская бригада бронекатеров (35 бронекатеров, из них 7 в ремонте);
— 4-я бригада речных кораблей (монитор «Железняков», 14 бронекатеров, из них 6 в ремонте, 16 минных катеров, из них 5 в ремонте, 12 речных тральщиков, из них один в ремонте, 26 полуглиссеров, из них 8 в ремонте, и плавбаза бригады «Мариуполь»);
— Сектор береговой обороны флотилии (четыре артиллерийские и одна минометная батареи, плавбатарея № 4 и 369-й Керченский отдельный батальон морской пехоты);
— 213-й отдельный зенитный артиллерийский дивизион (три зенитные батареи);
— 9-й отдельный авиационный отряд связи (семь самолетов, из них четыре У-2, один Ут~2, один Як-6 и один Пр-5);
— 64-й отдельный отряд дегазации и дымомаскировки (четыре катера со специальной дымообразующей аппаратурой).
В тот же день, 30 августа, четыре бронекатера Дунайской флотилии вышли из Браилова в район Чернавода для взаимодействия с частями 46-й армии 3-го Украинского Фронта.
31 августа малый охотник и два бронекатера с 30 бойцами морской пехоты вышли из Сулины для захвата острова Фидониси. В 12 часов отряд высадился и без сопротивления занял остров. Из 37 румын, находившихся на острове, три радиста были оставлены в подчинении начальника нашего поста, а остальные перевезены в Сулину.