Кабина самолета «Ягуар-96», не оснащенного системой TIALD. Центральное место на приборной доске занимает круглый индикатор движущейся карты местности ПрНК FIN.1064 (как на «Ягуаре» GR.1A). Фактически существовало три подтипа «Ягуара 96»: «Ягуар-96» ударный, «Ягуар-96» разведывательный и «Ягуар-96» TIALD.
Кабина «Ягуара-96» TIALD, здесь на приборной доске доминирует жидкокристаллический индикатор, па котором отображается «картинка» № обзорно-прицельной системы TIALD. В правой части кабины виден небольшой круглый экран системы предупреждения об электромагнитном облучении «Скай Гуардиан». Установлена новая ручка управления, выполненная по типу ручки управления американского истребителя-бомбардировщика F/ А-18, такие ручки установлены на самолетах «Ягуар» GR.1B, «Ягуара-96» TIALD и «Ягуар-97» (GR.3A).
Программа «Ягуар-96», начатая в феврале 1995 г. предусматривала доработку всего парка самолетов'данного типа, состоявших па вооружении RAF, по стандарту GR. Mk.lB с дополнением в виде аппаратуры засекреченной радиосвязи «Хэв Куик». Все самолеты приводились к единому стандарту в части монтажа бортовой электросети, однако программное обеспечение, позволявшее использовать контейнеры с разведывательной аппаратурой и аппаратуру TIALD ставилось не на все модернизируемые самолеты. Фактически TIALD могли использовать только самолеты, уже прошедшие модернизацию в «неофициальный» вариант GR. Mk.lB. Первый полет доработанный «Ягуар-96» самолет выполнил январе 1996 г., это была машина «ХХ738», проходившая доработку в GR. Mk.lB, но ее сделали демонстратором «Ягуара-96». Первый «официальный» «Ягуар-96» («ЧЧ399») поднялся в небо в сентябре 1996 г. 28 мая 1999 г. модернизированным по программе «Ягуар-96» самолетом было официально присвоено обозначение GR.Mk.3 (T.Mk.4).
Первые семь «Ягуаров-96» поступили в Колтисхэлл в апреле 1997 г., но еще в конце марта пять таких же самолетов прибыло в Джиойя-дель-Колле, откуда они начали летать на Балканы.
Программа «Ягуар-96» рассматривалась в качестве шага на пути к более глубокой модернизационной программе «Ягуар-97». Однако, вслед за «Ягуаром-96» появился не «Ягуар-97», а «Ягуар-96.5» с усовершенствованным программным обеспечением и новой системой планирования и ввода полетного задания. В рамках программы «Ягуар-97» все самолеты получили возможность использовать систему TIALD с новым опто-электронным датчиком, спроектированным на основе головки самонаведения ракеты «Сайдуиндер». В кабинах были установлены новые цветные многофункциональные дисплеи на жидких кристаллах с активными матрицами. В ассортимент подвесного вооружения включены КАБ «Пэйвуэй III» (ранее самолеты с системой TIALD обеспечивали применение только КАБ «Пэйвуэй II») и ракеты воздух-воздух ASRAAM (AIM-120), но реально эти боеприпасы с британских «Ягуаров» никогда не применялись. В демонстратор «Ягуара-97» был конвертирован самолет «XZ399», выполнивший первый после модернизации полет 4 августа 1998 г. первые два «серийных» «Ягуара-97» поступили в Боскомб-Даун для проведения летных испытаний в ноябре 1999 г. Строевые подразделения начали получать «Ягуары-97» в январе 2000 г. То были единственные самолеты RAF, оснащенные нашлемными прицелами.
Поступление на вооружение самолетов модификации GR.Mk.3 А существенно расширило рамки боевого применения «Ягуаров». Ранее эти истребители-бомбардировщики считались дневными, к боевому применению «Ягуаров» ночью готовили очень небольшое количество летчиков, лучших из лучших. В июне 2001 г. 6-я эскадрилья RAF в полном составе была объявлена готовой к боевому применению «Ягуаров» днем и ночью в простых и сложных метеоусловиях. На 41-ю эскадрилью возлагалось выполнение разведывательных заданий, на 54-ю – использование системы TIALD. Все нилоты отрабатывали полеты в темное время суток на предельно малых высотах в очках ночного видения «Омни-3».
Программой «Ягуар-97» модернизация британских «Ягуаров» не закончилась. Обозначение GR.Mk.5 (T.Mk.6) получили «Ягуары» с двигателями «Адур» Мк.106. Напряженные операции «Ягуаров» из состава RAF в 90-е годы привели к быстрому снижению ресурса двигателей. ТРД Мк.104 стали ненадежными и требовали слишком много трудозатрат на поддержание их в работоспособном состоянии. Проблему нехватки мощности двигателей у «Ягуаров» особенно в условиях жары и высокогорья отмечали всегда, но установка ТРД «Адур» Мк.106 не улучшила летно-тактические характеристики самолета. Цель модернизации была иной – сократить затраты на эксплуатацию двигателей. Так расчеты показывали что на поддержание в рабочем состоянии двигателей «Адур» Мк.104 до истечения срока службы парка самолетов потребуется 170 млн. фунтов стерлингов, а в случае переоснащения самолетов двигателями «Адур» Мк.106 – 100 млн фунтов стерлингов при стоимости изготовления двигателей 30 млн. фунтов стерлингов. Экономия – 40 млн. фунтов стерлингов. Кроме того, двигатели «Адур» Мк.104 имели серьезнейший дефект – неравномерное сгорание топлива, в результате чего на стенках сопла и камеры сгорания образовывались раковины и даже прогары. Причем дефект был присущ исключительно ТРД варианта Мк.104, у экспортных Мк.811 его не отмечалось.
«Ягуар S1 Интернешенел» на авиасалоне Фарнборо в 1974 г. рядом с самолетом выложен ассортимент боевой нагрузки и вариант носовой част фюзеляжа с РЛС «Агава». На борту фюзеляжа нанесена эмблема в виде «знака качества» британской промышленности. «S1» близок к французскму «Ягуару А», на самолет нет типичных для британских одноместных «Ягуаров» аппаратуры РЭБ на киле и лазерного далыюмера-целеуказателя в носовой части фюзеляжа.
«Ягуары» в Королевских ВВС Великобритании
Серийные номера «Ягуар В»: XW566 «Ягуар S»: XW560, XW563
«Ягуар» GR.class="underline" XXI08 – XXI22, ХХ817 – ХХ827, ХХ955 – ХХ979, XZ10I – XZ120, XZ355 – XZ378, XZ381 – XZ400 «Ягуар» Тю2: ХХ828 – ХХ847, ХХ915, ХХ916. ZB615 У некоторых самолетов серийные номера менялись в ходе эксплуатации после ремонта или модернизации, выше приведены серийные номера на момент постройки
| эскадрилья | сформирована | расформирована | назначение |
| 2-я | 02.76 | 12.88 | тактическая разведка |
| 6-я | 10.74 | 2007 г. | авиационная поддержка СВ |
| 1.4-я | 04.75 | 10.85 | авиационная поддержка СВ |
| 16-я | 11.91 | 04.2005 | переучивание |
| 17-я | 06.75 | 03.85 | авиационная поддержка СВ |
| 20-я | 03.77 | 06.84 | авиационная поддержка СВ |
| 31-я | 01.76 | 10.84 | авиационная поддержка СВ |
| 41-я | 04.76 | 04.2006 | тактическая разведка |
| 54-я | 03.74 | 04.2005 | авиационная поддержка СВ |
| 226 OCU | 10.74 | переформирована в 16-ю sqn переучивание |