Начальником штаба «Валли» являлся подполковник Гейнц Шмальшлегер (псевдонимы — «Директор Геллер», «Инженер Доцлер», «Директор Гельмрайх», «Директор Шмидт»), который одновременно возглавлял контрразведывательный отдел «Валли-3».
В соответствии со структурой центрального аппарата Управления «Абвер-заграница» штаб «Валли» имел в своем составе следующие подразделения:
Отдел «Валли-1» — руководство военной и экономической разведкой на советско-германском фронте.
В подчинении «Валли-1» находились разведывательные команды и группы, приданные штабам армейских группировок и армий для ведения разведывательной работы на соответствующих участках фронта, а также команды и группы экономической разведки, проводившие сбор разведданных в лагерях военно-пленных.
Отдел «Валли-2» — руководство абверко-мандами и абвергруппами по проведению диверсионной и террористической работы в частях и в тылу Красной Армии.
Отдел «Валли-3» — руководство всей контрразведывательной деятельностью подчиненных ему абверкоманд и абвергрупп по борьбе с советскими разведчиками, партизанским движением и антифашистским подпольем на оккупированной территории СССР, в зоне фронтовых, армейских, корпусных и дивизионных тылов.
Большой вклад в подготовку первого удара по СССР внес «Абверштелле Кёнигсберг» — резидентура, ориентированная на Белоруссию. Свою деятельность она осуществляла с конца 1938 года, постепенно расширяя масштабы операций. В ее составе эффективно работали такие подразделения разведки, как абвернебенштелле «Инстербург», «Летцен», «Цеханув», «Варшава». С 1940 года в интересах группы армий «Центр» велась подготовка разведчиков и диверсантов в разведшколах «Мишен» (Кёнигсберг), «Каменица» (Польша), «Штеттин» (Польша). Сроки подготовки специалистов варьировались от 3 недель до 6 месяцев. Одновременно проходило обучение 100 — 200 человек. Об активизации разведывательной деятельности на белорусском направлении может свидетельствовать тот факт, что если в 1937 — 1938 годах в числе задержанных на западной границе количество вражеских агентов исчислялось десятками, то за 4-й квартал 1939-го их было задержано 385, в 1940 году — 841, а за 5 месяцев 1941 года — 519.
Основными военными объектами, которые больше всего интересовали германскую разведку в 1939-м — начале 1941 года, являлись штабы армий, корпусов, дивизий и полков, районы их дислокации и перемещения; гарнизоны войск Красной Армии, их численный состав, вооружение, политико-моральное состояние, боеготовность; аэродромы и посадочные площадки, количество, типы и численность авиации; оборонительные сооружения вблизи границы; гарнизоны погранвойск.
В комплекс мероприятий по подготовке действий десантно-диверсионных сил в ходе осуществления плана «Барбаросса» была включена программа тщательной аэрофотосъемки пограничной полосы. С этой целью в октябре 1940 года была сформирована, а с декабря начала секретную работу эскадрилья Ровеля. Один из ее отрядов дислоцировался на озерах Восточной Пруссии и проводил воздушную разведку белорусского района. Другой отряд вел съемки с базы Инстербург и действовал над прибалтийскими государствами. Использовались и другие авиационные части. За период с 28.09.1939 по 22.06.1941 года только пограничниками Белорусского и Украинского округов был зафиксирован 521 случай нарушения границы немецкими самолетами.
Основной поток немецкой агентуры до июня 1941 года шел через сухопутную границу. Воздушный способ доставки использовался в исключительных случаях. Результаты боевой деятельности пограничных отрядов на белорусском направлении в 1940 году показывают, что немецкая разведка активно работала против СССР. Особенно пристальное внимание уделялось направлению Варшава — Белосток.