На второй день войны Яков пришёл на работу чуть свет. Во-первых, не спалось и, во-вторых, он понимал, что все предприятия перешли в режим военного времени, а это значит, жить придётся на работе. Кузнечные цеха завалены заказами, а сегодня жди уже конкретные военные задания. Ему как мастеру нужно быть готовым к новым непривычным заказам. И ещё он знал, что в рабочих коллективах можно услышать о войне гораздо больше, чем по официальным сводкам. Как говорят в народе: «сарафанное радио» работает оперативно и все сведения более правдивые. И так оказалось на самом деле. Немецкая армия идёт уже по нашей земле, поглощая населённые пункты и города своей мощью и зверскими расправами по отношению к мирным людям. Бомбёжки произошли по многим городам, расположенным недалеко от западных границ.
Яков вернулся домой к полуночи, жена не спала, ждала его.
– Ну что тебе, Катенька, сказать, война долгая и будет очень жестокая. Немец идёт по нашей стране.
Каждый прожитый день война не приносила радостных вестей. Фронтовые сводки ошеломляли людей поражениями в локальных боевых действиях Красной армии. Если в первые часы войны люди думали, что завтра, послезавтра враг будет разбит и наступит победа, то за месяц Орёл почувствовал дыхание войны в лицо. Город готовили к переходу на чисто военное положение. Стали проводить работы по обороне в случае появления немцев на подступах к городу.
Все промышленные предприятия и мастерские перешли на выпуск военной продукции. В цехах работали старики и дети. Рабочий день начинался и заканчивался условно. Практически рабочие жили на предприятиях. Все военные сводки воспринимали болезненно, и каждый осознавал, что если враг не будет остановлен, то окажется на подступах к Орлу в ближайшее время. И это произошло в конце сентября. Начались ожесточённые бои вокруг города. На помощь был выброшен десант, чтобы скоординировать силы орловского гарнизона и придержать большие силы врага на подступах к Орлу. Вся эта операция была рассчитана на выравнивание линии фронта на других участках. После продолжительных боёв со 2-го на 3-е октября 1941 года город Орёл был оккупирован немецкими захватчиками.
До оккупации партийные органы сумели создать сеть подпольной работы против врага. В состав партизанского движения вошёл Новиков Яков. За период оккупации, а это длилось 22 месяца (Орёл был освобождён 5-го августа 1943 года), в области произошло много событий, которые не забыты до сегодняшнего дня из-за жестокости и бесчеловечности по отношению к населению города Орла.
Массовые расстрелы и уничтожение госпиталей с ранеными, и вешание людей на виселицах в центре города. Люди сплачивались вокруг руководителей подпольных организаций и партизанских отрядов. Началась масштабная партизанская война внутри области. Локальными победами над фашистами Красная армия закрепляла в сознании людей, что победа будет за Красной армией. Эта вера позволяла громить врага повсюду. Партизанское движение в области росло с каждым днём. С нетерпением ждали освобождения города от фашистов и всеми методами громили в области врага.
Новиков Яков вынужден был перемещаться по области, чтобы не выдать себя как боевого участника гражданской войны, как партизана. Но самое главное опасение Якова было в том, чтобы через него немцы не могли выйти на след подпольных партизанских отрядов. В городском доме были немцы, и его семье практически жить было негде. Больная Екатерина Васильевна была всегда рядом с мужем. В сельском доме, где остановились у дальних родственников, жили в последние дни перед освобождением города.
Освобождение Орла ощутили по многим признакам. Это активизация подпольщиков против немцев и приближение канонады орудий вокруг города. Немцы проводили против населения жестокие мероприятия, расстреливая людей разного возраста. Последние вздохи немцев были слышны повсюду. В домах, где жили оккупанты, упаковывали чемоданы, значит, вера в победу над Красной армией улетучилась. Каждый немецкий солдат уже думал, как выйти из города живым.
Город был освобождён от немецких захватчиков, и городская площадь приняла всех участников победы по освобождению города Орла. Среди военных были и подпольщики партизанского движения. Новиков Яков пришёл с друзьями по оружию, чтобы чествовать героев-освободителей.
Начались восстановительные работы городского хозяйства и промышленных предприятий. День и ночь шла нелёгкая работа в мастерских кузнечного хозяйства. Многие специалисты ушли с Красной армией громить врага, многие были расстреляны. А часть умерли от голода и холода. Якову предстояла большая работа, чтобы восстановить предприятие и приступить к выполнению партийного задания по выпуску военных изделий для ремонта боевой техники. Каждому рабочему он был рад и если приходили люди из старой гвардии, кто служил с ним и кто был рядом в партизанской борьбе, то радовался вдвойне. Рабочее время шло день и ночь, многие стояли у станков сутками, также и Яков был в их числе.