В результате совместных действий подразделений Министерства обороны и Внутренних войск МВД Российской Федерации, сил милиции, других правоохранительных органов Республики Дагестан и ополченцев было сломлено сопротивление бандитских формирований. Все населенные пункты Цумадинского, Ботлихского, Буйнакского и Новолакского районов перешли под контроль конституционных органов власти. Бандиты, посягнувшие на Дагестан, на жизнь и безопасность наших граждан, уничтожены и отброшены за пределы республики.
Эта победа досталась непростой ценой. Мы с глубокой скорбью склоняем головы перед светлой памятью погибших воинов Российской армии и Внутренних войск, сотрудников милиции, ополченцев, мужественно и до конца исполнивших свой воинский, служебный и гражданский долг. Их имена навсегда останутся в благодарной памяти дагестанцев».
Со 2 августа по 20 сентября 1999 года в боевых действиях на территории Дагестана погибли 275 и ранены 973 военнослужащих федеральных сил. По данным Министерства обороны России, потери армейских подразделений и частей составили 104 человека убитыми, в том числе 24 офицера, 291 военнослужащий получил ранения, среди которых 74 офицера, неопознано 7 тел военнослужащих.
По данным МВД РФ, Внутренние войска и отряды милиции потеряли 171 человека убитыми и 646 ранеными. Кроме того, 15 человек пропали без вести.
Потери чеченских боевиков за это же время составили, по оценкам силовых структур, около 2 тысяч убитыми.
В районе административной границы с Чечней была сконцентрирована группировка федеральных сил численностью около 13 тысяч человек. Основу этой группировки составляли части и подразделения Минобороны России, насчитывавшие до 8 тысяч военнослужащих.
В регионе также сконцентрировалось до 5 тысяч военнослужащих Внутренних войск МВД и сотрудников правоохранительных органов, которым было поручено занять первый рубеж «санитарного кордона» вдоль административной границы с Чечней. По оценке военных, федеральной группировке войск на Северном Кавказе противостояли до 6 тысяч боевиков, отряды которых дислоцировались на территории Чеченской Республики. Согласно разведданым, бандформирование численностью в 2–2,5 тысячи человек, находившееся в Гудермесском районе Чечни, планировало осуществить нападение на дагестанский райцентр Бабаюрт с дальнейшим возможным прорывом к Кизляру, рядом с которым проходит важная в стратегическом плане автотрасса «Кавказ», соединяющая Баку с Ростовом-на-Дону.
Под фактом агрессии на Дагестан была подведена черта, но еще в течение нескольких недель подразделения войсковой группировки обеспечивали стабильность в республике, постепенно передавая свои функции сотрудникам МВД. Войсковые подразделения передислоцировались к административной границе с Чечней во избежание нового прорыва боевиков в Дагестан. А такая опасность была реальной.
20 сентября «непотопляемый» Басаев, которому президент Ичкерии А. Масхадов поручил командование «Восточным фронтом», заявил в Грозном прессе, что будет формировать батальон «шахидов» (шахид — мученик, погибший за веру. — Авт.). В ходе оперативных мероприятий в Дагестане были обнаружены документы, свидетельствующие о долгосрочной помощи оружием, деньгами и наемниками из Афганистана, которую оказал экстремистам Усама бен Ладен. По данным военной разведки, крупные, до 500 человек каждое, бандформирования чеченских экстремистов готовились к новому походу на Дагестан, избрав местом дислокации Наурский район Чечни. Таким образом, вопросы безопасности приобретали особую остроту, и группировке войск, созданной в начале августа генерал-полковником В. Казанцевым, предстояло решать не менее сложные задачи, чем в Цумадинском, Ботлихском и Новолакском районах. Федеральные силы в Дагестане были готовы к разгрому боевиков на территории Чечни. Закалив волю, приобретя бесценный боевой опыт, глубоко веря своему командующему В. Казанцеву и его соратникам, эта сила могла бы преподать урок экстремистам немедленно. Но Казанцев остался верен стратегии, выработанной в Дагестане. Начальный этап: блокирование и нанесение мощных огневых ударов по базам и укрепрайонам противника. И такой удар был нанесен в течение суток 21 сентября в районе Аргунского ущелья, за перевалами Гагатль и Харами. Потеряв только убитыми более ста человек, десятки единиц бронетехники, склады боеприпасов, экстремисты вынуждены были отойти в глубь Чечни.