Слабым звеном обороны был правый или северный фланг, наиболее близко расположенный к траншеям республиканцев и обороняемый неаполитанскими солдатами. Дюгоммье лично встал во главе атакующих, вдохновляя их устремиться на третий приступ. Почти два часа сражение шло с переменным успехом, хотя первые шеренги наступающих дрогнули, задние подпирали, толкая вперёд. На левом фланге им дважды удавалось врываться за бруствер, защищаемый силами Британии и Пьемонта, но оба раза пришлось отступать с большими потерями. Справа французы приближались к успеху, однако получившие подкрепление неаполитанские солдаты сдержали напор и устояли. Несмотря на первоначальные успехи силы Дюгоммье были ослаблены, в отчаянии он считал штурм проваленным. Последней попыткой решившей исход боя, стал удар резервной колонны Мюирона, оборона неаполитанцев начала рушиться и, видя десятикратное превосходство противника в силах, они побежали.
В 3 часа утра республиканцы проникли в форт через множество брешей. Поскольку северный фас уже был оставлен, британцы развернули двенадцатифунтовую пушку на левом фланге, открыв огонь по вторгшимся французам. В этот момент Уильям Конолли, капитан 18 Ирландского полка, бросил в контратаку свой последний резерв 80 гренадер и артиллеристов.
В течение получаса войска Дюгоммье не продвинулись ни на шаг, внутри укреплений шел отчаянный рукопашный бой, и судьба форта Мюльграв висела на волоске. Находящийся в форте Балагье неаполитанский бригадный генерал, потеряв 378 человек убитыми, раненными и пропавшими без вести, поколебавшись, решил подождать с поддержкой союзников до рассвета. Наконец в четыре часа утра капитан Конноли и два пьемонтских офицера во главе, выжившей в отчаянном деле, половины семи сотенного гарнизона отошли на расстояние ружейного выстрела от бывшего в руинах редута к форту Эгильетт. Французские потери превысили 1000 человек. В том числе внутри форта, по меньшей мере, около 80 убитых и 200 раненых. Кроме Виктора были ранены де Лаборг и Мюирон, войска республиканцев были полностью дезорганизованы.
Получив сообщение о падении Малого Гибралтара, вице-адмирал Худ тотчас же вызвал Бонапарта на флагманский 'Виктори'.
- Я искренне сожалею, что должен отдать этот приказ, но мужества и профессионализма вам не занимать, капитан. Не предназначенные для обороны против наступающего с суши противника, располагающего пушками, форты Эгильетт и Балагье необходимо держать до последней крайности несмотря ни на что. От вас требуется предоставить возможность подкреплениям, высланным из города, высадиться на берег и отбить Малый Гибралтар, от этого зависит безопасность нашей якорной стоянки и судьба Тулона. Надеюсь, что успех как всегда будет сопутствовать вам.
- Я исполню свой долг до конца, милорд.
- Полагаюсь на это обещание точно так же как на ежедневный восход солнца, желаю удачи и попутного ветра, сэр - лорд Худ.
- Благодарю за доверие ко мне, милорд, - Наполеон твердо пожал протянутую руку.
- Надеюсь увидеть вас снова, - сказал Худ, - выполнив этот приказ, вы можете быть уверены, мистер Бонапарт, что любая разумная просьба будет удовлетворена.
Около 5 часов утра Бонапарт принял команду над наскоро собранным генерал-майором Дандасом отрядом в 350 человек. Переправившись на шлюпках, используя темноту, продолжающий идти дождя и поддержку пары плавучих батарей, капитан трижды конратаковал республиканцев, но имеющихся союзных сил на мысе Кер было явно недостаточно. Британские потери в боях за Малый Гибралтар составили на данный момент 62 морских пехотинцев, 29 матросов и около 150 гренадер 18-го ирландского полка.
Хребет Фарон протянувшийся с востока на запад от города, почти перпендикулярно прорезался глубоким ущельем с рекой Нин, оставляя к северу от Тулона саму давшую название гору, с фортами Сент-Антуан и Фарон на юго-западном и юго-восточном ее склонах. На этом направлении город защищали смешанные силы, 590 неаполитанцев, 490 британцев, 540 французских роялистов и 220 пьемонтцев. Резервом командования союзников были шесть сотен, в основном англичан находящиеся в форту Ла-Мальг.
Почти одновременно с нападением на Малый Гибралтар часть войск генерала Лапойпа начала атаку, поднявшись по крутым и скалистым северным склонам
1800-футовой Мон Фарон. На увеличение естественных препятствий было израсходовано столько труда, что считавшаяся неприступной гора, оборонялась всего четырьмя с половиной сотнями человек. Ни каких уроков из предыдущего французского нападения извлечено не было. Их центральная колонка быстро уничтожила небольшой неаполитанский пикет и остановилась, стремясь закрепить свои позиции. Правая колонна республиканцев достигла незначительных успехов , но в основном действовала как диверсионная. Левая колонна бригадного генерала Андре Массена, 1300 его солдат прибыли из итальянской армии за три дня до штурма, во главе Лапойпом, обошли сильно защищенный редут Круа-Фарон. Войска, продвигаясь вдоль восточного склона горы, вышли к расположенному южнее форту Фарон, вооруженному семью 12-фунтовыми пушками. Защищавшие его союзные войска состояли из 81 британского, 193 неаполитанского и 121 пьемонтских солдат подполковника Фауссоне, погибшего при третьей атаке французов.