После завершения акта передачи святые мощи на убранной ковром и украшенной цветами машине были доставлены в Александро-Невскую лавру, где уже собрались духовенство и множество народа. Пропев тропарь и кондак преподобному Серафиму, все запели “Ублажаем тя, преподобие отче Серафиме...”. Патриарх на четыре стороны благословил град святого Петра иконой, подаренной директором музея. Вслед за этим, под звон лаврских колоколов и молитвенное пение народа, при всеобщем духовном ликовании святые мощи преподобного Серафима были внесены в Троицкий собор.
И сразу непроизвольно начался благодарственный молебен о возвращении святыни. Было настолько необычно видеть, как Патриарх произносит ектенью, а духовенство с народом поёт. Эта великая духовная радость сплотила и сблизила всех, так что все присутствовавшие в соборе единем и усты и единем сердцем пели благодарение Господу.
В Троицком соборе Александро-Невской лавры святые мощи должны были находиться до дня памяти блаженной Ксении Петербургской (24 января/6 февраля 1991 г.). И всё это время собор был с утра до вечера наполнен народом: люди шли и шли к преподобному»205.
6 февраля для перенесения святых мощей на Московский вокзал прибыл святейший патриарх Алексий II. В 22 часа огромный крестный ход начал свой путь к железнодорожному вокзалу. Почти в полночь состав тронулся под песнопения коленнопреклонённых провожающих, певших: «Ублажаем тя, преподобие отче Серафиме».
Епископ Арсений вспоминал: «В самом поезде, в вагоне, где стояла рака с мощами, без всякой договорённости собрались архиереи и духовенство. Началось чтение акафиста преподобному Серафиму, продолжавшееся всю ночь, до самого прибытия поезда в Москву. Сначала читал Святейший Патриарх, а все присутствующие пели. Затем поочерёдно архиереи и священники...»
Москва встретила святые мощи с не меньшим благоговением, тысячи почитателей преподобного Серафима Саровского заполонили площадь трёх вокзалов. Огромная вереница крестного хода сопровождала мощи до Богоявленского кафедрального собора в Елохове, где мощи находились для поклонения до 23 июля.
23 июля в Богоявленском соборе святейший патриарх Алексий II в сослужении более сорока архипастырей совершил Божественную литургию и в 15 часов 30 минут раку с мощами преподобного обнесли вокруг собора, и многотысячный крестный ход направился к храму во имя Святого Никиты Мученика. Откуда автомобильный кортеж отправился в возрождаемую Дивеевскую обитель.
По пути следования вечером, в 18 часов, автомобильный кортеж прибыл в Ногинск. У въезда в город крестный ход с мощами и святейшего патриарха встречали митрополит Крутицкий и Коломенский Ювеналий, епископ Можайский Григорий, настоятель прихода архимандрит Андриан, руководители города и тысячи горожан. Молебны продолжались всю ночь.
24 июля литургию и молебен у мощей отслужили Святейший Патриарх Московский и всея Руси Алексий II в сослужении архиереев Православной церкви. В 8 часов крестный ход отправился в путь и спустя час прибыл в город Орехово-Зуево. После торжественной встречи раку с мощами отца Серафима пронесли на руках до храма в честь Рождества Богородицы. После Божественной литургии и молебнов крестный ход (уже после 16 часов) отбыл во Владимир.
В 18 часов 30 минут процессия была встречена у древней границы города епископом Владимирским и Суздальским Евлогием, светскими властями и горожанами. Всю ночь рака со святыми мощами стояла в древнем Успенском соборе, и всю ночь и следующие сутки перед мощами совершались молебны с акафистами.
Утром 26 июля после молебна крестный ход отправился далее через Боголюбове и Вязники в Нижний Новгород. Процессию встречал митрополит Нижегородский и Арзамасский Николай, светские власти и горожане. Мощи установили в Спасском кафедральном соборе. Двое суток мощи преподобного находились в столице Поволжья. Всё это время проходили богослужения и поклонения жителей города и гостей. Наиболее торжественной была литургия утром 28 июля, когда святейшему патриарху сослужили 17 иерархов из различных епархий РПЦ.
28 июля в 18 часов крестный ход отбыл из Нижнего Новгорода в Арзамас, в который прибыл спустя два часа. Торжественная встреча православной святыни состоялась на соборной площади перед Воскресенским собором. Под открытым небом прошло богослужение, а в соборе святейший патриарх совершил наречение настоятеля собора архимандрита Иерофея (Соболева) во епископы Балахнинского, викария Нижегородской епархии.
День 29 июля прошёл в торжественных богослужениях и поклонении святым мощам.
30 июля — в здании городской администрации Арзамаса патриарх Алексий II провёл пресс-конференцию. Вопросы были самые различные, начиная с благоустройства Дивеева, обеспечения паломников кровом и питанием до того, что такое воскресение из мёртвых и т. д. В середине дня патриарх посетил место взрыва близ станции Арзамас-1, где 4 июня 1988 г. погиб 91 человек. Здесь он отслужил панихиду.