В нижестоящих штабах план был принят с большим энтузиазмом. Контр-адмирал Ямагути, командир 2-й дивизии авианосцев, одно время настаивал на захвате Цейлона, что, по его мнению, позволило бы установить контроль над всем Индийским океаном. Однако после ознакомления с планом операции по захвату о. Мидуэй он стал ярым его сторонником. С самого начала войны Ямагути, занимавший в свое время в Вашингтоне пост военно-морского атташе, был убежден, что при первой же возможности следует вступить в решающее сражение с американским флотом. И поскольку операция против о. Мидуэй преследовала эту же цель, она, естественно, получила полное одобрение с его стороны. Что касается офицеров-летчиков соединения Нагумо, то у них также были все основания приветствовать это предприятие, так как оно давало возможность разгромить американские авианосные силы, в которых они видели своего главного нрага.
Совершенно иным было отношение вице-адмирала Кондо и его штаба. 1 мая командующий 2-м флотом прибыл на борт «Ямато». После краткого обсуждения операций первой фазы Ямамото и Кондо перешли к анализу плана операции по захвату о. Мидуэй. Кондо откровенно высказал свои сомнения в успехе операции. Он особенно подчеркнул то обстоятельство, что нападение на о. Мидуэй будет проводиться без поддержки базовой авиации, в то время как противник имеет возможность использовать не только воздушные силы, базирующиеся на постоянных береговых аэродромах, но и авианосную авиацию, которая не понесла серьезных потерь, В этой связи он считал более благоразумным захват Новой Каледонии, чтобы перерезать коммуникации между Соединенными Штатами и Австралией.
На возражения Кондо адмирал Ямамото ответил, что план операции после тщательного изучения согласован между штабом Объединенного флота и морским генеральным штабом и не может быть изменен. Он добавил, что хотя операция и связана с некоторым риском, но если будет достигнут элемент внезапности, бояться поражения не следует. Тогда вице-адмирал Кондо повернулся к начальнику штаба Объединенного флота контр-адмиралу Угаки и спросил, известно ли штабу флота, как трудно будет обеспечить материально-техническое снабжение о. Мидуэй после его захвата. Кондо утверждал, что до тех пор, пока эта проблема не будет разрешена, захват острова бесцелен. Угаки ответил далеко не лучшим образом. Он заявил, что если снабжение оккупационных сил окажется невозможным, они будут эвакуированы сразу же после того, как уничтожат все военные сооружения. На этом дискуссия закончилась. Было ясно, что штаб Объединенного флота, несмотря на все возражения, не собирался отказываться от своего решения захватить о. Мидуэй.
Возвратившись на свой флагманский корабль, вице-адмирал Кондо передал содержание разговора начальнику штаба контр-адмиралу Сираиси и старшему офицеру штаба капитану 1 ранга Янагидзава. Последний с сожалением заметил, что Ямамото следовало согласиться хотя бы на то, чтобы силы вторжения на о. Мидуэй вышли не с о. Сайпан, а из Трука, что уменьшило бы опасность их преждевременного обнаружения. Позднее, на итоговом обсуждении плана операции, представители 2-го флота настаивали на принятии этого предложения, но безуспешно. Штаб Объединенного флота не был склонен к каким-либо изменениям плана.
В тот самый день, когда вице-адмирал Кондо изложил Ямамото свои опасения по поводу предстоящей операции, штаб Объединенного флота начал четырехдневные военные игры, целью которых была проверка запланированных, а также намечаемых операций второй фазы войны. На этих играх, проходивших на борту «Ямато» под руководством начальника штаба Объединенного флота контр-адмирала Угаки, присутствовало большинство командиров и штабных офицеров тех соединений, которые должны были принять участие в операции по захвату о. Мидуэй.
Игры начались проигрыванием вторжения на о. Мидуэй. Но это было только начало. Со времени военных игр, проведенных в ноябре 1941 года и явившихся репетицией нападения на Пирл-Харбор и операций по захвату южных районов, ни разу не проигрывалось такой большой программы наступательных действий. По предложению штаба Объединенного флота в ходе игры действия развертывались по следующему плану:
1. В первых числах июня главные силы Объединенного флота захватывают о. Мидуэй, а другие соединения флота — западную часть Алеутских островов.
2. После завершения этих операций большая часть линейных кораблей возвращается в Японию, а остальные силы вторжения на о. Мидуэй сосредоточиваются в Труке для пополнения всех видов снабжения и в начале августа начинают операции по захвату стратегических пунктов в Новой Каледонии и на островах Фиджи.