Азовское море в сравнении со всеми другими морскими водоемами мира отличается самой большой интенсивностью воспроизводства биомассы (веса) растительных и животных организмов, находящихся в воде, которые служат кормом для рыб. В этом одна из важнейших причин высокой рыбопродуктивности Азовского моря. Однако постепенное осолонение моря ведет к ее снижению.
В дельте Дона и расположен Донской рыбный заповедник. Официальное его наименование — Донское постоянное запретное рыбное пространство.
Донской рыбный заповедник был создан в 1819 году указом царского сената от 20 февраля. Необходимость его создания в те годы была вызвана сословными интересами казачества, чтобы обеспечить проход ценным промысловым рыбам, идущим для икрометания к станице Елизаветинской и вышерасположенным населенным пунктам с казачьим населением. Этим ущемлялись интересы рыбаков-иногородних, живших в нижних участках дельты. Вместе с тем указ предусматривал и некоторые рыбоохранные мероприятия. Создание постоянного запретного пространства, таким образом, служило и такой важной задаче, как воспроизводство рыбных запасов Азовского моря. Обеспечивались концентрация производителей ценных промысловых рыб в дельте Дона и их охрана.
Большая рыбохозяйственная роль заповедника была затем подтверждена и дореволюционными исследованиями, а после революции — советскими учеными, что и определило такое его длительное существование. Особенно возросла роль заповедника после зарегулирования стока Дона Цимлянской плотиной.
Расположен заповедник в нижней части дельты и на прилегающей к ней акватории Таганрогского залива. Его морская граница — от восточной окраины села Приморка на северную оконечность Павло-Очаковской косы. Сухопутная граница проходит от села Приморка по северному побережью Таганрогского залива, правому берегу реки Мертвый Донец до железнодорожной станции Хапры, далее по прямой до начала ерика Бубнова (у хутора Дугино), затем по левому берегу ерика Бубнова до отделения от него ерика Кабачного, далее по правому берегу ерика Кабачного до впадения его в реку Большая Кутерьма. Отсюда граница идет по прямой на левый берег Большой; Кутерьмы к точке, находящейся в 400 метрах от притонка тони «Казачка», и по левому берегу Большой Кутерьмы до отделения от нее реки Каланчи, далее по прямой на юго-западную окраину хутора Донского, затем до правого берега устья гирла Песчаного, далее на юг — на левый берег гирла Песчаного, потом до правого берега устья реки Сухой Кагальник, рек Сухой и Мокрый Кагальник до Пешковской плотины, оттуда по южному берегу Таганрогского залива до северной оконечности Павло-Очаковской косы.
Площадь заповедника в настоящее время около 68 тысяч гектаров, из них морская часть занимает почти 40 тысяч гектаров, а протяженность гирл и ериков составляет более 400 километров.
Границы заповедника неоднократно изменялись, в основном в сторону их расширения. Существующие в настоящее время границы установлены правилами рыболовства в бассейне Азовского моря, утвержденными в 1976 году. В запретном пространстве запрещено всякое рыболовство.
Из всех водоемов дельты наибольшее рыбохозяйственное значение имеют основные ее русла — Старый Дон, Большая Кутерьма и Каланча. Они являются основными ходовыми путями и местами скопления для зимовки косяков рыб, идущих на нерест из Таганрогского залива: леща, судака, сазана и других видов.
Глубина отдельных зимовальных ям как на Каланче, так и на Большой Кутерьме достигает значительных величин, в частности, на Большой Кутерьме — 23–25 метров. Другие же рукава, гирла, протоки и ерики служат в основном местами нереста, а морская часть заповедника, имеющая малые глубины (менее 3 метров), является местом нагула молоди и взрослых особей промысловых рыб.
Сильно развитая гидрографическая сеть дельты, мелководье предустьевого пространства, благоприятные гидрологические условия выгодно отличают Донской заповедник от других постоянных запретных рыбных пространств.
Фауна и флора дельты Дона, следовательно и водоемов заповедника, весьма разнообразны, они оформились в результате взаимодействия Азовского моря и реки Дона.
Донное население (бентос) представлено большим комплексом ракообразных, моллюсков и червей. Богаты здесь также фито- и зоопланктон (растительные и животные микроорганизмы, обитающие в толще воды).
В последние годы в связи с осолонением воды Таганрогского залива произошли большие изменения в биоценозах беспозвоночных. Здесь стали появляться солоноватоводные организмы из центральных районов Азовского моря.