Операцию входа в гиперпространство обычно называют проколом, в знак прохода через границы "складок". Все путешествие через гиперпространство именуют прыжком (Роберт Хайнлайн "Астронавт Джонс", "Гражданин Галактики", Билл Болдуин цикл романов "Рулевой", Чарлз Стросс "Небо сингулярности"). Реже употребляется термин (фазовый) переход. По мнению Пола Андерсона, сам гиперпрыжок представляет собой серию последовательных квантовых скачков, вызываемых создаваемым вокруг корабля импульсным световым полем ("Мичман Флэндри"). Чтобы макрообъект размером и массой с корабль совершил чисто квантовый скачок, надо сильно постараться, пока это не удается устроить даже для гораздо меньших отдельных микроскопических частиц.
Возможность навигации в гиперпространстве вызывает вполне обоснованные вопросы. Может быть, поэтому некоторые авторы, как Дэвид Вебер в цикле "Хонор Харрингтон", уверяют, что проколы более вероятны в избранных точках космоса. Их называют аномалиями (Роберт Хайнлайн "Астронавт Джонс"), n-пунктами (Дэвид Брин "Небесные просторы"). Они соединяют между собой некоторые фиксированные области обычного пространства, и их можно отыскать, например, по нелинейностям высших порядков (возмущениям времени-пространства). Дэвид Брин считает такие зоны состоящими из нитеподобных сближающихся дефектов пространства-времени, которые представляют собой его смесь с гиперпространством и сохранились с начала инфляции Вселенной. Скачок сводится к искусному последовательному перепрыгиванию корабля с одной нити на другую, пока не будет достигнута нить, выводящая к пункту назначения. Внутри зоны могут одновременно находиться многие другие корабли, идущие по тем же или другим маршрутам, допускается некоторое их маневрирование. Местонахождение и свойства зон перехода остаются стабильными, за исключением определенных моментов перестройки пространства-времени, вызванных разбеганием галактик ("Небесные просторы"). Идея не совсем стыкуется с современными представлениями о свернутом состоянии дополнительных измерений. Согласно другой точке зрения, аномалия может пропускать сразу лишь небольшое число судов, зависящее от их массы, и попытки преодолеть это ограничение приводят к совмещению кораблей с их взрывом либо к столь же катастрофическим столкновениям с границами зон перехода (Дэвид Вебер цикл "Хонор Харрингтон").
Поиск аномалий, пригодных для совершения гиперпрыжков - это дело специальных космических служб. В обнаруженную новую аномалию первыми проходят автоматические корабли-разведчики, а пилотируемые корабли входят в нее только после возвращения таких роботов и анализа собранной ими информации (Роберт Хайнлайн "Астронавт Джонс", Дэвид Вебер "Космическая станция Василиск", "Любой ценой"). Подобная программа действий опирается на предположение, что такие гипотетические пространственно-временные аномалии симметричны относительно прохода кораблей сквозь них в противоположные стороны, а это совсем не очевидно (Боб Шоу "Ночная прогулка", Пол Андерсон "Аватара"). Точно так же не стоит верить тому, что возможные гиперпереходы с использованием подобных аномалий ограничиваются прыжками на десятки и сотни световых лет, лежащими внутри расширяющегося со временем шара освоенных маршрутов (Роберт Хайнлайн "Гражданин Галактики", Айзек Азимов "Основание и Земля", Дэвид Вебер цикл "Хонор Харрингтон"). С тем же успехом они могут забрасывать путешественников в другие галактики (Аластер Рейнольдс "За Разломом Орла").
Роберт Хайнлайн в романе "Туннель в небе" полагал, что можно искусственно формировать открываемые на время гиперпространственные туннели между поверхностью Земли и какой-либо экзопланеты, если оказывать на пространство-время определенное воздействие прямо с Земли. Эти туннели достаточно надежны и безопасны как для обеих планет, так и для почти мгновенной переброски между ними людей, животных и грузов без дополнительной техники. Схожей точки зрения придерживался Дэвид Брин в романе "Война за возвышение", но для устройства подобного туннеля там требовалось построить специальное дорогостоящее сооружение - гипершунт. Искусственные гипертуннели называют также "кротовыми норами" (Чарлз Стросс "Акселерандо") или "червоточинами" (Ричард Макбрайд Аллен "Разбитая Сфера"). Питер Гамильтон проводит различия между путешествиями по "червоточинам" и гиперпрыжками ("Иуда освобожденный"). Чарлз Стросс сомневается, что через "кротовины" можно путешествовать в привычном виде, для этого необходимо трансформироваться в иную форму и восстанавливаться в исходное состояние по прибытии. Зато эти "кротовины" можно создавать и устанавливать в нужных местах ("Акселерандо").У Клиффорда Симака ("Космические инженеры") вход в похожий пространственно-временной туннель создается недалеко от Плутона расположенной на его поверхности транспортной установкой, а выход находится на другой планете и контролируется аналогичной установкой, созданной разумными роботами, обитателями этой планеты. Сбой в движении корабля при этом возможен лишь при вмешательстве постороннего могущественного единого разума нетехнической цивилизации, обитающей в другой звездной системе. Согласно Стивену Бакстеру, подобный туннель будто бы можно извлечь из микроконтинуума и стабилизировать, построив его из сверхплотного вещества с отрицательной энергией, включая конечные порталы. При разрушении одного из порталов туннель превращается в машину времени ("По ту сторону времени"). Автор правильно пишет, что отрицательная энергия вещества неизвестна, но надеется на будущее преодоление этого ограничения. Грегори Бенфорд считал, что гиперкорабль движется через пространственно-временной туннель, сжимая пространство перед собой и растягивая за собой до нормального состояния ("Страхи Академии"). Иэн М. Бэнкс также ставил знак равенства между гиперпространственными путешествиями и деформацией пространства-времени ("Эксцессия"). Путешествия по "червоточинам" могут сочетаться с полетами гиперкораблей (Питер Гамильтон сага о Содружестве).
Многие авторы считают, что корабль с гипердвигателем может совершить прыжок между любыми точками глубокого космоса (Пол Андерсон "Ради славы Вселенной", серии о Торгово-технической лиге и Доминике Флэндри, Роберт Силверберг "Человек в лабиринте", Билл Болдуин серия "Рулевой", Джеймс Уайт серия "Космический госпиталь", Ларри Нивен цикл "Известный космос", Чарлз Стросс "Небо сингулярности"). Чарлз Стросс добавляет к этому требование пространственно-временной эквипотенциальности точек входа и выхода ("Небо сингулярности"). Главное условие - отсутствие достаточно сильных гравитационных полей в этих точках, которые вносят неопределенность в условия прыжка и затрудняют его расчет. Поэтому гиперпространственные (прыжковые) двигатели, как правило, дополняются другими двигателями для полетов в обычном, нормальном пространстве и вблизи небесных тел (Джек Макдевит "Берег бесконечности", Питер Гамильтон "Звезда Пандоры") либо же они могут работать в разных режимах (Чарлз Стросс "Небо сингулярности"). А вот совсем иная точка зрения - прыжок через гиперпространство производится из центра-фокуса специального запускающего ускорителя-сети в форме тетраэдра, образованного в космосе недалеко от обжитой планеты четырьмя опорными кораблями-узлами. Тот же ускоритель-сеть служит для приема кораблей, направленных аналогичным сооружением от другой планеты, что снимает проблему навигации c корабля и перекладывает ее на сети запуска и приема, которые снабжаются мощными компьютерами (Тимоти Зан "Ангелмасса"). Через гиперпространство летают даже полубаллистические экспрессы, следующие по наиболее оживленным маршрутам на Земле (Роберт Хайнлайн "Фрайди"). Более того, согласно Биллу Болдуину и его роману "Защитники", гиперпространство мало чем отличается от обычного четырехмерного, разве только возможностью передвигаться со сверхсветовой скоростью, и при ее достижении корабль автоматически попадает в гипер, так же легко выходя оттуда при снижении скорости ниже световой. Вряд ли вымышленное сверхсветовое перемещение можно вот так уподобить сверхзвуковому полету в атмосфере. У Айзека Азимова гравитационное притяжение в нормальном пространстве сменяется равным по величине отталкиванием в гипере, что дает возможность точно рассчитывать прыжок ("Немезида"). Это эквивалентное отрицательной массе Джеймса Блиша ("Ни железная решетка...") предположение слишком оптимистично, оно не имеет под собой оснований. В романе Боба Шоу "Ночная прогулка" преследуемый настигающей его погоней ослепленный пилот совершает прыжок в нуль-пространство прямо с поля космодрома, правда, вместе с висящей на корабле частью покрытия этого поля.