Во всех видах Вооруженных Сил определили НИИ, отвечавшие за эту тематику. Привлекли также ряд научных учреждений ВПК, фактическое участие которых было весьма ограниченным.
Для Академии наук программа исследований НЛО именовалась «Сетка-АН» и ставила своей целью исследование физической природы и механизмов развития АЯ. Головной организацией по линии АН был определен Институт земного магнетизма, ионосферы и распространения радиоволн, возглавляемый членом-корреспондентом АН В. Мигулиным, в котором тоже создали рабочую группу по АЯ в составе четырех человек во главе с Ю. Платовым.
Координацию исследований АЯ Министерством обороны и Академией наук осуществлял полковник Б. Соколов, работавший в так называемой Секции прикладных проблем.
В 80-е годы в стране создалась странная ситуация, при которой Министерство обороны серьезно занималось сбором данных об НЛО, тогда как Академия наук в лице Мигулина и Платова утверждала, что никаких НЛО не существует. С 1978 по 1990 год комиссией Мигулина зарегистрировано около 3000 сообщений о наблюдениях необычных явлений, из которых примерно 300 событий были квалифицированы как аномальные. «Не велось никакого обмена информацией по НЛО ни со странами Варшавского Договора, ни с НАТО», — заявил в 1990 году Главнокомандующий войсками ПВО генерал армии И. Третьяк.
Работа группы Абдулина в военном НИИ в Мытищах тоже сводилась в основном к сбору и анализу сообщений о наблюдениях НЛО, поступавших из войск. За 13 лет работы военным тоже лишь несколько раз пришлось выезжать для срочного расследования обстоятельств, связанных с вероятным вмешательством НЛО в деятельность воинских частей.
Правда, в воинской части № 73790 проводилась секретная НИР по НЛО, обозначавшаяся как «Нить-3». Чего стоит одно название этой НИР: «Обоснование концепций и прогноз ожидаемых результатов экспериментальных и теоретических исследований процессов функционирования нетрадиционных двигателей и их взаимодействия с окружающей средой». Можно представить, сколько сил и времени было затрачено только на придумывание такой наукообразной формулировки.
После ознакомления с этим названием НИР казалось, что уж тут-то дело будет обязательно связано с потерпевшими крушения НЛО. Ведь нельзя же вести исследования функционирования двигателей неопознанных объектов на пустом месте, не имея на руках ничего.
Судя по секретному отчету, составленному в 1991 году (краткое содержание опубликовано в Трудах симпозиума МУФОН в 1993 году), основная задача НИР «Нить-3» заключалась в проведении обширных исследований с целью понять, на каких принципах действуют двигатели неопознанных летающих объектов и сопровождающие их поля, о которых говорилось в описаниях очевидцев. Необходимо было также уяснить, каким образом могла быть создана такая технология и как извлечь из этого определенные технологические идеи.
В общем цель сформулирована очень правильно. Что же касается содержания самой НИР, то оно, к сожалению, этой цели совершенно не соответствовало. В отчете рассказывается, что наряду с большим числом объяснимых наблюдений НЛО имеется немало наблюдений, которые нельзя объяснить, ибо в них мы, возможно, столкнулись с пришельцами с других планет или из параллельных миров.
Далее приводится подробное описание истории исследований НЛО в СССР и указывается, что органы разведки США всегда интересовались, как у нас обстоит дело с такими исследованиями. Подробно описан ход исследований НЛО в США и приведены документы, свидетельствующие о засекречивании этой проблемы в Америке и, в частности, об операции «Маджестик-12». Описаны крушения НЛО в 1947 году в штате Нью-Мексико и в 1950 году вблизи мексиканской границы.
При анализе сведений о контактах с экипажами НЛО подчеркивается, что энлонавты выбирали для контактов людей малограмотных, с низким интеллектом, неспособных понять, что с ними в действительности произошло. Есть ссылки на встречи русских и американских космонавтов с НЛО в космосе.
Выражается уверенность в том, что американские астронавты встречались с НЛО на Луне, и высказывается предположение, будто полеты на Луну были прекращены из-за опасности исчезновения астронавтов. Подробно описаны маневры семи НЛО вокруг космического корабля «Восток-2», снятые на кинокамеру космонавтом Г. Титовым. В отношении многочисленных встреч самолетов с НЛО говорится, что их описания заняли бы несколько томов.
В газете «Известия» в 1993 году были помещены характеристики всех наших стратегических ракет, перечислены все районы позиций ракетных войск стратегического назначения и пункты базирования атомных реактивных подводных лодок с указанием количества и типов ракет. В условиях такого тотального рассекречивания конечно должны бы просочиться какие-то сведения о потерпевших крушения НЛО. Но они не просочились не в результате сохранения тайны, а потому, что их просто не было.