Наканунѣ Рождества 1584 года, польскій архіепископъ Львова натравилъ своихъ людей на православные храмы и обители, гдѣ стали грубо хватать священниковъ и выволакивать ихъ изъ алтарей, нѣкоторыхъ послѣ освященія Св. Даровъ… Церкви были опечатаны и службы въ нихъ запрещены. Повсюду усиливались судебные поборы съ православныхъ.
Въ 1589 году, при царѣ Ѳеодорѣ Ивановичѣ, по постановленію четырехъ патріарховъ, Московскій митрополитъ Іовъ былъ возведенъ въ Патріархи Московскіе и всея Руси. Католики, разгнѣванные этимъ назначеніемъ, еще усилившимъ престижъ Москвы, не замедлили реагировать. Съ помощью короля, усилился нажимъ на православныя епархіи. Въ Кіевѣ іезуитамъ удалось склонить малодушнаго митрополита Рагозу къ обращенію въ Римъ, чтобы путемъ признанія главенства Папы, то-есть уніи, улучшить положеніе гонимыхъ вѣрующихъ. Туда, тайно отъ паствы, отправились два епископа, торжественно принятые въ Ватиканѣ Папой Климентомъ ѴІІІ-мъ (1592–1605). Папа завѣрилъ ихъ въ своемъ желаніи мира и сказалъ: «Не хочу господствовать надъ вами, но хочу немощи ваши на себѣ носить». Они подписали актъ уніи по-латыни и по-русски, въ честь чего была выбита особая медаль «О возсоединеніи русскихъ».
Узнавъ объ этой измѣнѣ, въ Вильнѣ возмутилась православная паства, обвиняя въ предательствѣ Рагозу и епископовъ. Православное дворянство Литвы, въ началѣ 1596 года, отправило въ Варшаву своихъ делегатовъ, чтобы на Сеймѣ протестовать противъ уніи. Разумѣется, король, другъ іезуитовъ, не согласился на требованія лишенія сана епископовъ-ренегатовъ, а принялъ на себя утвержденіе уніи, что усугубило волненія православныхъ во всей странѣ.
Въ октябрѣ 1596 года въ Брестѣ состоялся соборъ для церковнаго рѣшенія вопроса объ уніи. Православные делегаты оказались въ большинствѣ: несмотря на нажимъ польскихъ властей, унія была отвергнута соборомъ и предатели лишены своихъ епархій. Король, игнорируя соборное постановленіе, поспѣшилъ утвердить унію и съ тѣхъ поръ Православіе было въ Польшѣ объявлено внѣ закона и подвержено гоненіямъ властей, а храмы грабителямъ.
Замѣтимъ, что присутствовавшій на соборѣ экзархъ греческаго Патріарха Никифоръ, былъ схваченъ поляками какъ турецкій шпіонъ и бунтарь и удавленъ въ Маріенбургской крѣпости…
Со смертью царя Ѳеодора Ивановича пресѣклась преемственность Московской монархіи отъ Ивана Калиты и, вплоть до 1613 года, Русь испытала тяжкіе годы Смутнаго времени и польскаго засилія.
Въ 1604 году въ Литву бѣжалъ изъ Москвы нѣкій Гришка Отрепьевъ, вздумавшій выдавать себя за сына Грознаго, царевича Димитрія, будто бы спасшагося отъ царя Бориса Годунова, который былъ избранъ на престолъ послѣ смерти царя Ѳеодора.
Въ Литвѣ, этотъ ловкій авантюристъ принялъ католичество отъ іезуитовъ, придумавшихъ использовать самозванца въ цѣляхъ насильственной акціи противъ Московскаго царства. Имъ удалось убѣдить короля Сигизмунда III-го признать Гришку царевичемъ Димитріемъ и направить на Москву значительное войско.
Воспользовавшись царившими въ столицѣ смутами и измѣной, послѣдовавшихъ по убійствѣ царя Бориса, поляки овладѣли Москвой и въ 1605 году самозванецъ, лже-Димитрій І-й, достигъ трона, несмотря на анаѳему, произнесенную противъ него, какъ еретика, продавшагося Папѣ. Свергнувъ непокорнаго Патріарха Іова, поляки поставили грека Игнатія, признавшаго Гришку. Польша торжествовала, достигнувъ неожиданно исполненія своего завѣтнаго желанія — завладѣть русскимъ Кремлемъ. Женившись на Маринѣ Мнишекъ и вѣнчанный на царство какъ истинный сынъ Ивана Грознаго, Отрепьевъ щедро надѣлилъ семью своей супруги и поляковъ, тѣсно окружившихъ его тронъ. Черезъ своихъ покровителей іезуитовъ, онъ увѣдомилъ Папу Павла Ѵ-го о своей твердой преданности Католичеству. Обрадованный Папа приказалъ своему нунцію поднести Димитрію императорскій титулъ, взамѣнъ обѣщанія добиться отъ своихъ подданныхъ уніи съ Ватиканомъ.
Скоро лже-Димитрій показался народу тѣмъ, кѣмъ онъ былъ на самомъ дѣлѣ. Онъ глумился надъ церковными обрядами, не крестился передъ иконами, не молился до ѣды и всячески унижалъ своихъ подданныхъ. Такъ же вели себя чванные поляки, погруженные въ пьянство и развратъ. Самозванецъ, выгнавъ изъ Арбатскихъ домовъ священниковъ, помѣстилъ въ нихъ своихъ польскихъ друзей. Въ маѣ 1606 года, наконецъ, вспыхнулъ народный бунтъ и лже-Димитрій былъ убитъ.