В IX веке в Италии, в Салерно, возникла медицинская школа – наследница античной медицины, просуществовавшая до середины XIX века. В XII веке Салернская школа стала знаменитым центром научной медицинской мысли всей Европы. Влияние Салернской школы на медицину Средних веков было весьма значительным. Преподаватель школы Арнольд из Виллановы написал известный труд «Салернский кодекс здоровья» в 102 стихах, в которых упоминается о лечебном применении 54 растений.
Непосредственным предшественником «Салернского кодекса здоровья» была медико-ботаническая поэма «О свойствах трав», дошедшая до нас под названием «Масег Floridis», состоящая из 77 глав о 77 лекарственных растениях. Гигиенические, диетические рекомендации «Кодекса», а также данные в ней характеристики лечебных свойств растений во многом соответствуют современным научным представлениям.
Наряду с применением растений народами Древнего Востока лечение растениями широко практиковалось и в странах Восточной Азии: Китае, Индии, Японии, Корее и др.
Достаточно полные данные по истории фитотерапии сохранились в Китае. Представители народной медицины Китая применяли главным образом лекарственные растительные средства.
История китайской медицины, судя по документальным данным, насчитывает 4000 лет, но фактически она появилась значительно раньше. Возникновение медицинской науки в Китае относят к 3216 г. до н. э., когда легендарный император Шень-Нун закончил свой труд по медицине. Основные лекарственные вещества, описанные в этом труде, были растительного происхождения, и он был назван «Бэн-Цао», что означает в переводе на русский язык «Травник». (Все последующие книги о лекарственных растениях в Китае назывались травниками.) В то время в Китае не было письменности, и, по преданию, император излагал сведения в своем труде при помощи прямых и ломаных линий в определенном сочетании. Эта работа не сохранилась до наших дней, о ее существовании известно только по упоминаниям позднейших авторов. Первая китайская книга о лекарственных растениях, в которой приведены описания 900 видов растений, датирована 2500 г. до н. э.
Со времен Галена врачи стремились удалить из растений лишние, индифферентные, балластные вещества и получить очищенные, более действенные во всех случаях, по мнению представителей этого направления, чем все растение. Дальнейшее развитие знаний привело к тенденции выделения из растений индивидуальных, совершенно чистых действующих веществ, обладающих постоянством воздействия и поддающихся более точной дозировке.
Почин в последнем направлении использования лекарственных растений принадлежит швейцарскому врачу и химику Парацельсу (1483–1541), который все явления, происходящие в здоровом и больном организме, сводил к химическим процессам. По его утверждению, человеческий организм представляет собой химическую лабораторию. Болезни, по его мнению, возникают из-за отсутствия в организме некоторых химических веществ, которые при лечении и надо вводить в виде лекарств. Вместе с тем Парацельс широко использовал методы народной медицины. Он считал, что если природа «произвела» болезнь, то она подготовила и средство для исцеления от нее, которое нужно искать в местности, окружающей больного. По этой причине он был против применения иноземных лекарственных растений. Развитие химии привело к осуществлению в XIX веке мечты Парацельса. Из растений были выделены чистые вещества.
Издавна применялось лечение растениями и в Англии. В гербарии (приблизительно 1000 г. н. э.) упоминаются мак, ромашка, укроп, фенхель, полынь. В 1676 г. в связи с ограниченными запасами диких растений обществом аптекарей был организован знаменитый огород лекарственных растений в Челси. Затем подобные огороды создавались и в других местностях Англии.
На британской фармацевтической конференции в 1912 г. было признано необходимым расширить посевы лекарственных растений. Во время Первой мировой войны прекратилась доставка лекарственных средств из Германии, и в Англии потребность на многие лекарственные растения (белладонну, ромашку, укроп, одуванчик, валериану, наперстянку, дурман, аконит и др.) возросла еще больше. В культуру были введены такие дикорастущие лекарственные растения, как пижма, полынь обыкновенная, полынь полевая, чистотел, тысячелистник.